大连理工大学计算机科学与技术学院导师教师信息介绍简介-杨志豪
本站小编 Free考研考试/2020-03-28
基本信息Personal Information
教授
博士生导师
硕士生导师
主要任职：无
性别：男
毕业院校：大连理工大学
学位：博士
在职信息：在职
所在单位：计算机科学与技术学院
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个人简介Personal Profile
杨志豪，男，大连理工大学电气学部计算机科学与技术学院，教授、博士生导师，IEEE高级会员，SCI期刊International Journal of Data Mining and Bioinformatics编委，中国中文信息学会社会媒体处理专委会、信息检索专委会、医疗健康与生物信息处理专委会委员。研究方向为自然语言处理、机器学习（深度学习）、文本挖掘、知识图谱构建及应用。国家十三五重点研发计划“疾病研究精准医学知识库构建”项目子课题“精准医学文本语义关联抽取”负责人。作为主持人获得两项国家自然科学基金面上项目《基于生物医学文献的隐含知识发现方法研究》(2012)、《基于信息抽取技术的蛋白质相互作用网络构建及蛋白质复合物识别研究》(2010)和一项省博士启动基金项目《蛋白质相互作用网络中复合物识别算法研究》(2010)资助。在Bioinformatics（IF 7.307）、Drug Discovery Today（IF 6.369）、PROTEOMICS（IF 4.079）、BMC Bioinformatics（IF 2.435）等国际期刊发表SCI论文50余篇。
2013年入选教育部 “新世纪优秀人才支持计划”。
教育经历Education Background
工作经历Work Experience
2004.32008.6
大连理工大学
计算机科学与技术
博士
1992.91998.7
大连理工大学（双学位）
计算机软件 英语
学士
2000.92003.3
大连理工大学
计算机应用技术
硕士
2014.12至今
大连理工大学
教授
2008.122014.12
大连理工大学
副教授
2002.102008.12
大连理工大学
讲师
1998.72002.10
大连理工大学
助教
研究方向Research Focus
社会兼职Social Affiliations
文本挖掘
机器学习（深度学习）
自然语言处理
知识图谱构建及其应用（问答系统、知识发现推理）
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研究领域
生物医学文献作为成果展示和学术交流的主要方式之一，其数目之大，增长速度之快远远超过了其他学科领域。如现代生物医学研究发展和高价值文献存储的代表资源MEDLINE，已收录生物医学文摘2900万篇以上。面对如此大规模的、快速增长的科学文献数据，采用文本挖掘技术从中有效的提取生物医学知识的需求变得非常迫切。本人将自然语言处理技术和机器学习方法应用于生物医学领域，进行生物医学文本挖掘研究。具体研究方向包括基于深度学习的的生物实体识别、实体关系抽取、生物医学知识图谱的构建以及基于知识图谱的生物医学问答系统构建。
科研项目
疾病研究精准医学知识库构建, 科技部重大专项, 2016/06/24, 进行
2013年度教育部新世纪优秀人才支持计划, 主管部门科技项目, 2013/10/08-2017/04/13, 完成
基于文献的蛋白质交互关系抽取关键技术及其在肺癌早期诊断中的应用研究, 省、市、自治区科技项目, 2009/01/01-2012/11/21, 完成
基于生物医学文献的隐含知识发现方法研究, 国家自然科学基金项目, 2012/09/25-2016/12/31, 完成
基于信息抽取技术的蛋白质相互作用网络构建及蛋白质复合物识别研究, 国家自然科学基金项目, 2010/09/25-2013/12/31, 完成
联合申请2015年国家科技支撑计划项目“面向电子制造装备的可编程控制器研发与应用, 国家科技部 , 2014/03/08, 完成
论文成果 More>>
Diao, Yufeng,Lin, Hongfei,Yang, Liang,Fan, Xiaochao,Wu, Di,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Xu, Kan.FBSN: A hybrid fine-grained neural network for biomedical event trigger identification[J],NEUROCOMPUTING,2020,381:105-112
Luo Ling,Yang Zhihao,Cao Mingyu,Wang Lei,Zhang Yin,Lin Hongfei.A neural network-based joint learning approach for biomedical entity and relation extraction from biomedical literature[J],Journal of biomedical informatics,2020,103:103384
Shen, Chen,Lin, Hongfei,Guo, Kai,Xu, Kan,Yang, Zhihao,Wang, Jian.Detecting adverse drug reactions from social media based on multi-channel convolutional neural networks[J],NEURAL COMPUTING & APPLICATIONS,2019,31(9,SI):4799-4808
Shen, Chen,Lin, Hongfei,Fan, Xiaochao,Chu, Yonghe,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Zhang, Shaowu.Biomedical event trigger detection with convolutional highway neural network and extreme learning machine[J],APPLIED SOFT COMPUTING,2019,84
曹明宇,李青青,杨志豪,王磊,张音,林鸿飞,王健.基于知识图谱的原发性肝癌知识问答系统[J],中文信息学报,2019,33(6):88-93
曹明宇,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健.基于神经网络的药物实体与关系联合抽取[J],计算机研究与发展,2019,56(7):1432-1440
技术展示
?生物医学文本实体识别和关系抽取系统
生物医学文本中蛋白质交互关系抽取
专利
一种基于节点向量的蛋白质复合物识别方法
