＞副教授 姓　　名： 周　猛 部　　门： 生物医学软件工程教研室 职　　称： 副教授 学　　历： 博士研究生（在读） 职　　务： 办公电话： 0451-86620941-132 办公地址： 分子生物学馆132室 Email： zhoumeng@ems.hrbmu.edu.cn 主要研究方向： 非编码RNA生物信息学，复杂疾病生物信息学 个人简介 　　周猛，副教授，吉林大学生物信息学在读博士。2007年毕业于南京林业大学，同年至哈尔滨医科大学生物医学软件工程教研室工作，主要从事非编码RNA生物信息学和复杂疾病生物信息学研究，近期研究兴趣包括非编码RNA基因识别、进化和功能预测以及复杂疾病致病基因基因预测和预后分子标志物挖掘等，近年来在《Bioinformatics》、《Journal of Molecular Medicine》、《Eur J Hum Genet》、《Plos ONE》、《FEBS Letters》、《FEBS Journal》、《Genomics》、《Molecular Biosystem》等国内外杂志上发表研究论文30余篇，SCI累积影响因子达70余点（其中以通讯作者和第一作者发表SCI研究论文20余篇，SCI累积影响因子60余点）。主持国家自然科学基金，黑龙江省教育厅面上项目，黑龙江省卫生厅项目，营养与食品卫生学重点实验室开放课题以及黑龙江省大学生创新创业基金等多项课题，参与国家自然科学基金重大项目、面上项目，黑龙江省自然科学基金项目等7项。获得黑龙江省自然科学成果三等奖、哈尔滨自然科学成果一等奖等科研成果奖励5项，先后获得校级优秀本科生毕业论文指导教师，哈尔滨医科大学“三育人”先进个人等荣誉称号。《BMC Genomics》，《Molecular Genetics and Genomics》，《PloS ONE》，《GENE》，《Molecular Biology Reports》，《BioMed international research》和《International journal of molecular medicine》等杂志特邀审稿人。主讲本科生基础课《JAVA 程序语言设计》、《数据结构》、《计算机网络技术》以及高年级专业课《生物芯片技术》和《生物信息学软件》等课程，年均200学时以上。 　　主要承担的课题项目： 1. 基于生物网络的复杂疾病相关lncRNA基因多角度挖掘技术研究（61403111）（2015年1月-2017年12月） 项目来源：国家自然科学基金项目 说明：课题负责人。经费：25万。 完成情况：在研，按计划进行。 2. 脊椎动物microRNA基因簇的起源、分子进化分析及其进化模式与人类复杂疾病的关联研究（2012-808）（2013.01-2014.12） 项目来源：黑龙江省卫生厅项目 说明：课题负责人。经费：0万。 完成情况：结题。 3. 基于整合组学的lncRNA基因识别与功能预测的信息学研究（12541475）（2014.01-2016.12） 项目来源：黑龙江省教育厅项目 说明：课题负责人。经费：1.5万。 完成情况：在研，按计划进行。 4. 卵巢癌预后分子标记挖掘研究（YYKFKT1201）（2012.12-2014.12） 项目来源：营养与食品卫生学重点实验室开放课题 说明：课题负责人。经费：4万。 完成情况：结题 5. 基于整合组学的lncRNA基因功能预测的生物信息学研究（201410226021）（2014.01-2015.12） 项目来源：2014年黑龙江省大学生创新创业训练 说明：课题负责人。经费：0.5万。 完成情况：在研，按计划进行。 　　主要科研奖励情况： 1. 第十二届黑龙江省自然科学技术学术成果奖三等奖，In silico detection and characteristics of novel microRNA g enes in the Equus caballus genome using an integrated ab initio and comparative genomic approach，省级，黑龙江省科学技术协会，2010 2. 哈尔滨市自然科学技术学术成奖一等奖，characterization and evolution of microRNA gene derived from repetitive elements and duplication events in plants，厅局级，哈尔滨市科学技术协会，2012 3. 哈尔滨市自然科学技术学术成奖三等奖，人类microRNA基因功能注释的信息学研究，厅局级，哈尔滨市科学技术协会，2014 4. 哈尔滨市自然科学技术学术成奖优秀奖，genome-wide analysis of clustering patterns and flanking characteristics for plant microRNA genes，厅局级，哈尔滨市科学技术协会，2011 5. 哈尔滨市自然科学技术学术成奖优秀奖，脊椎动物miRNA基因的基因组组织特征与进化系统生物学研究，厅局级，哈尔滨市科学技术协会，2012 　　主要发表的论文列表： 1. Zhou M，Wang XJ，Li JW，Hao D，Wang Z，Shi H，Han L，Zhou H, Sun J. (2015). Prioritizing candidate disease-related long non-coding RNAs by walking on the heterogeneous lncRNA and disease network. Mol Biosyst. 11(13):760-769 (IF 3.183, first author) 2. Zhou M, Han L, Zhang J, Hao D, Cai Y, Wang Z, Zhou H, Sun J. (2014). A computational frame and resource for understanding the lncRNA-environmental factor associations and prediction of environmental factors implicated in diseases. Mol Biosyst. 10(12):3264-71 (IF 3.183, first author) 3. Hao D, Wang G, Yin Z, Li C, Cui Y, Zhou M.(2014). Systematic large-scale study of the inheritance mode of Mendelian disorders provides new insight into human diseasome. Eur J Hum Genet. 22:1260-67 (IF 4.225, corresponding author) 4. Sun J, Shi H, Wang Z, Zhang C, Liu L, Wang L, He W, Hao D, Liu S, Zhou M. (2014). Inferring novel lncRNA-disease associations based on a random walk model of a lncRNA functional similarity network. Mol Biosyst. 10(8):2074-81. (IF 3.183, corresponding author) 5. Lu J, Wu D, Li C, Zhou M, Hao D. (2014). Correlation between gene expression and mutator phenotype predicts homologous recombination deficiency and outcome in ovarian cancer. Journal of Molecular Medicine,92(11):1159-68 (IF 4.739,corresponding author) 6.Hao D, Li C, Zhang S, Lu J, Jiang Y, Wang S, Zhou M. (2014). Network-based analysis of genotype phenotype correlations between different inheritance modes. Bioinformatics. 