＞教授 姓　　名： 许　艳 部　　门： 生物物理学教研室 职　　称： 教授、硕士生导师 学　　历： 博士研究生 职　　务： 教研室副主任 办公电话： 0451-86674768 办公地址： 分子生物学馆219室 Email： xuyan(at)ems.hrbmu.edu.cn 主要研究方向： 肿瘤生物信息学 个人简介 　　1990年毕业于哈尔滨医科大学与哈尔滨工程大学（前身哈尔滨船舶工程学院）合办的生物医学工程专业，同年留校在哈医大基础医学学院生物物理教研室工作；2000年获医学硕士学位，晋副教授；2006年获理学博士学位，转入哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院工作，同年9月进入哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院博士后流动站；2007年晋教授，2010年博士后出站。 　　一直承担七年制、五年制等多轨道的生物物理学，生物信息及生物技术专业生物医学工程概论、生物信息学进展等课程的教学工作。任《医用生物物理学》（第二版，人民卫生出版社）编委。 　　2006年从事生物信息科研工作以来，主要从事人类基因组拷贝数变异与复杂疾病；癌症相关互做与协同调控紊乱机制；人类蛋白质互作预测及癌症相关通路互作研究；基于疾病表型、GO功能注释及通路信息的基因相似性研究；癌症相关基因的TF-miRNA转录共调控网络构建及网络模序挖掘等研究工作。在《Human Mutation》，《Journal of the Royal Society Interface》，《Biomedical Informatics》，《BMC systems biology》，《Journal of Biomedical Informatics》，《Gene》,等学术知名刊物上发表科研文章20余篇，其中以第一或通讯作者发表SCI索引文章6篇、EI索引文章3篇。获得计算机软件著作权1项，《基于文本挖掘的疾病与拷贝数变异数据库0518927》。 　　主持国家、省、厅级课题共8项，包括国家自然科学基金1项；黑龙江省自然科学基金2项；黑龙江省博士后基金1项，省博士后启动基金1项；黑龙江省教育厅基金3项。作为研究骨干，参加了国家高技术研究发展计划（863计划2007AA02Z329）资助课题1项；国家自然科学基金重大研究计划项目（910297）1项；国家自然科学基金（30871394）等2项的研究工作。已经在肿瘤生物信息学和计算系统生物学领域积累了一定的知识和技能。 　　目前研究工作专注于基于拷贝数变异的microRNA与转录因子对癌症协同调控机制的研究；整合多组学数据的癌症相关互作与协同调控紊乱机制的研究；癌症相关基因的TF-miRNA转录共调控网络模序的挖掘与关键基因的识别；整合CNV和基因表达分析miRNA与转录因子对剂量效应的协同影响等。 　　在研研究生7人，已毕业10人。研究生中有5人获得黑龙江省优秀研究生创新基金项目资助，2人获国家级研究生奖学金，1人获省优秀研究生毕业生，4人获学校优秀研究生称号。3人获第十届华为杯全国研究生数学建模竞赛三等奖。毕业学生均发表一作或并列一作SCI/EI收录文章。 　　主要承担的课题项目： 1) 基于拷贝数变异识别抑癌的miRNA与转录因子及其协同纠错机制的研究(81372492)（2014-2017年） 项目来源：国家自然科学基金项目 说明：课题负责人。经费：72万。 完成情况：在研，按计划进行。 2) 基于拷贝数变异识别乳腺癌的抑癌miRNA与转录因子及其协同调控通路（12541278）（2014-2016） 项目来源：黑龙江省教育厅基金项目 说明：课题负责人。经费：3万。 完成情况：在研，按计划进行。 3) 癌症相关通路信息交互机制的研究(D201116)（2012-2014年） 项目来源：黑龙江省自然科学基金项目 说明：课题负责人。经费：5万。 完成情况：在研，按计划进行。 4) 结合CNVs和基因表达谱的癌症基因网络重构与分析(LBH-Q11044)（2012-2014年） 项目来源：黑龙江省博士后启动基金项目 说明：课题负责人。经费：3万。 完成情况：在研，按计划进行。 5) 基于SNPs遗传谱的阿片受体多基因挖掘(11531112)（2008-2010年） 项目来源：黑龙江省教育厅基金项目 说明：课题负责人。经费：1.2万。 完成情况：已结题。 6) 阿片受体相关生物大分子的系统生物信息学研究(D200606)（2007-2009年） 项目来源：黑龙江省自然科学基金项目 说明：课题负责人。经费：3万。 完成情况：已结题。 7) 阿片受体相关生物大分子生物信息学研究(LBH-Z06110)（2006-2008年） 项目来源：黑龙江省博士后基金项目 说明：课题负责人。经费：4万。 完成情况：已结题。 8) 物理因子改善脑部血液循环治疗缺血性脑血管病机理的研究(10541104)（2004-2006年） 项目来源：黑龙江省教育厅基金项目 说明：课题负责人。经费：1万。 完成情况：已结题。 　　主要科研奖励情况： 1) 基于混合贝叶斯模型的人类蛋白质互作预测及癌症相关通路互作分析，哈尔滨市自然科学学术成果三等奖，第一，2012.10 2) CNVD: Text Mining-based Copy Number Variation in Disease Database（基于文本挖掘的疾病相关拷贝数变异数据库），哈尔滨市自然科学学术成果三等奖，第一，2013.10 3) The application of gene co-expression network reconstruction based on CNVs and gene expression micro，哈尔滨市自然科学学术成果优秀奖，第一，2013.10 　　主要获得的教学成果： 谈医学院校中开设医学生物物理学课程,黑龙江省优秀高等教育科学成果三等奖，第三，2000.03 　　主要发表的论文列表（部分）： 1) Kening Li, Zihui Li, Ning Zhao, Yaoqun Xu, Yongjing Liu, Yuanshuai Zhou, Desi Shang,Fujun Qiu,Rui Zhang, Zhiqiang Chang and Yan Xu（通讯作者）Functional analysis of microRNA and transcription factor synergistic regulatory network based on identifying regulatory motifs in non-small cell lung cancer,BMC Systems Biology,2013, 7:122 SCI IF=2.982 2) Fujun Qiu, Yan Xu（通讯作者）, Kening Li, Zihui Li, Yufeng Liu, Huizi DuanMu, Shanzhen