＞副教授 姓　　名： 徐　娟 部　　门： 生物信息学教研室 职　　称： 副教授 学　　历： 博士研究生 职　　务： 办公电话： 0451-86650615 办公地址： 分子生物学馆108室 Email： xujuanbiocc(at)ems.hrbmu.edu.cn 主要研究方向： 复杂疾病非编码RNA标记的识别及功能分析 个人简介 　　徐娟，女，30岁。哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，副教授，博士。2013年破格晋升为副教授。在教学方面，讲授了多门专业课程（基因组信息学、数据挖掘、信息论、专业英语程等）。承担多届生物信息和生物技术专业本科生实习辅导任务。在科研方面，主要研究方向包括非编码RNA的功能与疾病，非编码RNA的协同调控作用分析，高通量数据处理、复杂疾病功能模块化网络等。在非编码RNA的协同调控作用分析和利用网络优化疾病非编码RNA方向取得了不断的进步和突出的成果。部分研究成果已以第一作者或者并列第一作者发表在《Nucleic Acids Research》（2篇）、《Human molecular genetics》、《Molecular Cancer Therapeutics》、《Gene》、《BMC Systems Biology》、《Molecular BioSystems》、《PLoS ONE》等国际期刊上，累计SCI影响因子为51.44，单篇最高影响因子8.28。目前承担一项国家自然科学基金面上项目，国家和省博士后基金各一项，以主要参与者参加973、863项目各一项，另外参加两项所在课题组承担的国家自然科学基金面上项目和一些省级和校级课题项目。 　　主要承担的课题项目： 1. “基于生物数据融合的恶性肿瘤中miRNA-ceRNA复合协同调控模式的研究”(61203264)，（2013-2015） 项目来源：国家自然科学基金项目 说明：课题负责人。 完成情况：在研，按计划进行。 2. “人类非编码RNA的系统识别与功能分析平台建设”（批准号：2014AA021102），（2014-2016） 项目来源：国家高技术研究发展计划（863计划） 说明：主要研究人 完成情况：在研，按计划进行。 3. “衰老与代谢相关疾病风险通路区域和关键节点识别的系统生物学研究”（批准号：2014CB910504），（2014-2017） 项目来源：国家重点基础研究发展计划（973计划） 说明：主要研究人 完成情况：在研，按计划进行。 4. “复杂疾病miRNA多态风险位点识别及其生物学功能分析”(批准号：61073136)，(2011-2013) 项目来源：国家自然科学基金项目 说明：主要研究人 完成情况：结题 5. “复杂疾病关联的miRNA-mRNA功能模块识别的信息融合方法研究”(30871394) 项目来源：国家自然科学基金项目 说明：主要研究人 完成情况：结题 　　主要科研奖励情况： 1. “基于miRNA-miRNA功能协同调控网络剖析疾病miRNA的拓扑特性”，哈尔滨市自然科学技术学术成果奖一等奖，排名第一； 2. “优化疾病风险miRNA基于其在miRNA-靶基因失调网络中的拓扑性质”，哈尔滨市自然科学技术学术成果奖优秀奖，排名第一； 　　主要获得的教学成果： 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院教学比赛二等奖； 　　主要发表的论文列表： 1. Yongsheng Li§, Shengli Li§, Juan Chen, Tingting Shao, Chunjie Jiang, Yuan Wang, Hong Chen, Juan Xu*, Xia Li*. Comparative epigenetic analyses reveal distinct patterns of oncogenic pathways activation in breast cancer subtypes [J]. Human Molecular Genetics, 2014. (SCI:7.692，通讯作者) 2. Jing Bai§, Yongsheng Li§, Tingting Shao, Zheng Zhao, Yuan Wang, Aiwei Wu, Hong Chen, Shengli Li, Chunjie Jiang, Juan Xu*, Xia Li*. Integrating analysis reveals microRNA-mediated pathway crosstalk among Crohn's disease, ulcerative colitis and colorectal cancer [J]. Molecular Biosystems, 2014. (SCI:3.534,通讯作者) 3. Yongsheng Li§, Juan Xu§, Huanyu Ju§, Yun Xiao, Hong Chen, Junying Lv, Tingting Shao, Jing Bai, Yunpeng Zhang, Li Wang, Xishan Wang*, Huan Ren*, Xia Li*. A network-based, integrative approach to identify genes with aberrant co-methylation in colorectal cancer [J]. Mol Biosyst, 2014, 10(2): 180-190. (SCI: 3.534，并列一作) 4. Yongsheng Li, Juan Xu, Hong Chen, Jing Bai, Shengli Li, Zheng Zhao, Tingting Shao, Huan Ren*, Chunsheng Kang*, Xia Li*. Comprehensive analysis of the functional microRNA-mRNA regulatory network identifies miRNA signatures associated with glioma malignant progression [J]. Nucleic