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哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院研究生导师简介-许超汉
哈尔滨医科大学 [db:出处]/2016-02-28
>副教授
姓 名:
许超汉
部 门:
生物信息学教研室
职 称:
副教授
学 历:
博士研究生
职 务:
研究生工作负责人
办公电话:
0451-86650721-16
办公地址:
分子生物学馆106室
Email:
xuchaohan(at)tom.com
主要研究方向:
复杂疾病相关的基因、非编码RNA等生物分子标记的优化与识别研究
个人简介
许超汉,博士,副教授,研究生工作负责人。哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院获得理学博士学位。主要从事生物信息教学和学院研究生工作,目前主讲研究生、本科生课程《基因组信息学》、《生物信息软件》、《生物芯片技术》、《生物信息数据挖掘》和《计算机基础》等。先后主持或参加国家和省厅级科研课题10余项。在国际学术重要刊物《Nucleic Acids Res.》、《Neuro-Oncology》、《PLOS ONE》、《Mol Cancer Ther》、《Molecular BioSystems 》、《BMC Bioinformatics》、《Genomics》、《Gene》等发表SCI论文多篇。
教育经历:
1997-2001年,东北林业大学,土木工程学院,本科
2006-2011年,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,博士
工作经历:
2001-2006年,黑龙江省龙建集团,技术员
2011-2013年,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,讲师
2013年-至今,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,副教授
承担课题:
1) 整合多组学数据构建恶性肿瘤非编码RNA调控网络(2014-2016年)
项目来源:黑龙江省卫生厅科研课题项目
说明:课题负责人。经费:2万。
完成情况:在研,按计划进行。
2) 融合组学数据系统识别和优化恶性肿瘤相关lncRNAs(2014-2016年)
项目来源:黑龙江省教育厅科学技术研究项目
说明:课题负责人。经费:5万。
完成情况:在研,按计划进行。
3) 基于整合的非编码RNA调控网络识别乳腺乳腺恶性肿瘤相关的非编码RNA(2014-2016年)
项目来源:哈尔滨市科技局项目
说明:课题负责人。经费:7.5万。
完成情况:在研,按计划进行。
已发表论文:
1. C. Xu, Y. Ping, X. Li, H. Zhao, L. Wang, H. Fan, Y. Xiao, X. Li*, (2014) Prioritizing candidate disease miRNAs by integrating phenotype associations of multiple diseases with matched miRNA and mRNA expression profiles. Mol Biosyst. doi: 10.1039/c4mb00353e (SCI IF: 3.35).
2. Yun Xiao?, Chaohan Xu?, Jinxia Guan, Yanyan Ping, Huihui Fan, Yiqun Li, Hongying Zhao, Xia Li*. (2012) Discovering dysfunction of multiple microRNAs cooperation in disease by a conserved microRNA co-expression network. PLOS ONE. Vol. 7, No. 2. (SCI IF: 3.73)
3. Xiao, Y. ?, Xu, C. ?, Ping, Y., Guan, J., Fan, H., Li, Y. and Li, X. (2011) Differential expression pattern-based prioritization of candidate genes through integrating disease-specific expression data. Genomics, 98, 64-71. (SCI IF: 3.019)
4. Yun Xiao?, Chaohan Xu?1, Liangde Xu, Jinxia Guan, Yanyan Ping, Huihui Fan, Yiqun Li, Hongying Zhao, Xia Li*.Systematic identification of common functional modules related to heart failure with different etiologies. Gene. (SCI IF: 2.196)
5. Yun Xiao, Huihui Fan, Yunpeng Zhang, Wenjing Xing, Yanyan Ping, Hongying Zhao, Chaohan Xu, Yiqun Li, Li Wang, Feng Li, Jing Hu, Teng Huang, Yanling Lv, Huan Ren*, Xia Li*. (2012)Systematic Identification of Core Transcription Factors Mediating Dysregulated Links Bridging Inflammatory Bowel Diseases and Colorectal Cancer. PLOS ONE (SCI IF: 3.73)
6. Yun Xiao?, Jinxia Guan?, Yanyan Ping, Chaohan Xu, Teng Huang, Hongying Zhao, Huihui Fan, Yiqun Li, Yanling Lv, Tingting Zhao, Xia Li*. Prioritizing cancer-related key miRNA-target interactions by integrative genomics. Nucleic Acids Res. 2012, 1–13 (SCI IF: 8.278)
7. Yun Xiao?, Yanyan Ping?, Huihui Fan, Chaohan Xu, Jinxia Guan, Hongying Zhao, Yiqun Li, Yanling Lv, Xia Li*. Identifying dysfunctional miRNA-mRNA regulatory modules by inverse activation, co-function and high interconnection of target genes: a case study of glioblastoma. Neuro-Oncology. (SCI IF: 6.18)
8. Yan Li, Teng Huang, Yun Xiao, Shangwei Ning, Peng Wang, Qianghu Wang, Xin Chen, Xu Chaohan, Donglin Sun, Xia Li and Yixue Li. (2012) Prioritising risk pathways of complex human diseases based on functional profiling. European Journal of Human Genetics (2012) 00, 1–7 (SCI IF: 4.319)
9. Wang, Y., Du, L., Li, X., Zhang, S., Xiao, Y., Gong, B., Wang, Q., Zhou, M., Xu, C., Chen, X. et al. (2011) Functional homogeneity in microRNA target heterogeneity--a new sight into human microRNomics. OMICS, 15, 25-35. (SCI IF: 2.441)
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