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武汉大学药学院导师教师师资介绍简介-郭锋彪

本站小编 免费考研网/2021-07-22

郭锋彪

性别:男

职称:教授


学科方向

生物信息学,研究各类功能关键基因(比如绝对必需基因与合成致死基因、Cas与Anti-CRISPR编码基因、微生物有益代谢物编码基因)的预测算法及围绕相关基因的合成生物学、药物发现等领域的扩展应用。


教育背景:

1996年9月-2000年7月,天津大学应用物理专业,获理学学士;

2000年9月-2003年1月,天津大学生物信息中心,获理学硕士;

2003年3月-2006年1月,天津大学生物信息中心,获理学博士。


工作经历:

2006年1月-2008年7月,电子科技大学生命科学与技术学院,讲师;

2008年8月-2014年07月,电子科技大学生命科学与技术学院,副教授,2010年12月始担任博导;

2012年1月-2013年8月,香港大学医学院微生物系,香江学者;

2014年8月-2020年9月,电子科技大学生命科学与技术学院,教授;

2018年4月至2020年7月,电子科技大学生命科学与技术学院生物技术系主任;

2020年10月至今,武汉大学药学院,教授。


学术简介:

教育部新世纪优秀人才、四川省有突出贡献的优秀专家。从攻读研究生起一直从事微生物信息学的研究。作为第一作者或通讯作者研发了原核生物蛋白质编码基因注释系统ZCURVE(适用于细菌和古细菌)、ZCURVE_V(适用于病毒和噬菌体)、Vgas(适用于病毒和噬菌体),细菌和古细菌必需基自动化注释系统Geptop,被欧洲分子生物学实验室等国内外学术机构使用。构建了必需基因团簇数据库CEG和基因编辑相关数据库Anti-CRISPRdb,被诺贝尔奖获得者、CRISPR-Cas9发现者Jennifer Doudna教授和生物信息学家、美国科学院院士Eugene V Koonin 等人作参考数据集采用。

目前主要进行(1)基于必需基因的细菌基因组设计;(2)协同致死(synthetic lethality)基因对的理论预测及抗癌靶标基因的识别;(3)Anti-CRISPR基因的理论预测及对各类型Cas蛋白特异性抑制的识别及鉴定;(4)有益肠道微生物调控人类疾病的机制途径解析等多方面的研究。有望通过理论和实验研究的深度结合,产生创新性更高并具有一定应用价值的成果。

已主持获得5项国家自然科学基金,主持获得四川省科技进步奖,获得霍英东青年教师奖。担任中国细胞生物学会功能基因组信息学与系统生物学专委会委员、担任中国运筹学会计算系统生物学专委会委员、担任中国生物物理学会生物信息学专委会委员。组织承办2016年全国生物信息学与系统生物学学术大会(实际参会1000余人)。


奖励荣誉:

2003年,第二届天津大学学生科学奖,天津大学;

2004年,第七届谈家桢生命科学奖学金一等奖,复旦大学及杭州九源基因公司;

2008年,全国优秀博士学位论文提名及天津市优秀博士学位论文,教育部、天津市;

2011年,教育部新世纪优秀人才,教育部;

2012年,香江学者奖,香港学者协会&中国博士后管理委员会;

2012年,第十三届霍英东青年教师奖,霍英东教育基金会;

2013年,“基因与蛋白质生物信息学研究中的新算法与新发现”获四川省科技进步奖(理论学科组),主持,四川省人民政府;

2015年,电子科技大学十二五先进科研工作者;

2018年,四川省有突出贡献的优秀专家;

2018年,天府万人计划“科技菁英”;

2018年,四川省高等教育教学成果奖二等奖,参与。


近年作为通讯作者的代表性论文:

1.Dong C#, Jin YT#, Hua HL, Wen QF, Luo S, Zheng WX, Guo FB* (2020) Comprehensive review of the identification of essential genes using computational methods: Focusing on feature implementation and assessment. Brief Bioinform. 21(1). 171–181.

2. Liu S, Du MZ, Wen QF, Kang J, Dong C, Xiong L, Huang J, Guo FB* (2018) Comprehensive exploration of the enzymes catalysing oxygen-involved reactions and COGs relevant to bacterial oxygen utilization. Environ Microbiol. 20(10):3836-3850.

3.  Dong C#, Hao GF#, Hua HL, Liu S, Labena AA, Chai GS, Huang J, Rao NN, Guo FB* (2018) Anti-CRISPRdb: a comprehensive online resource for anti-CRISPR proteins. Nucleic Acids Res. 46(D1): D393–D398.

4.  Du MZ, Wei W, Qin L, Liu S, Zhang AY, Zhang Y, Zhou H, Guo FB* (2017) Co-adaption of tRNA gene copy number and amino acid usage influences translation rates in three life domains. DNA Res. 24(6):623-633.

5. Wei W#, Gao F#, Du MZ, Hua HL, Wang J, Guo FB* (2017) Zisland Explorer: detect genomic islands by combining homogeneity and heterogeneity prop erties. Brief Bioinform. 18(3):357-366.

6. Guo FB*, Dong C, Hua HL, Liu S, Luo H, Zhang HW, Jin YT, Zhang KY. (2017) Accurate prediction of human essential genes using only nucleotide composition and association information. Bioinformatics. 33 (12): 1758-1764.

7.   Hao GF#, Jiang W#, Ye YN, Wu FX, Zhu XL, Guo FB*, Yang GF*(2016) ACFIS: a web server for fragment-based drug discovery. Nucleic Acids Res. 44(W1):W550-6.

8.  Hua ZG, Lin Y, Yuan YZ, Yang DC, Wei W, Guo FB* (2015) ZCURVE 3.0: identify bacterial genes with higher accuracy as well as automatically and accurately select essential genes. Nucleic Acids Res 43(W1):W85-90.

9.  Wei W, Ning LW, Ye YN, Li SJ, Zhou HQ, Huang J, Guo FB* (2014) SMAL: A resource of spontaneous mutation accumulation lines. Mol Biol Evol. 31(5): 1302-1308.


招生招聘

热烈欢迎具有生物药学、微生物学、分子生物学与生物化学、基因组学或数理计算机等学科背景,同时有兴趣从事生物信息学交叉研究的本科、硕士、博士以及博士后(包括在读和工作)加入本课题组。有意者请将简历发送至fbguoy@whu.edu.cn 。

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