植物生态学：研究植物与环境因子(大气、光、水分等)之间的关系和相互作用；种子植物和孢子植物(菌物、苔藓、地衣等)的种群生态和群落生态；植物-微生物共生生态机理和调控；生物多样性，特别是珍稀濒危植物、菌物和重要资源植物、菌物的生态保护及持续利用。
植物生理生态学：研究抗逆生理特别是抗旱和抗寒的生理机制；植物对全球变化因子及土壤、大气污染等的生理响应；维管植物保持木质部水分传导的有效性和安全性的生理学机制；种间和种内不同生态型间对环境适应性差异的形态、结构、生理基础以及该差异对植物环境适应性的影响；水分传导－光合作用耦联；系统发育分析方法在生理生态学中的应用。
景观生态学：以野外考察、遥感、地理信息系统和全球定位系统(3S)技术为主要手段，研究不同时空尺度景观的空间格局、生态过程与动态变化，建立景观指标体系与空间直观模型，进行区域景观评价与生态安全、区域景观格局变化与全球变化、区域生态规划与生态建设、自然保护区与森林公园的保护与生态旅游研究。
根际生态学: 研究植物根系与土壤界面在调解和控制生态过程中的作用与机制；根土界面在大气-植被-土壤连同体中的功能；根土互作用对环境变化的响应；根系动态对土壤碳氮转化的影响以及微生物群落的调控；土壤生物区系和生化过程对植物生长的反馈。 

环境科学专业 (硕士、博士学位点083001)含区域环境与污染生态、污染防治与环境修复、环境毒理学、环境物理学、环境微界面化学、环境生物修复技术、环境质量与食品安全等七个研究方向。
区域环境与污染生态:研究重点区域土壤风险评价与安全性区划；污染土壤生态修复技术体
系与综合治理；矿山环境修复及伴生资源开发利用；海湾河口沉积物典型重金属环境地球化
学行为；东北老工业基地环境污染特征与时空演变；东北黑土环境安全性及黑土区农业土壤
环境安全基准；辽河流域区域尺度水土环境污染过程与生态建设。
污染防治与环境修复:研究污水处理生物反应器的设计与应用；危险废物的无害化与资源化
利用；河流修复机理及区域尺度设计；污水处理设施长期稳定运行技术；冶金尾液尾渣砷污
染控制；污染土壤的生物及物理化学修复；饮用水安全保障与处理理论及技术。
环境毒理学:研究污染物在淡水生态系统食物链中的积累和转移；不同摄入途径下金属和微
量元素对生物的毒性差别及其分子生物学机制；金属胁迫下水生生物的抗氧化系统和细胞凋
亡因子的应激反应；新型环境污染物药品和个人卫生用品（Pharmaceuticals and Personal Care
Products: 、PPCPs）的分布和毒性研究。
环境物理学:研究污染物在环境系统中的物理过程及物理控制和修复技术，主要研究内容包
括污染物的吸收，迁移与转化，地下水污染控制，多孔反应系统，水循环，土壤不均匀非饱
和流，胶体流体力学，多孔介质多相流体力学等。
环境微界面化学：基于化学、物理学、生物学以及材料科学等研究方法，以现代分析技术及
理论计算化学等手段，从分子、原子、细胞等微观粒子角度认识污染物在固-液-气三相以及
与生物作用的界面行为。主要研究内容包括：新型纳米材料的环境微界面行为、风险及应用；
新兴污染物在环境微界面的迁移转化规律及机理研究；半挥发性有机污染物的区域尺度环境
过程研究及风险评估。
环境生物修复技术:应用传统分子生物学技术并结合现代生物组学手段，研究环境污染物的
微生物降解途径及相关分子生物学机理。主要研究领域包括：地下水体厌氧环境中特征污染
物的生物降解途径与机理；地下水生物修复工程的微生物学基础；降解菌的富集，分离，纯
化与鉴定；功能性降解酶基因的分离与鉴定；设计并应用分子生物标记物追踪与诊断降解菌
种群活性；应用生物组学手段解析微生物群落结构及其生态学功能。
环境质量与食品安全:以农产品产地环境和食品加工环节为研究对象，开展重金属及有机污
染物的检测方法研究、农产品安全风险评估模型和技术研究、食品及环境安全技术指标和产
品及方法标准研究、食品安全质量控制关键技术研究及企业示范。

土壤学专业(硕士、博士学位点090301）含土壤生物化学与环境土壤学、生物地球化学、土壤生态学、土壤植物营养（化学）、等四个研究方向。
土壤生物化学与环境土壤学：研究人类活动与土壤环境演化规律之间相互作用关系，研究生物与受人类干预的土壤环境之间相互作用的机理和规律及其调控途径和措施；从全球变化和土壤资源可持续利用的角度出发，以土壤有机碳、氮的生物化学转化和循环过程为核心，重点研究外源有机物料以及土壤有机质的微生物代谢过程。
生物地球化学(biogeochemistry)：主要研究碳、氮等元素在地球的大气圈、土壤圈、生物圈、岩石圈和水圈之间的循环和交换；研究这些物质循环对植物生产力和全球气候变化的影响，特别是二氧化碳的固存和其他元素（如氮、磷、硫等）对其的影响。
土壤生态学：研究土壤生物间、土壤生物与土壤非生命环境间的相互作用；土壤生物群落与土壤内部环境以及外界环境之间的能量流、物质流和信息流；土壤动物与微生物之间的相互作用；土壤生物对全球变化的响应；土壤生物多样性与生态系统功能的关系；土壤健康与农产品安全生产技术体系。
土壤植物营养（化学）：以东北地区主要土壤为对象，研究土壤作为陆地(森林、农田、草地)生态系统乃至整个生物圈的中心环节，在物质循环和能量流动中的独特作用与功能；不同植物种群及其配置对土壤物质和能量的同化量及据此提出优化植物种群配置；仿自然顶极结构的植物种群配置所需的优化土壤条件及其建立的途径与措施；土壤生态系统平衡地位的保持与提高土壤库的结构特征、构成特点；库容和通量、增大库容和通量的途径与措施；土壤生物学活性在评价土壤肥力、促进物质转化、防止土壤污染和提高化肥肥效中的作用及其有关的应用问题等。

森林培育学专业（硕士学位点090702）含天然林培育与管理、次生林生态系统生态过程与经营、防护林营造与经营管理和人工用材林培育等四个研究方向。