姓 名
吴宏杰
性 别
男
出生年月
1977.11
最高学历、学位
博士
职 称
教授
职 务
电子邮箱
Hongjie.wu@qq.com
个人简介
一、基本情况:
2013年苏州大学计算机科技与技术毕业,获工学博士学位。现任苏州科技学院电子与信息工程学院教授、硕士生导师。2013年(University of Colorado, 2017年US.News世界大学排名32),2015年两次访学(University of Michigan,2017年US.News世界大学排名17)。获江苏省“六大人才高峰”、江苏省“333”骨干教师,“苏州市计算机优秀青年人才”,“校优秀青年骨干教师”称号。担任中国计算机学会会员,YOCSEF AC委员,国际期刊《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB)》、《Plos One》审稿人,会议International Conference on Intelligent Computing、International Conference on Intelligence Science and Big Data Engineering 委员。
二、主要研究领域及学术成就:
在《中国科学:信息科学》和《计算机学报》等国内外重要期刊上发表论文20篇;先后主持了国家自然基金2项、住建部、江苏省自然(面上)、江苏省重点实验室开放基金、院基金等科研项目10余项,作为主要成员参加 “863”高新技术项目2项,国家自然科学基金2项,美国NIH项目1项,国家重点实验室基金项目1项、建设部项目3项,完成面向企业的移动应用等横向课题10多项,累积经费500多万元,并获苏州市科技进步奖。
指导学生参加挑战杯、全国软件专业人才设计与创业大赛、全国高校云计算应用创新大赛、江苏省大学生程序设计大赛等竞赛,学生获奖20余次。毕业的学生或进入国内外著名高校继续深造,或就职于甲骨文(苏州)有限公司、同程网、华为、宏智科技(苏州)有限公司、苏州郎拓软件有限公司等知名企业。
三、代表性科研成果:
[1] Hongjie Wu, Kun Wang, Liyao Lu, Qiang Lyu, Min Jiang,A Deep Conditional Random Field Approach to Transmembrane Topology Prediction and Application to GPCR Three-Dimensional Structure Modeling, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2016: publish online http://doi.ieeecomputersociety.org/10.1109/TCBB.2016.**
[2] Hongjie Wu, Chengyuan CAO, Xiaoyan XIA, Qiang Lü, Unified Deep Learning Architecture for Modeling Biology Sequence, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(SCI), 2017: Accept
[3] Hongjie Wu, Haiou Li, Min Jiang, Cheng Chen, Qiang Lv, and Chuang Wu, “Identify High-Quality Protein Structural Models by Enhanced -Means,” BioMed Research International, vol. 2017, Article ID **, 9 pages, 2017. doi:10.1155/2017/**
[4] Hongjie Wu, Chuang Wu, Chen Cheng, Longfei Song, and Min Jiang ,A Parallel Multiple K-Means Clustering and Application on Detect Near Native Model, Intelligent Computing Theories and Application. Springer International Publishing, 2016.
[5] Wang K, Wu H, Lu W, et al. Predicting Helix Boundaries of α-Helix Transmembrane Protein with Feedback Conditional Random Fields[M]//Intelligent Computing Theories and Methodologies. Lecture Notes in Computer Science, vol. 9225 ,pp 730-736, 2015
[6] Lu W, Fu B, Wu H, et al. CRF-TM: A Conditional Random Field Method for Predicting Transmembrane Topology[M]//Intelligence Science and Big Data Engineering. Big Data and Machine Learning Techniques. Lecture Notes in Computer Science ,Volume 9243 , pp 529-537, 2015.
[7] 吴宏杰,吕强,权丽君,陈荣,陈沙沙,李海鸥,钱培德.GPCR跨膜螺旋的结构拓扑建模及其预测方法.计算机学报,2013 ,10:2168—2178(2013年度中国计算机大会评出的两篇优秀论文之一, 145篇录用,其中优秀2篇)
[8] 吴宏杰,吕强,吴进珍,黄旭,罗小虎,钱培德.从头预测蛋白质骨架的一种并行蚁群方法及其在CASP8/9中应用.中国科学 F辑:信息科学,2012, 42(8 ): 1034–1048
[9] Hongjie Wu, Qiang Lü, Quan Lijun, Peide Qian,PatGPCR: A Multitemplate Approach for improving 3D Structure Prediction of Transmembrane Helices of G-protein-coupled Receptors, Computational & Mathematical Methods in Medicine, 2013, 2013(1):151-164
[10] Hongjie Wu, Qiang Lü, Lingyun Yang, Zhonglan Luan,Peide Qian,Xiaoyan Xia ,CoREF: A Combined Refinement Approach for GPCRs Backbone Flexibility, Biomedical Engineering :Applications, Basis and Communications, Volume 25, Issue 06, December 2013,SCI
[11] 吴宏杰,吕强, 唐剑峰,钱培德.一种序列相关支持向量机的β桶状跨膜蛋白预测方法.计算机科学2012,39(8):252-255
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