“第三届微生物生态与生物信息技术研讨会”第二轮通知

第三届微生物生态与生物信息技术研讨会
第二轮通知
（南京，2016年7月12日- 15日）

主办单位：中国科学院南京土壤研究所



承办单位：中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室



尊敬的女士/先生：

兹定于2016年7月12-15日在中国科学院南京土壤研究所举办 “第三届微生物生态与生物信息技术研讨会”。微生物生态研讨会将由国内外知名专家在土壤微生物多样性及其功能；植物与微生物相互作用；微生物对外界环境的响应和土壤微生物宏基因组等方面进行专题讲座。会议报告后将进行“生物信息分析培训”，主要内容如下：

1.QIIME和mothur软件的使用及高通量数据分析

?QIIME软件的安装，mothur简介；

?高通量数据的质量控制；

?OTU聚类、序列比对、进化树和network的构建，α、β多样性的计算；

?Principal Coordinate Analysis（PCoA）和UPGMA聚类分析。

2. Illumina Miseq测序的生物信息分析：包括如何使用QIIME、Mothur 进行数据处理以及在分析中应注意的问题，如何使用R, SPSS, Sigmaplot 和 Origin其他分析软件进行分析统计及制图-PCA、RDA、DCA、CCA、NMDS、CLUSTER、MNTD等。

3. 16S 功能预测软件picrust的使用。

4. 统计分析软件R的使用

?R软件概述，数据包安装，数据管理;

?R在生物信息分析中的应用，常用分析方法CCA、NMDS、聚类与回归分析等。

?R语言绘图，包括气泡图，PCA图，structure堆叠图，韦恩图，三维PCA图，等高线图，散点图矩阵。

会议日程：

Microbial Ecology Workshop

（July 13-14, 2016）

Bioinformatic Analysis Training

（July 14-15, 2016）

Place: Lecture Hall at 4th floor of Hui-Lian complex, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences (CAS) 地点：中国科学院南京土壤研究所惠联大楼四楼礼堂
July 13 (morning), 2016
9:00 – 9:10	Welcome address, Direct General of Institute of Soil Science, CAS Chair：Haiyan Chu, Institute of Soil Science, CAS 褚海燕，中国科学院南京土壤研究所
Keynote Speech (9:10-9:55) Chair: Yongguan Zhu, Institute of Urban Environment, CAS 朱永官，中国科学院城市环境研究所
9:10 – 9:55	From the Human Microbiome Project to the Earth Microbiome Project: integrating human and environmental microbial ecology Rob Knight, University of California at San Diego
9:55 – 10:25	Group photo & Tea time 所有与会人员在实验大楼门口合影
Keynote Speech (10:25-11:55) Chair: Jizhong (Jeo) Zhou, University of Oklahoma
10:25 – 11:10	Invisible Influence: the microbiome of our soils, plants and homes Jack Gilbert, University of Chicago and Argonne National Laboratory
11:10 – 11:55	Fromgenestobiogeochemistry:arsenicasanexample Yongguan Zhu, Institute of Urban Environment, CAS 朱永官，中国科学院城市环境研究所
11:55 – 14:00	Lunch Time
July 13 (afternoon), 2016
Keynote Speech (14:00-16:00) Chair: Rob Knight, University of California at San Diego
14:00 – 14:40	Microbial Feedbacks Mediates Vulnerability of Permafrost Carbon to Climate Warming Jizhong (Jeo) Zhou, University of Oklahoma
14:40 – 15:20	Extreme environments spearheading metagenomics Rup Lal, University of Delhi
15:20 – 16:00	Plant-microbial interactions across human land use gradients Krista McGuire, Columbia University
16:00 – 16:20	Tea time
Invited speech (16:20-17:40) Chair: Jack Gilbert, University of Chicago and Argonne National Laboratory
16:20 – 16:40	Association networks: the Chicago aquarium and soil microbiomes Cesar Cardona, University of Chicago
16:40 – 17:00	Maintenance mechanism of ectomycorrhizal fungal diversity in subtropical forest ecosystem Liangdong Guo, Institute of Microbiology, CAS 郭良栋，中国科学院微生物研究所
17:00 – 17:20	Bacteriophage diversity and distribution in paddy fields estimated by several biomarker genes Guanghua Wang, Northeast Institute of Geography and Agroecology, CAS 王光华，中国科学院东北地理与农业生态研究所
17:20 – 17:40	Soil bacterial biogeography in wheat land of North China plain Haiyan Chu, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences 褚海燕，中国科学院南京土壤研究所
July 14 (morning), 2016
Invited speech (9:00-10:20) Chair：Rup Lal, University of Delhi
9:00– 9:20	Approaches to metabolic modeling of environmental microbial communities Pamela Weisenhorn, University of Chicago
9:20 – 9:40	Microbiome Signatures of Human Diseases Zhenjiang (Zech) Xu, University of California at San Diego
9:40 – 10:00	The Cantonese Microbiome Project Hongwei Zhou, Southern Medical University 周宏伟，南方医科大学
10:00 – 10:20	Mining the microbial dark matter from extreme environments Wenjun Li, Zhongshan University 李文均，中山大学
10:20 – 10:40	Tea time
Invited speech (10:40-12:00) Chair： Krista McGuire, Columbia University
10:40– 11:00	Ecological strategies of bacteria: a perspective metagenomes of culture microcosms Jonathan Adams, Seoul National University
11:00 – 11:20	Microbial communities and their roles in carbon cycling in Qinghai-Tibetan lakes Hongchen Jiang, China University of Geosciences 蒋宏忱，中国地质大学（武汉）
11:20 – 11:40	Assessing soil nitrogen cycle microbes through high-throughput functional genes analysis Binbin Liu, InstituteofGeneticsandDevelopmentalBiology, CAS 刘彬彬，中国科学院遗传发育研究所
11:40 – 12:00	The antibiotic resistome of swine manure is significantly altered by association with Musca domestica larvae gut microbiome Zhijian Zhang, Zhejiang University 张志剑, 浙江大学
July 14 (Afternoon)-July 15, 2016 Bioinformatic Analysis Training

