＞教授 姓　　名： 陈秀杰 部　　门： 药物基因组信息学教研室 职　　称： 教授、硕士生导师 学　　历： 博士研究生 职　　务： 教研室主任 办公电话： 0451-86620941-128 办公地址： 分子生物学馆128室 Email： chenxiujie(at)ems.hrbmu.edu.cn 主要研究方向： 药物毒性预测和个性化给药研究 个人简介 　　陈秀杰，女，教授，药物基因组信息学与药物动力学教研室主任，沈阳药科大学药物分析博士，中华中医药学会中药分析专业委员会委员，国家基金委，教育部博士点基金，北京市自然科学基金，浙江省自然科学基金，天津市，辽宁等省份的信函评审专家。 　　多年来一直从事药物分析学，药物基因组信息学领域的教学和科研工作，作为学科带头人，创建了哈医大药物分析和药物基因组信息学两个学科，完成了省教委委托项目《国内示范性药物生物信息学教学体系建立》。几年来承担国家和省部级科研课题12项，培养硕士研究生18人，指导本科生毕业设计61人，先后发表有代表性的科研论文30多篇，其中SCI收录论文10篇。获国家级优秀论文奖1项，省级科研奖励2项，国家发明专利1项和软件著作权1项。主编（审）及参编卫生部国家级规划教材4部。国家高教委十一五规划教材1部，以及以副主编身份参加的人民卫生出版社出版的专著1部。 　　多年来带领课题组进行了药物基因组信息学多个方向的研究：复杂疾病多靶点药物研究，药物毒性机制及毒性标记的表征研究，系统药理学和网络药理学的研究。药用植物药效物质基础研究，药物动力学研究。擅长融合生物学成果和技术进行药学研究。 在药用植物的鉴定方面，将分子生物学的RAPD方法用于黑龙江省道地药材防风的种属鉴别，从遗传本质上揭示了药用植物防风真伪的特征；首次在白花蛇舍草的道地性研究中采用RAPD及药理活性追踪相结合方法，阐明了同类植物药理活性最高产地的遗传特征，被同行认为是传统方法的新突破。 　　在药物体内动力学方面也做了一些相关的工作，为了解决木犀草素体内生物利用度低影响新药开发的状态，采用有机合成前体药物方法合成了一系列乙酰类化合物，并结合药理活性追踪和药物体内动力学特点确定四乙酰木犀草素可以代替木犀草素行使其功能，研究成果已在“Biomedical Chromatography”上发表，此化合物的制备工艺已申报专利。 　　在药物植物的药理活性和基础药效物质筛查中引入了系统生物学思想和相关先进技术，目前哈尔滨科技局以优秀学科带头人立项资助了“应用基因表达标识系统筛查红松松塔的典型药理活性”的研究。 　　同时还带领课题组进行了药物基因组信息学和化学基因组学研究等。从系统生物学视角探讨药物作用机制、药源性毒性机制，药源性毒性特征分析以及不同人群药物应答反应差异的原因，为临床个性化给药和合理药物设计提供了新思路。基于药物表达谱的应答通路挖掘和网络构建，已经取得一些成果，建立的方法学可以提供药物作用主要通路和关键靶标，为新型的药物研发模式面向通路的药物研发提供了新的实践思路，并为克服临床用药产生的毒副作用提供全新的联合用药策略。同时，对一些毒副作用相似的药物建立了完善的数据库，为临床医师用药和相关药物行政管理部们制定政策奠定了理论基础。 　　09年以来发表的主要论文 (1) Xiujie Chen*, Jiankai Xu, Bangqing Huang, Jin Li, Xin Wu, Ling Ma, Xiaodong Jia, Xiusen Bian, Fujian Tan, Lei Liu, Sheng Chen, Xia Li*,A sub-pathway-based approach for identifying drug response principal network. Bioinformatics，Volume 27, Issue 5, pages. 649-654(6) ,2011. (SCI IF=5.468) (2) Xiujie Chen*, Ruizhi Yang, Jiankai Xu, Hongzhe Ma, Sheng Chen， Xiusen Bian, Lei Liu. A sensitive measure for computing GO-based functional similarities among genes with ‘shallow annotation’.Gene,Volume 509, Issue 1,2012.