学校由玄武门校区、燕子矶校区和镇江校区三部分组成。玄武门校区坐落在风景如画的玄武湖畔，校园内花木扶疏，绿草如茵；燕子矶校区位于北临万里长江的燕子矶脚下，校园内依山建房，错落有致，药草满园，风景秀丽，颇具园林建筑风格；镇江校区坐落在历史文化名城镇江的东部文化教育区。
学校下设药学院、中药学院、生物制药学院、国际医药商学院、高等职业技术学院、成人教育学院、基础部、社会科学部、体育部、外语系等10个院、部、系及6个研究所、7个研究中心。随着高等教育改革的不断深入，学校积极顺应知识经济时代高科技快速发展的趋势以及满足人们对医药保健日益增长的要求，在传统药学专业的基础上，拓宽专业口径，增设新兴专业，现有14个本科专业（药学、基础药学理科基地班、药物制剂、制药工程、国家生命科学与技术基地班、生物技术、生物工程、中药学、中药资源与开发、英语、国际经济与贸易〈医药方向〉、工商管理〈医药方向〉、信息管理与信息系统、市场营销），4个专科（高职）专业（药学、药物制剂、中药学〈中药制剂方向〉、国际经济与贸易〈医药方向〉），其中专科（高职）专业中的药物制剂专业已被教育部列入“部级高职高专教育专业教学改革试点”。学校现有21个博士点、22个硕士点，6个专业的药学学科可招收博士后研究人员。学校是教育部指定接受药学学科外国来华留学生、进修生和高级访问学者的唯一基地，也是教育部批准可以接受华侨、港澳地区及台湾省学生的定点院校之一。
学校占地面积约54万平方米，建筑面积近30万平方米。图书馆建筑面积2万多平方米，藏书70多万册，馆藏中外文期刊5000余种。学校现有各类在校生近18000人，其中研究生1000余人，全日制本专科生6600余人，成人学历教育生10000余人，教职工1500余人。
学校拥有3个国家重点学科——药物化学、生药学、药剂学，1个省级重中之重学科——现代中药与天然药物学，并建有国家酶工程技术工业性试验基地和国家科技部新药筛选重点实验室——新中新药筛选中心。
经教育部批准学校建立了“国家理科基础科学研究与教学人才培养基地基础药学专业点”和“国家生命科学与技术人才培养基地”。学校与南京大学合办的生物技术（生化药学强化班）已经连续10年招生，培养出了大批的高素质人才。根据国家对基地班的人才培养要求，学校精心组织教学，同时引进竞争机制，实行滚动分流的培养方式，60%左右品学兼优者将被推荐免试攻读硕士研究生或硕博连读。
中国药科大学高度重视就业指导工作，积极拓宽就业渠道。随着社会的发展和生活水平的提高，人民对医药保健的要求也越来越高。医药行业已成为新的经济增长点，制药产业被称为“朝阳产业”，社会对药学专业人才的需求量不断增加。在长期的办学实践中，注重基础和内涵建设，强化学生的素质教育，学校形成了“严谨、求实、团结、创新”的优良校风和学风。培养的学生由于基础扎实、知识面广、综合素质好，深受社会和用人单位的欢迎和好评，毕业生一直供不应求。学校每年都精心策划和组织大型招聘会，有数百家医药单位到学校进行人才招聘，当场签约率60%以上，其余毕业生大多达成就业意向。2002届本科生就业率为99.89％，专科、研究生就业率为100％，名列江苏省高校就业率的榜首，是教育部直属高校就业率最高的院校之一。
学校师资力量雄厚，现有中国科学院院士1人，中国工程院院士1人，专任教师530人，有专兼职从事科研和开发的人员800多人，其中具有高级职称的约占40%.学校现有70余人分别担任了国务院学位委员会学科评议组成员、国家自然科学奖评委、国家科技进步奖评委、卫生部医药科学委员会药学专题委员会委员、中国药典委员会委员、国际和国内学术团体的领导、国家新药评审委员会委员以及全国性、国际性期刊杂志的正副主编，在国内外享有较高声誉。至2003年，学校共有56人享受国家政府特殊津贴。
学校在完成各层次教学任务的同时，还承担了国家重点科研和攻关项目近70余项，国家自然科学基金科研项目、国家新药研究基金科研项目以及国家、省、市下达的科研任务300多项，不少项目达到国际先进水平，许多项目填补了国内空白。学校先后获得省、部级以上奖励的科技成果有55项，其中由中国科学院院士徐国钧教授主持的“常用中药材品种整理和质量研究”荣获国家科技进步一等奖。“九五”以来已获得国家卫生部颁发的新药证书70多本，一类新药证书10余本，专利70多项，同时涌现出一批具有较高水平的科研成果。
中国药科大学正在寻求教育、科技主动适应社会主义市场经济的机制，目前已与国内许多大型医药企业建立长期合作的关系。学校依靠自身的人才、技术优势，先后兴办了高科技企业11个，成立了中国药科大学科技实业（集团）总公司。学校积极开展横向联合，多方位与企业进行合作，有重点地开展高新技术开发。近年来，由科技开发转化生产的科技项目多达100余项，一大批科研成果已转化为生产力，在促进医药工业发展过程中发挥了重要作用。
在国际学术交流方面，中国药科大学先后与日本、美国、英国、意大利、澳大利亚、香港等多个国家和地区的23所学校签订了校际学术交流协议，还同罗马尼亚、南斯拉夫、瑞典、加拿大、香港、澳门等30多个国家和地区的多所院校及科研机构有学术上的联系。
中国药科大学是一所历史悠久而又充满活力的学校，目前正积极探索高等药学教育、教学改革，努力在教育质量、科学研究和管理水平上能够成为跻身于世界先进行列的多科性大学。
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