一种基于排序学习算法的生物医学文献检索方法
一种基于特征自动学习的生物医学事件触发词识别方法
著作成果
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生物医学文献作为成果展示和学术交流的主要方式之一，其数目之大，增长速度之快远远超过了其他学科领域。如现代生物医学研究发展和高价值文献存储的代表资源MEDLINE，已收录生物医学文摘2900万篇以上。面对如此大规模的、快速增长的科学文献数据，采用文本挖掘技术从中有效的提取生物医学知识的需求变得非常迫切。本人将自然语言处理技术和机器学习方法应用于生物医学领域，进行生物医学文本挖掘研究。具体研究方向包括基于深度学习的的生物实体识别、实体关系抽取、生物医学知识图谱的构建以及基于知识图谱的生物医学问答系统构建。
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科研项目
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疾病研究精准医学知识库构建, 国家重点研发计划, 2016/06/24, 进行
2013年度教育部新世纪优秀人才支持计划, 教育部新世纪优秀人才支持计划项目, 2013/10/08-2017/04/13, 完成
基于文献的蛋白质交互关系抽取关键技术及其在肺癌早期诊断中的应用研究, 辽宁省博士科研启动基金, 2009/01/01-2012/11/21, 完成
基于生物医学文献的隐含知识发现方法研究, 国家自然科学基金, 2012/09/25-2016/12/31, 完成
基于信息抽取技术的蛋白质相互作用网络构建及蛋白质复合物识别研究, 国家自然科学基金, 2010/09/25-2013/12/31, 完成
联合申请2015年国家科技支撑计划项目“面向电子制造装备的可编程控制器研发与应用, 国家科技支撑计划项目, 2014/03/08, 完成
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论文成果
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[1]Diao, Yufeng,Lin, Hongfei,Yang, Liang,Fan, Xiaochao,Wu, Di,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Xu, Kan.FBSN: A hybrid fine-grained neural network for biomedical event trigger identification[J],NEUROCOMPUTING,2020,381:105-112
[2]Luo Ling,Yang Zhihao,Cao Mingyu,Wang Lei,Zhang Yin,Lin Hongfei.A neural network-based joint learning approach for biomedical entity and relation extraction from biomedical literature[J],Journal of biomedical informatics,2020,103:103384
[3]Shen, Chen,Lin, Hongfei,Guo, Kai,Xu, Kan,Yang, Zhihao,Wang, Jian.Detecting adverse drug reactions from social media based on multi-channel convolutional neural networks[J],NEURAL COMPUTING & APPLICATIONS,2019,31(9,SI):4799-4808
[4]Shen, Chen,Lin, Hongfei,Fan, Xiaochao,Chu, Yonghe,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Zhang, Shaowu.Biomedical event trigger detection with convolutional highway neural network and extreme learning machine[J],APPLIED SOFT COMPUTING,2019,84
[5]曹明宇,李青青,杨志豪,王磊,张音,林鸿飞,王健.基于知识图谱的原发性肝癌知识问答系统[J],中文信息学报,2019,33(6):88-93
[6]曹明宇,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健.基于神经网络的药物实体与关系联合抽取[J],计算机研究与发展,2019,56(7):1432-1440
[7]李青青,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健.基于多任务学习的生物医学实体关系抽取[J],中文信息学报,2019,33(8):84-92
[8]Zhang, Yijia,Lin, Hongfei,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Sun, Yuanyuan,Xu, Bo,Zhao, Zhehuan.Neural network-based approaches for biomedical relation classification: A review[J],Journal of Biomedical Informatics,2019,99:103294
[9]Zhao, Di,Wang, Jian,Lin, Hongfei,Yang, Zhihao,Zhang, Yijia.Extracting drug Cdrug interactions with hybrid bidirectional gated recurrent unit and graph convolutional network[J],Journal of Biomedical Informatics,2019,99:103295
[10]Zhang, Tongxuan,Lin, Hongfei,Ren, Yuqi,Yang, Liang,Xu, Bo,Yang, Zhihao,Wang, Jian,Zhang, Yijia.Adverse drug reaction detection via a multihop self-attention mechanism[J],BMC BIOINFORMATICS,2019,20(1):479