Zhang, Zhenqi Li, Zhiqiang Chang,Yuanshuai Zhou, Rui Zhang, Shujuan Zhang, Chunquan Li, Yan Zhang , Minzhai Liu and Xia Li. CNVD: Text Mining-based Copy Number Variation in Disease Database, Human Mutation, Vol.33, No.11, E2375-2381, 2012 SCI IF=5.845 3) Xu Y, Duanmu H, Chang Z, Zhang S, Li Z, Li Z, Liu Y, Li K, Qiu F, Li X The application of gene co-expression network reconstruction based on CNVs and gene expression microarray data in breast cancer, Molecular Biology Reports, Vol.39, No.2, 1627-1637, 2012 SCI IF=2.809 4) Zi-hui Li, Yu-feng Liu, Ke-ning Li, Hui-zi DuanMu, Zhi-qiang Chang, Zhen-qi Li, Shan-zhen Zhang, Yan Xu（通讯作者）, Analysis of functional and pathway association of differential co-expressed genes: A case study in drug addiction, Journal of Biomedical Informatics, Vol.45, No.1, 30-36，2012 SCI IF=2.151 5) Shanzhen Zhang, Zhiqiang Chang, Zhenqi Li, Huizi DuanMu, Zihui Li, Kening Li, Yufeng Liu, Fujun Qiu, Yan Xu（通讯作者）.Calculating phenotypic similarity between genes using hierarchical structure data based on semantic similarity, Gene, Vol.497, No.1, 58-65, 2012 SCI IF=2.443 6) Yan Xu, Wen Hu, Zhiqiang Chang, Lili Yu, Huizi DuanMu, Zhenqi Li, Zihui Li, Shanzhen Zhang, Xia Li. Prediction of Human Protein-Protein Interaction by Mixed Bayesian Model and Its Application to Exploring Underlying Cancer Related Pathway Crosstalk, Journal of the Royal Society Interface,Vol.8, No.57, 555-567, 2011 SCI IF=4.591 7) Zhiqiang Chang, Yan Xu（通讯作者）, Shanzhen Zhang, Wen Hu, Zhenqi Li, Xing Wang, Lili Yu, Huizi DuanMu. Relationship Mining among the entities associated with GPCRs. Conference on Web Information Systems and Mining (WISM’09) and the 2009 International Conference on Artificial Intelligence and Computational Intelligence. November 2009, 292-295.EI Accession Number:11058956 8) Yan Xu, Zhiqiang Chang, Wen Hu, Lili Yu, Huizi DuanMu and Xia Li. Mining the relationship between Gene and Disease from literature. Sixth International Conference on Fuzzy System and Knowledge Discovery. August 2009, 482-486.EI Accession Number:11035837 9) Yan Xu, Wen Hu, Lili Yu and Xia Li. The Research on the Relationship between Opioid Receptors. 2008 Fourth International Conference on Natural Computation. October 2008, 133-137.EI Accession Number:10398838 10) Xu Yan, Xu Manying, Li Xia. Modulation of GABA on painful sense in central nervous system of morphine-dependent rats. Neuroscience Bulletin. 2008, 24, No.4:278-282. 11) Xu Yan, Gao Peiqi. The protective effect of constant magnetic field on ischemia-reperfusion injury of the brain in rats, Chinese Journal of Clinical Rehabinlitation, 2006, 10(8): 176 12) 严自创，刘永晶，高斌，李菲菲，张潇潇，程新超，许艳（通讯作者）.基于CNV区域网络识别神经胶质瘤的重要功能区域，现代生物医学进展，第13卷33期，6591-6595页，2013 13) 李科宁，刘玉凤，李子慧，张淑娟，吴超，许艳（通讯作者）.基因共表达meta分析3种药物成瘾机制的研究，国际遗传学杂志, 第34卷，第5期，179-185页，2011 14) 许艳（通讯作者），陈鑫恺，胡雯. 基于表达谱的可卡因精神成瘾脑区性与时程性分析.国际遗传学杂志，第 33卷，第4期，153-158页，2010 15) 邹莎莎，于丽丽，胡雯，许艳（通讯作者）.与阿片成瘾相关分子互作网络的构建及生物学通路预测，中国组织工程与临床康复，Vol.12 No. 44：8681-8684. 2008