＞教授 姓　　名： 陈丽娜 部　　门： 生物物理学教研室 职　　称： 教授、硕士生导师 学　　历： 硕士研究生 职　　务： 教研室主任 办公电话： 0451-86674768 办公地址： 分子生物学馆215室 Email： chenlina(at)ems.hrbmu.edu.cn 主要研究方向： 重大疾病的计算系统生物学研究 个人简介 　　陈丽娜，教授、硕士研究生导师，1988年毕业于中国科学技术大学获理学硕士学位，同年至哈尔滨医科大学生物物理教研室工作，主要从事重大疾病的计算系统生物学研究和承担研究生、本科生及留学生的多层次，多轨道的分子生物物理学、分子影像学、结构生物信息学、生物医学工程概论、生物控制论、生物物理技术及激光共聚焦显微镜等课程的教学工作。2002年晋升为教授，先后培养硕士研究生15人，指导本科生毕业设计36人。近年来，陈丽娜教授于Bioinformatics、Molecular Biosystems 、PLOS ONE和 BMC Med Genomics等国际著名期刊发表SCI论文18篇，主持国家自然科学基金等课题项目13项，获中华医学科学技术等科研成果6项。所领导的课题组目前正致力于心血管及癌症等复杂疾病药物靶点、基于生物分子网络的复杂疾病致病基因挖掘策略的研究、细胞膜穴区域分子通路整合调控机制和基于复杂疾病表型的代谢组学分析平台的构建挖掘新算法等方面的研究，并在这些领域取得了一定的成果。 　　主要承担的课题项目： 1、2013.1-2016.12生物代谢网络融合遗传风险的复杂疾病特异代谢通路识别（61272388） 项目来源：国家自然科学基金 说明：课题负责人。经费：60万。 完成情况：在研，按计划进行。 2、2013.1-2015.12冠心病风险基因作用途径的识别方法研究（F201237） 项目来源：黑龙江省自然科学基金 说明：课题负责人。经费：5万。 完成情况：在研，按计划进行。 3、2011,1-2013,12基于遗传变异和生物代谢环境挖掘冠心病特异通路（12511271） 项目来源：黑龙江省教育厅 说明：课题负责人。经费：1.5万。 完成情况：按计划完成，已结题。 4、2013,1—2014,12基于TRIZ理论的培养医学院校创新人才的研究（GBC212050） 项目来源：黑龙江省教育厅 说明：课题负责人。经费：0.4万。 完成情况：在研，按计划进行。 　　主要科研奖励情况： 1. 2013年9月哈尔滨市自然科学技术学术成果三等奖“Predicting Candidate Genes Based on CombinedNetwork Topological Features: A Case Study in Coronary Artery Disease” 2．2012年8月哈尔滨市自然科学技术学术成果二等奖“A novel paradigm for potential drug-targets discovery: quantifyingrelationships of enzymes and cascade interactions of neighboringbiological processes to identify drug-targets ” 3．2011年12月中华医学科技三等奖 癌风险生物标志物及风险通路识别的生物信息融合系列方法研究 4．2011年6月获2010年省高校科学技术二等奖，“融合并定量遗传因素与环境背景因素的复杂疾病机理研究方法及分析平台构建” 5．2010年9月 哈尔滨市自然科学技术学术成果三等奖“Prioritizing risk pathways: a novel association approach tosearching for disease pathways fusing SNPs and pathways” 　　主要获得的教学成果： 1. 生物信息学 2010年8月 人民卫生出版社 编委 2. 生物信息学理论与医学实践 2013年1月人民卫生出版社 副主编 3. 医学基础课程习题集 （三） 2012年5月黑龙江科学技术出版社 副主编 4. 医用生物物理学 1998年12月人民卫生出版社 编委 　　主要发表的论文列表： 2009年-2014年发表的部分文章 1. Xu Jia., Zhengqiang Miao., Wan Li, Liangcai Zhang, Chenchen Feng, Yuehan He, Xiaoman Bi, Liqiang Wang, Youwen Du, Min Hou, Dapeng Hao, Yun Xiao, Lina Chen*, Kongning Li*，Cancer-Risk Module Identification and Module-Based Disease Risk Evaluation: A Case Study on Lung Cancer PLOS ONE 2014 , 9（3）e 92395 (*通讯作者，SCI, IF : 3.73) 2. Chen-Chen Feng, Li-Na Chen*, Mei-Jun Chen1&, Wan Li1, Xu Jia1, Yan-Yan Zhou1, Wei-Ming He，Analysis of Different Activation Statuses of Human Mammary Epithelial Cells from Young and Old Groups Asian Pac J Cancer Prev, 15 (8), 3763-3766 (*通讯作者，SCI, IF : 1.272) 3. Wan Li., Lina Chen*., Weiming He, Weiguo Li, Xiaoli Qu, Binhua Liang, Qianping Gao, Chenchen Feng, Xu Jia, Yana Lv, Siya Zhang, Xia Li ，Prioritizing Disease Candidate Proteins in Cardiomyopathy-Specific Protein-Protein Interaction Networks Based on ‘Guilt by Association’ Analysis PLOS ONE 2013 , 8（8）e71191 (*通讯作者，SCI, IF : 3.73) 4. Wan Li, Lina Chen*, Xia Li, Xu Jia, Chenchen Feng, Liangcai Zhang, Weiming He, Junjie Lv,Yuehan He, Weiguo Li, Xiaoli Qu, Yanyan Zhou and Yuchen Shi Cancer-related marketing centrality motifs acting as pivot units in the human signaling network and mediating cross-talk between biological pathways Molecular BioSystems 2013 ,9：3026—3035 (*通讯作者，SCI, IF : 3.35) 5. Xiaoli Qu; Ruiqiang Xie; Lina Chen*; Chenchen Feng; Yanyan Zhou; Wan Li; Hao Huang; Xu Jia; Junjie Lv; Yuehan He; Youwen Du; Weiguo Li; Yuchen Shi; Weiming He Identifying colon cancer risk modules with better classification performance based on human signaling network Genomics 2013 ,11：(*通讯作者，SCI, IF : 3.01) 6. Lina Chen*, Xiaoli Qu, Mushui Cao, Yanyan Zhou, Wan Li, Binhua Liang, Weiguo Li, Weiming