项目级别：黑龙江省院所基本应用技术研究专项
起止时间：2018.01-2020.11
参加人员：张淑梅、刘宇帅、李晶
项目介绍：经比较基因组分析发现菌株TF28基因组序列中位于Scaffold1:238886-240409的菌株特有基因与NCBI数据库中芽孢杆菌属及其它菌属菌株同源性很低，最高同源性为11%，基于无同源性区设计3对常规PCR和3对qPCR引物， 建立2套TF28活菌定量技术： 1、基于TF28菌株在NYD培养基上的特异菌落形态建立活菌计数与菌株特异性PCR鉴定相结合的TF28活菌定量检测技术； 2、基于PMA封闭死菌DNA建立PMA-qPCR快速定量TF28活菌技术。 基于离体土壤， 探讨了温度、 PH、含水量、土壤有机质含量等环境因子以及接种量与枯萎病菌数量对TF28在土壤中定殖动态的影响。 在同江、加格达奇、哈尔滨3个地区进行了TF28田间试验， 揭示了TF28在第一、第四和第六3个积温带的定殖动态，菌株TF28能够在大豆全生育期内有效定殖，定殖数量呈现波动变化， 为TF28的田间应用奠定了理论基础，提供了技术支撑。
菌株TF28在NYD平板上的菌落形
特有基因NCBI比对，与芽胞杆菌属菌株同源性很低，最高为11%