(SCI IF=2.341) (3) Xiujie Chen, Lei Liu, Zhizhong Sun, Yongsheng Liu, Jiankai Xu and Kaishun Bi*. Pharmacokinetics of luteolin and tetra-acetyl-luteolin assayed by HPLC in rats after oral administration .Biomedical Chromatography,Volume 24, Issue 8, pages 826-832, 2010. (SCI IF=3.06) (4) Xiujie Chen1,* FuJian Tan1，XiaoDong Jia1 , Xiang Qiong Liu1 , Sheng Chen, Jiankai Xu , LeiLiu, RuiZhi Yang, YunFeng Wang, Yue Long Chen，The Network Characteristic Analysis of ADR-related Protein and Identification of ADR-ADR Association. Scientific Reports。2013, doi:10.1038/srep01744 (SCI，IF=2.927) (5) FuJian Tan1,Xiujie Chen1,* RuiZhi Yang1, Xiaoxue Xu1, XiaoDong Jia ,Xiang Qiong Liu , Yue Long Chen, Hongzhe Ma, Lei Liu，Drug repositioning by applying ‘expression profile’ generated through integrating chemical structure similarity and gene semantic similarity. Molecular BioSystems 2014,10, 1126-1138 (SCI, IF=3.35) (6) JIA Xiao-Dong , XU Jian-Kai, CHEN Xiu-Jie**, TAN Fu-Jian, LIU Xiang-Qiong, LIU Lei, YANG Rui-Zhi，A Method of Pathway Enrichment Analysis Based Gene Expression Variability. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2013.(,SCI IF=0.554) (7) Mingzhu Zhu, Lei Gao, Xia Lia, Zhicheng Liu, Chun Xu, Yuqing Yan, Xuijie Chen, Hui Lin. The analysis of the drug-targets based on the topological properties in the human protein-protein interaction network . Journal of Drug Targeting, Volume 17, Issue 7, pages 524-532, 2009 .(SCI IF=2.885) (8) Wei Jiang, Xiaowen Chen, Mingzhi Liao, Wei Li, Baofeng Lian, Lihong Wang, Fanlin Meng, Xinyi Liu1, Xiujie Chen, Yan Jin4, Xia Li*. Identification of links between small molecules and miRNAs in human cancers based on transcriptional responses . Scientific Reports Volume: 2, Article number: 282 ,2012.(SCI) (9) Xiusen Bian, XiuJie Chen,Xiangqiong Liu, Xiaodong Jia, Fujian Tan, Jiankai Xu, Lei Liu ,Ruizhi Yang, Yunfeng Wang, Yuelong Chen, Subpathway mining based on continuous structures, BMC Bioinformatics（under review,SCI） (10) Dong-xiang Q, Xiu-jie C, Wen-liang Z, Lei L. Separation and purification of aqueous extract of pinecone of Pinus Koraiensis by macroporous adsorption resins.Journal Of Harbin Medical University,43(1):73-75，2009. (11) Dong-xiang Q, Xiu-jie C, Yong-sheng L, Zhi-lei D, Lei L, Jian-kai