He, Chenchen Feng, Xu Jia & Yuehan He Identification of breast cancer patients based on human signaling network motifs SCIENTIFIC REPORTS 2013，3 : 3368 (*通讯作者，SCI, IF : 2.93) 7. Chenchen Feng, Lina Chen*, Wan Li, Hong Wang, Liangcai Zhang, Xu Jia,Zhengqiang Miao, Xiaoli Qu, Weiguo Li, and Weiming He dentifying Grade/Stage-Related Active Modules in Human Co-regulatory Networks: A Case Study for Breast Cancer OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2012, 16(12): 681-689. (*通讯作者, SCI, IF: 2.73) 8. Xu Li, Lina Chen*, Liangcai Zhang, Wan Li,Xu Jia, Weiguo Li ,Xiaoli Qu,Jingxie Tai, Chenchen Feng,Fan Zhang,Weiming He. RCM: A Novel Association Approach to Search for Coronary Artery Disease Genetic Related Metabolites Based on SNPs and Metabolic Network. Genomics 100 (2012) 282–288 (*通讯作者, SCI,IF: 3.05) 9. Liangcai Zhang, Xu Li., Jingxie Tai., Wan Li, Lina Chen*. Predicting Candidate Genes Based on Combined Network Topological Features: A Case Study in Coronary Artery Disease. PLoS One,2012, 7(6): e39542. ( *通讯作者, SCI, IF: 4.039) 10. Chen L*, Li W, Zhang L, Wang H, He W, Tai J, Li X: Disease gene interaction pathways: a potential framework for how disease genes associate by disease-risk modules. PLoS One, 2011, 6(9):e24495.( *通讯作者,SCI IF 4.411) 11. Chen L*, Tai J, Zhang L, Shang Y, Li X, Qu X, Li W, Miao Z, Jia X, Wang H et al: Global risk transformative prioritization for prostate cancer candidate genes in molecular networks. Mol Biosyst,2011, 7(9):2547-2553.( *通讯作者,SCI IF 3.825) 12. Chen L*, Wang Q, Zhang L, Tai J, Wang H, Li W, Li X, He W: A novel paradigm for potential drug-targets discovery: quantifying relationships of enzymes and cascade interactions of neighboring biological processes to identify drug-targets. Mol Biosyst,,2011，7(4):1033-1041.( *通讯作者,SCI IF 3.825) 13. Zhang L, Li W, Song L, Chen L*: A towards-multidimensional screening approach to predict candidate genes of rheumatoid arthritis based on SNP, structural and functional annotations. BMC Med Genomics,,2010，3:38.(*通讯作者,SCI IF 3.786) 14. Chen L*, Wang H, Zhang L, Li W, Wang Q, Shang Y, He Y, He W, Li X, Tai J: Uncovering packaging features of co-regulated modules based on human protein interaction and transcriptional regulatory networks. BMC Bioinformatics,2010， 11:392.(*通讯作者,SCI IF 3.432) 15. Wang H, Qu X, Zhao Y, Zhang J, Chen L*: Uncovering Atherosclerotic Rick Disease Gene Based on Expression and Network Topological Structure. Progress in Biochemistry and Biophysics,,2010,37(8):7.(*通讯作者,SCI IF 0.236) 16. Chen L*, Wang Q, Shang Y, Zhang L, Sun Z, He W, Zhao Y, Li W, Wang H, He Y et al: Human Protein Structural Interaction Network:Domain Effects on Network Topology and Protein Function. Progress in Biochemistry and Biophysics,2010 37(5):10.( *通讯作者,SCI IF 0.236) 17. Zhao Y, Chen L*, Zhang L, Wang Q, Shang Y, Wang H, Li W: Predicting Disease Genes of Coronary Artery Disease Based on Functional Consistency and Network Topological Features. Progress in Biochemistry and Biophysics,2009 36(6):781.(*通讯作者,SCI IF 0.193) 18. Chen L*, Zhang L, Zhao Y, Xu L, Shang Y, Wang Q, Li W, Wang H, Li X: Prioritizing risk pathways: a novel association approach to searching for disease pathways fusing SNPs and pathways. Bioinformatics 2009, 25(2):237-242.(*通讯作者,SCI IF 5.039) 19. Chen L*, Zhao Y, Zhang L, Shang Y, Wang Q, Li W, Wang H, Li X: CTFMining: A method to predict candidate disease genes based on the combined network topological features mining. iCBBE2009 Proceedings 2009.(EI)