性 别: 男出生日期: 1969.10.17部 门: 信息系职 务: 职 称: 学历专业: 博士研究生毕业,计算机应用技术联系电话: Email: xieminzhu@sina.com个人主页:
个人简介:
湖南涟源人。1983年9月-1986年7月湖南娄底中等师范学校毕业;1986年7月-2000年8月湖南涟源白马中学中学老师;2000年9月-2003年6月中南大学计算机应用技术专业硕士研究生毕业,导师:蒋外文、王加阳;2003年7月-今,湖南师范大学工作;2004年9月-2008年5月,中南大学计算机应用技术专业博士研究生毕业,导师:陈建二、王建新;2010年1月-2011年5月,美国加州大学河滨分校博士后,合作导师:Jiang Tao教授。
在单体型组装高精度计算模型和高效实用算法研究方向取得了一些突出的研究成果,成功地把参数计算理论和算法设计技术与生物计算问题实际特征结合起来,在基于 Sanger 测序的单体型组装问题研究领域取得了一系列创新性成果,对单体型组装已有的一系列计算模型设计出了相应的高效精确算法,进而提出了一个新的具有更高精精度的计算模型。相关论文发表在 ISMB 2008、BMC Bioinformatics、Algorithmica、计算机学报、软件学报等国际国内生物信息学和计算机算法领域的一些顶级国际会议和杂志上。在加州大学河滨分校计算机系进行博士后工作期间,参与美国 NIH科研项目“MULTI- POINT AND MULTI- LOCUS ANALYSIS OF GENOMIC ASSOCIATION DATA”的研究,本人采用图论算法技术成功设计了一个根据附近的单核苷酸多态性位点上的基因型信息对 HLA(人类白细胞抗原)进行精确推断的算法,研究成果发表在生物信息学国际顶级期刊 BMC Bioinformatics (SCI,IF:3.03);全基因组关联分析(GWAS)是用计算机算法搜索复杂疾病致病基因的有效手段,本人基于相对频繁项聚类的思想提出了一个快速而有效地疾病相关的多基因交互模块探测 GWAS,相关研究成果已在生物信息学顶级期刊 Bioinformatics (SCI, IF: 4.877)上发表。近 5年来本人发表学术论文20余篇,其中 SCI收录8篇,EI收录7篇, Medline收录1篇。主持国家自然科学基金2项、湖南省自然科学基金项目1项,2009 年获中国博士后科研基金一等资助;2009年度确定为湖南省普通高校青年骨干教师培养对象;2012年本人所发表论文获湖南省第14届自然科学二等优秀学术论文; 相关研究成果获得2013年教育部自然科学二等奖(本人排名第3),曾被 Bioinformatics、 IEEE/ ACM Tran sactions on Computational Biology and Bioinformatics、中国科学 E(英文版 )、 Algorithms for Molecular Biology等国际杂志邀请审稿。
研究方向:
计算机算法分析与设计,生物信息学
教学情况:
本科生课程: 数据结构与算法、数据库原理与应用、微机原理、单片机原理
研究生课程:软件工程、生物信息学、高级数据库技术
承担课题:
[1] 全基因组关联分析基因交互作用探测算法研究,国家自然科学基金,2014.1—2017.12,主持,研究经费:73万. [2] 新一代测序技术下单体型组装问题计算模型和算法研究,国家自然科学基金,2010.1—2013.12,主持,研究经费:32万.
[3] 单体型问题计算模型和算法研究,中国博士后科学基金一等资助, 2009.07—2011.12,主持,研究经费:5万.
[4] 单体型计算问题优化算法研究,湖南省自然科学基金,2009.1—2011.12, 主持,研究经费:4万.
近期发表的代表性论文:
[1] Xie, Minzhu and Jing Wang. Parameterised algorithms of the individual haplotyping problem with gaps. Int. J. Bioinformatics Research and Applications. 9(1), pp. 25-40, 2013.
[2] Minzhu Xie, Jing Li, Tao Jiang, Detecting genome-wide epistases based on the clustering of relatively frequent items, Bioinformatics, 2012, 28, 5-12. (SCI, IF: 5.468)
[3] Minzhu Xie, Jing Li, Tao Jiang, Accurate HLA type inference using a weighted similarity graph. BMC Bioinformatics (also to be presented at the 21st International Conference on Genome Informatics (GIW), Shanghai, China, Dec. 16-18, 2010), 2010, (SCI, IF:3.028)
[4] Minzhu Xie, J. Wang, and T. Jiang, A fast and accurate algorithm for single individual haplotyping. BMC Systems Biology (also to be presented at the 23rd International Conference on Genome Informatics (GIW), Tainan, TaiWan, Dec. 12-14, 2012), 2012, 6(Suppl 2): p. S8. (SCI, IF:3.15)
[5]Minzhu Xie, Jianxin Wang, Jianer Chen. A practical parameterised algorithm for the individual haplotyping problem MLF. Mathematical Structures in Computer Science, 2010. 20(5): p. 851-863. (SCI, EI)
[6] Minzhu Xie, Jianxin Wang, Jianer Chen, et al. Computational Models and Algorithms for the Single Individual Haplotyping Problem. Current Bioinformatics, 2010. 5(1): 18-28. (SCI)
[7]Minzhu Xie, Jianxin Wang, Jianer Chen. A model of higher accuracy for the individual haplotyping problem based on weighted SNP fragments and genotype with errors. In Alfonso Valencia, Ildefonso Cases (Eds): Proceedings of the 16th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, ISMB 2008, Toronto, Canada, July 19-23, 2008, Bioinformatics, 2008, 24(13): i105-i113. (SCI, ISTP)
[8] Minzhu Xie, Jianxin Wang. An Improved (and Practical) Parameterized Algorithm of the Individual Haplotyping Problem MFR with Mate-pairs. Algorithmica, 2008, 52(2): 250–266. (SCI, EI)
[9] Jianxin Wang, Minzhu Xie*, Jianer Chen, A practical exact algorithm for the individual haplotyping problem MEC/GI, Algorithmica, 2010, 56(3): 283-296. (Corresponding author). (SCI)
[10] 谢民主, 陈建二, 王建新. 个体单体型问题参数化算法研究. 计算机学报, 2009, 32(8): 1637-1650.(EI)
[11] 谢民主, 陈建二, 王建新. 有Mate-Pairs 的个体单体型MSR 问题的参数化算法, 软件学报, 2007, 18(9): 2070-2082. (EI)
[12] 谢民主, 王建新, 陈建二. 单体型组装问题MEC/GI 模型的参数化算法. 高技术通讯, 2008, 18(4): 422-428. (EI)
[13] 谢民主, 刘新求. 枚举单体型组装问题多个最优解的遗传算法设计. 计算机工程与应用, 2010. 46(11): 7-9.
[14] 谢民主, 杨洋. 复杂疾病模型快速参数求解算法. 计算机工程与应用. 2012, 48(7): 121-123.
[15] 谢民主, 刘新求, 杨洋. 两位点疾病模型的快速参数求解算法. 计算机工程, 2012, 38(19): 266-268, 273.
[16] 谢民主,罗锋, 唐烽. 单体型组装最大片段割参数化精确算法. 小型微型计算机系统. 2014, 35(2): 353 - 357, 2014.
获奖情况:
(1) 2009年度确定为湖南省普通高校青年骨干教师培养对象;
(2) 2012年本人所发表论文获湖南省第14届自然科学二等优秀学术论文;
(3) 2013年教育部自然科学奖二等奖(本人排名第3)
指导研究生情况:
指导计算机软件与理论、软件工程专业硕士研究生共5人,已毕业2人。
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
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