X, Si-bo L:Effect of Aqueous Extracts of Pinecone ofPinus koraiensis Sied.et Zucc on Mice Natural Killing Cells.Chinese Pharmaceutical Journal,44(13):989-992,2009. (12) Lei L, Xiu-Jie C,Wen-Liang Z, Xiao-Dan S: HPLC determination of vinorelbine tartrate in tumor cells. Chinese Journal of Pharmaceutical Analysis, 28(5):807-809, 2008. (13) Xiu-Jie C, Lei L, Wen-Liang Z, Yong-Sheng L, Bang-Qing H, Dong-Xiang Q, Kai-Shun B: Study on pharmacokinetics of luteolin in rats. Chinese Journal of Pharmaceutical Analysis, 29(9):1462-1465,2009. 　　承担的项目： 　　在研课题： 1.Drug-ADR-Pathway复合网络构建及ADR分子机制研究 国家自然科学基金面上项目（61372188） 第1主持人（2014.1-2017.12） 2.药源性长QT综合症：hERG抑制剂诱导的转录后调控网络 国家自然科学基金青年项目（31301094） 第2主持人（2014.1-2017.12） 3. 基于复合网络的药物不良反应机制研究与预测 黑龙江省教育厅面上项目（11531112） 第1支持人（2014.1-2017.12） 4. 红松松塔提取物抗肿瘤药物研制 黑龙江省教育厅前期培育项目 第1支持人（2013.1-2015.12） 　　已结课题： 1.基于RBF神经网络方法的药物生物利用度预测 黑龙江省高教厅课题(11541121) 第1主持人(2010.1-2012.12) 2.应用基因表达标识系统筛查红松松塔的典型药理活性 哈尔滨市科技局优秀学科带头人课题（2009AA3CN166） 第1主持人(2010.1_2012.12) 3. 木犀草素及其前体药物的药物动力学研究 黑龙江省科技厅攻关课题（GC07C337） 第1主持人（2008.1-2010.12） 4. 脲酶抑制剂乙酰氧肟酸的中试研究 哈尔滨市科技局攻关课题（2004AA3CN155） 第1主持人（2004.1-2007.12） 5. RAPD法在黑龙江省道地药材防风中的鉴定应用 黑龙江省科技厅攻关课题（GC03C401-4） 第1主持人（2003.1-2006.12） 6. 艾迪注射液指纹图谱研究 科技部重大攻关项目 第3主持人（2003.3-2005.3） 7.碘锌联合缺乏对克汀病发生发展的影响 国家自然科学基金面上项目 第2主持人（1995.1-1998.12） 8. 食用合格碘盐的孕妇碘营养状况调查 黑龙江省卫生厅面上项目 第1主持人（1998.1-2000.12） 　　获奖及获专利情况： 1.陈秀杰，刘磊， 孙志忠。 木犀草素与四乙酰化木犀草素的药物动力学比较研究， 第十二届黑龙江省自然科学技术学术成果一等奖，2011。 2.陈秀杰， 徐建凯 。 基于子通路和主效网络的药物作用机制研究，哈尔滨市2011年度自然科学技术学术成果二等奖，2011。 3.陈秀杰 。 1999年全国碘缺乏病健康教育效果评估 , 2000年获中华医学会碘缺乏病分会优秀论文奖，2000。 4.王丹娜， 陈秀杰 ，刘守军， 石玉霞， 于君， 吕建国。国家自然基金项目《碘锌联合缺乏在地方性克汀病病因及发病中的作用》, 黑龙江省政府科技进步三等奖 ，2000。 5.发明专利：杨宝峰 陈秀杰 朱文良 李霞 ,一种红松松塔提取物的制备方法， 2010 ，中国，200710144691.2。 6.软件著作权：陈秀杰、徐建凯、刘磊、李霞、杨瑞智，药物反应通路分析平台V1.0，2013.2，中国，2013SR013446，软著登字第0519208号。 　　主要获得的教学成果： 1.承担的黑龙江省高教厅课题《国内示范性药物基因组信息学课程体系建设》获得了2012年度黑龙江省优秀高等教育科学研究成果三等奖。 2.2013年以副主编身份编写了人民卫生出版社出版的《生物信息学理论与医学实践》专著。 　　目前承担的课程： 1.承担四个轨道四门课程： 药物基因组信息学（药学院大药学专业，药学院临床药学专业，生物信息学专业，生物技术软件专业）；药物动力学（生物信息学专业，生物技术软件专业）；计算机辅助药物设计（生物信息学专业，生物技术软件专业）；药学导论（生物信息学专业，生物技术软件专业）。 2.面向全校的讲座：后基因组时代药物研发新模式。