注意事项：会议及培训日程材料将在注册现场进行发放，大家可携带自己的笔记本电脑，培训操作课程中涉及到数据分析与软件使用，希望学员届时能自己操作。

会议报名截止日期：2016年7月9日

会议联系人：

张考萍 手机13814001574 邮箱microbioinfo@126.com

时 玉 手机18761856785

会议报到时间： 2016年7月12日 上午9:00-晚上10:00

入住地点：世纪缘大酒店（12日起入住，已预订）

会议及培训时间：2016年7月12日-7月15日

会议注册：注册费用 2000元/人， 学生1200元/人 （注册费现场现金收取或银行转账）。提供午餐、晚餐。注册会员每人发放会议手册一本。

银行转账汇款信息：

账 户 名：中国科学院南京土壤研究所

　　银行账号：4301010809001045180

　　开户银行：中国工商银行南京成贤街支行

　　（汇款时请在备注栏注 “2016微生态+姓名”，如多人同时汇款，请标注人数））

交通路线指南：

宾馆地点：南京市北京东路世纪缘大酒店（南京市北京东路77-1号）

注册地点：世纪缘大酒店一楼大厅

培训地点：南京市北京东路73号中国科学院南京土壤研究所

您可以选择以下交通方式到达：

1. 南京火车站à 打车至北京东路世纪缘大酒店车费约15元；

或南京火车站东广场公交站台乘坐44路至北京东路站下车往回走步行200米至入住地点

2. 南京火车站南站乘坐地铁3号线 à 到鸡鸣寺站 à 4号口北京东路方向出步行约10分钟到世纪缘大酒店（打的费用约30元）

3. 南京禄口机场乘坐机场大巴（通往火车站方向）à火车站下车à到火车站东广场公交站台转乘44路或打车到北京东路站（打的费用约120元）。

4. 南京禄口机场乘地铁s1号线(禄口机场上,南京南站下,7站)，换地铁3号线(鸡鸣寺4口出,10站)，步行约10分钟到世纪缘大酒店。

5. 南京土壤研究所与世纪缘酒店位置（如图）