30(22):3223-31 (IF 5.323, corresponding author) 7. Li J, Li C, Han J, Zhang C, Shang D, Yao Q, Zhang Y, Xu Y, Liu W, Zhou M, Yang H, Su F, Li X. (2014). The detection of risk pathways, regulated by miRNAs, via the integration of sample-matched miRNA-mRNA profiles and pathway structure. J Biomed Inform. 49:187-97 (IF 2.482) 8. Sun J, Zhou M, Yang H, Deng J, Wang L, Wang Q. (2013). Inferring potential microRNA-microRNA associations based on targeting propensity and connectivity in the context of protein interaction network. PLoS One. 8(7):e69719 (IF 3.534, corresponding author and co-first author) 9. Sun J, Gao B, Zhou M, Wang ZZ, Zhang F, Deng JE, Li X. (2013). Comparative genomic analysis reveals evolutionary characteristics and patterns of microRNA clusters in vertebrates. Gene. 512(2):383-91 (IF 2.082, corresponding author and co-first author) 10. Sun J, Zhou M, Mao ZT, Hao DP, Wang ZZ, Li CX. (2013) Systematic analysis of genomic organization and structure of long non-coding RNAs in the human genome FEBS Lett. 587 (7):976-82 (IF 3.538, corresponding author and co-first author) 11. Sun J, Zhou M, Mao Z, Li C (2012) Characterization and Evolution of microRNA Genes Derived from Repetitive Elements and Duplication Events in Plants. PLoS ONE 7(4): e34092. doi: 10.1371/journal. pone. 0034092 (IF 4.092, corresponding author and co-first author). 12. Sun J, Liu HP, Deng JE & Zhou M (2012) Systematic analysis of genomic organization and heterogeneities of miRNA cluster in vertebrates. Mol Biol Rep 39, 5143-5149. (IF 2.929, corresponding author). 13. Wang ZZ, Gong BS, Wang HK, Wang HJ, Zhou M, Wang QH, Chen X, Liu T, Li X. MicroRNA regulation constrains the organization of target genes on mammalian chromosomes. FEBS Lett 2011,585(12), 1897-1904 (IF 3.538). 14. Wang QH, Zhou M, Sun J, Ning SW, Li Y, Chen L, Zheng Y, Li X, Lv SL, Li X: Systematic analysis of human microRNA divergence based on evolutionary emergence. FEBS Lett 2011, 585(1):240-248. (IF 3.538, co-first author). 15. Wang Q, Sun J, Zhou M, Yang H, Li Y, Li X, Lv S, Li X & Li Y (2011) A novel network-based method for measuring the functional relationship between gene sets. Bioinformatics 27, 1521-1528. (IF 5.468, co-first author) 16. Zhou M, Sun J, Wang QH, Song LQ, Zhao G, Wang HZ, Yang HX, Li X: Genome-wide analysis of clustering patterns and flanking characteristics for plant microRNA genes. Febs J 2011, 278(6):929-940. (IF 4.25, first author). 17. Wang Y, Du L, Li X, Zhang S, Xiao Y, Gong B, Wang Q, Zhou M, Xu C, Chen X et al: Functional homogeneity in microRNA target heterogeneity--a new sight into human microRNomics. Omics 2011, 15(1-2):25-35. (IF 2.441). 18. Zhou M, Wang Q, Sun J, Li X, Xu L, Yang H, Shi H, Ning S, Chen L, Li Y et al: In silico detection and characteristics of novel microRNA genes in the Equus caballus genome using an integrated ab initio and comparative genomic approach. Genomics 2009, 94(2):125-131. (IF 3.327, first author). 19. Zhou M, Li X: Analysis of synonymous codon usage patterns in different plant mitochondrial genomes. Mol Biol Rep 2009, 36(8):2039-2046. (IF 2.038, first author). 20. Zhou M, Tong CF, Shi JS: A preliminary analysis of synonymous codon usage in poplar species. Molecular plant 2007, 33(4):285-293. (IF 2.784, first author). 21. Zhou M, Tong C, Shi J: Analysis of codon usage between different poplar species. J Genet Genomics 2007, 34(6):555-561. (IF 2.924, first author). 22. Zhou M, W Long, Li X: Analysis of synonymous codon usage in chloroplast genome of Populus alba. Journal of Forestry Research, 2008, 19(4): 293-297 (SCI, first author)