[11]Liu, Xiaoxia,Yang, Zhihao,Sang, Shengtian,Lin, Hongfei,Wang, Jian,Xu, Bo.Detection of protein complexes from multiple protein interaction networks using graph embedding[J],ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE,2019,96(,SI):107-115
[12]冯靖焜,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健.基于多示例学习的化学物致病关系抽取[J],山西大学学报(自然科学版),2019,01:59-68
[13]Sang, Shengtian,Yang, Zhihao,Liu, Xiaoxia,Wang, Lei,Lin, Hongfei,Wang, Jian,Dumontier, Michel.GrEDeL: A Knowledge Graph Embedding Based Method for Drug Discovery From Biomedical Literatures[J],IEEE ACCESS,2019,7:8404-8415
[14]Luo, Ling,Yang, Zhihao,Yang, Pei,Zhang, Yin,Wang, Lei,Wang, Jian,Lin, Hongfei.A neural network approach to chemical and gene/protein entity recognition in patents[J],JOURNAL OF CHEMINFORMATICS,2018,10(1):65
[15]Xu, Bo,Lin, Hongfei,Lin, Yuan,Ma, Yunlong,Yang, Liang,Wang, Jian,Yang, Zhihao.Improve Biomedical Information Retrieval Using Modified Learning to Rank Methods[J],IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS,2018,15(6):1797-1809
[16]Liu, Xiaoxia,Yang, Zhihao,Sang, Shengtian,Zhou, Ziwei,Wang, Lei,Zhang, Yin,Lin, Hongfei,Wang, Jian,Xu, Bo.Identifying protein complexes based on node embeddings obtained from protein-protein interaction networks[J],BMC BIOINFORMATICS,2018,19(1):332
[17]Luo, Ling,Yang, Zhihao,Lin, Hongfei,Wang, Jian.Document triage for identifying protein-protein interactions affected by mutations: a neural network ensemble approach[J],DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION,2018,2018
[18]杨培,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健.基于注意机制的化学药物命名实体识别[J],计算机研究与发展,2018,55(7):1548-1556
[19]赵哲焕,杨志豪,孙聪,林鸿飞.生物医学文献中的蛋白质关系抽取研究[J],中文信息学报,2018,32(7):82-90
[20]Liu, Xiaoxia,Yang, Zhihao,Zhou, Ziwei,Sun, Yuanyuan,Lin, Hongfei,Wang, Jian,Xu, Bo.The impact of protein interaction networks' characteristics on computational complex detection methods[J],JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY,2018,439:141-151
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?生物医学文本实体识别和关系抽取系统
生物医学文本中蛋白质交互关系抽取
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一种基于节点向量的蛋白质复合物识别方法
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操作系统 /2019-2020 /春学期 /56课时 /3.5学分 /**
操作系统 /2019-2020 /春学期 /56课时 /3.5学分 /**
高级操作系统 /2019-2020 /秋学期 /2.0学分 /**
高级操作系统 /2019-2020 /秋学期 /2.0学分 /**
高级操作系统 /2019-2020 /秋学期 /32课时 /2.0学分 /**
操作系统 /2018-2019 /春学期 /56课时 /3.5学分 /**
教学资源
高级操作系统课程
本科操作系统课程
教学成果
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本科生课程
课程名称学年学期学时学分课程号 操作系统 2019-2020 春学期 56 3.5 ** 操作系统 2019-2020 春学期 56 3.5 ** 高级操作系统 2019-2020 秋学期 - 2 ** 高级操作系统 2019-2020 秋学期 - 2 ** 操作系统 2018-2019 春学期 56 3.5 ** 操作系统 2017-2018 春学期 52 3 ** 操作系统 2017-2018 春学期 52 3 ** 操作系统 2017-2018 春学期 56 3.5 **
研究生课程
课程名称学年学期学时学分课程号 高级操作系统 2019-2020 秋学期 32 2 ** 高级操作系统 2018-2019 秋学期 32 2 ** 高级操作系统 2017-2018 秋学期 32 2 **
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高级操作系统课程
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学术荣誉
教育部"新世纪优秀人才支持计划"入选者
科研奖励
辽宁省自然科学三等奖
其他奖励
教学质量优良奖 （2012年）
教学质量优良奖 （2010年）
本科优秀毕业设计指导教师 （2010年）