Acids Res, 2013, 41(22): e203. (SCI: 8.278) 5. Yongsheng Li§, Juan Xu§, Hong Chen§, Zheng Zhao, Shengli Li, Jing Bai, Aiwei Wu, Chunjie Jiang, Yuan Wang, Bin Su, Xia Li*. Characterizing genes with distinct methylation patterns in the context of protein-protein interaction network: application to human brain tissues [J]. PLoS ONE, 2013, 8(6): e65871. (SCI: 3.73，并列一作) 6. Juan Xu§, Yongsheng Li§, Xiang Li§, Chuanxing Li, Tingting Shao, Jing Bai, Hong Chen, Xia Li*. Dissection of the potential characteristic of miRNA-miRNA functional synergistic regulations [J]. Mol Biosyst, 2013, 9(2): 217-224. (SCI:3.534) 7. Hongbo Shi, Juan Xu, Guangde Zhang, Liangde Xu, Chunquan Li, Li Wang, Zheng Zhao, Wei Jiang, Zheng Guo*, Xia Li*. Walking the interactome to identify human miRNA-disease associations through the functional link between miRNA targets and disease genes[J]. BMC System Biology, 2013. (SCI:2.98) 8. Yunpeng Zhang, Huihui Fan, Juan Xu, Yun Xiao, Yanjun Xu, Yixue Li*, Xia Li*. Network Analysis Reveals Functional Cross-links between Disease and Inflammation Gene[J]. Scientific reports, 2013.(SCI:2.93) 9. Juan Xu§, Chuanxing Li§, Yongsheng Li, Junying Lv, Ye Ma, Tingting Shao, Liangde Xu, Yingying Wang, Lei Du, Yunpeng Zhang, Wei Jiang, Chunquan Li, Yun Xiao, Xia Li*. MiRNA-miRNA synergistic network: construction via co-regulating functional modules and disease miRNA topological features [J]. Nucleic Acids Res, 2011, 39(3): 825-836. (SCI:8.026) 10. Juan Xu§, Chuanxing Li§, Junying Lv§, Yongsheng Li, Yun Xiao, Tingting Shao, Xiao Huo, Xiang Li, Yan Zou, Qinglian Han, Xia Li*, Lihua Wang*, Huan Ren*. Prioritizing candidate disease miRNAs by topological features in the miRNA target-dysregulated network: case study of prostate cancer [J]. Mol Cancer Ther, 2011, 10(10): 1857-1866. (SCI:5.226) 11. Chuanxing Li§, Yongsheng Li§, Juan Xu§, Junying Lv, Ye Ma, Tingting Shao, Binsheng Gong, Renjie Tan, Yun Xiao, Xia Li*. Disease-driven detection of differential inherited SNP modules from SNP network [J]. Gene, 2011, 489(2): 119-129. (SCI:2.341,并列一作) 12. Yongsheng Li, Binsheng Gong, Juan Xu, Lei Du, Junying Lv, Tingting Shao , Xiang Li, Xia Li*, Shaoqi Rao*. Functional Biases of Genes Containing Collections of Rare Variants [J]. Genetic Analysis Workshop 17, Boston, Massachusetts USA, 2010. (EI) 13. 吕俊英，徐娟, 李霞: 前列腺癌相关的microRNA-功能模块失调网络研究. 哈尔滨医科大学学报 2009,（七年制专刊） 　　主要参与编写的教材 《生物信息学》，人民卫生出版社，2010年8月出版。编写第16章第五节（miRNA调控生物学网络），448-457。 《System Biology and Network Modeling in Cancer Research and Drug Discovery》，Springer, 2012.8。Part III chapter 12，Prioritizing Candidate Disease miRNAs by Topological Features in the miRNA-Target Dysregulated Network。