个人简介：导????师：博士导师,硕士导师
学科专业：生物信息学、精准医学大数据
中山大学中山医学院和精准医学科学中心教授、博导，入选广州市创新领军人才（2019年）、广东省珠江人才计划（2017年）、中山大学****（2016年），现任广东生物信息学会副理事长，国际期刊《精准临床医学》 编委，中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员；海外求学和工作15年，曾任欧洲生物信息研究所（英国剑桥）生物信息学家、高级软件工程师，国际分子生物智能系统会员，国际核酸联合会欧洲部成员，国际蛋白质联盟成员。
主要从事生物信息学和医学人工智能研究，包括生物医学大数据的整合、工具应用大平台的开发、生命组学与疾病表型（医学影像）的关联。曾深度参与多个国际性大型研究项目，设计实施欧洲生物信息研究所生物大数据分析工具应用大平台，被同行视为最闪亮的生物信息平台之一；与世界四大专利局合作，建立了全球最完整的生物序列专利数据库群；设计开发了蛋白序列精确迭代检索引擎 PSISearch系列工具,领跑国际生物序列迭代检索的研究；主持建立了 MicroPhenoDB、ncrPheno、ncRNAvar组学与疾病表型关联数据库群；深度参与国际重大生物信息项目，如国际蛋白数据库 UniProt、国际核酸数据库 ENA/GenBank、基因组数据库 Ensembl Genomes、多序列比对工具 Clustal Omega、大分子功能注释工具InterProScan，为世界范围的生物医学大数据建设和共享作出了积极贡献。主持国家重点研发计划课题和国家自然科学基金项目，国际权威期刊发表论文近30篇，总SCI引用近 5000，Google****引用近1万5千，国际影响广泛。
实验室网站：http://lilab2.sysu.edu.cn/； http://www.liwzlab.cn/
学术论著与教材：
Selected Publication （SCI总引用~5000, Google总引用 ~1万5千）（时间倒序排列）:
Zhang W, Yao G, Wang J, Yang M, Wang J, Zhang H, Li W.? (2020) ncRPheno: a comprehensive database platform for identification and validation of disease related noncoding RNAs. RNA Biol. doi: 10.1080/**.2020.**. PubMed PMID: **. (IF 5.477, 独立通讯)
Yang M, Zhang W, Yao G, Zhang H, Li W.? (2019) Combined alignments of sequences and domains characterize unknown proteins with remotely related protein searchPSISearch2D. Database (Oxford). baz092. (IF 3.683, 独立通讯）
Zhang W, Zhang H, Yang H, Li M, Xie Z and Li W.? (2018) Computational resources associating diseases with genotypes, phenotypes and exposures. Briefings in Bioinf, 20(6):2098-2115. ( IF 9.101, 独立通讯）
The?UniProt?Consortium. (2017) UniProt: the universal protein knowledgebase. Nucleic Acids Res. 45(D1):D158-D169. [ doi: 10.1093/nar/gkw1099. PMID: **; PMCID: PMC**]
Pearson WR, Li W, Lopez R.?Query-seeded iterative sequence similarity searching improves selectivity 5-20-fold.?Nucleic Acids Res. 2016 Dec . PMID: **.
Li W*, Cowley A*, Uludag M, Gur T, McWilliam H, Squizzato S, Park YM, Buso N, Lopez R.?The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework.?Nucleic Acids Res. 2015 Jul;43(W1) W580-4. PMID: **
Li W*, Kondratowicz B, McWilliam H, Nauche S, Lopez R.?The annotation-enriched non-redundant patent sequence databases. Database (Oxford). 2013;2013 bat005. PMID: **
Li W*, McWilliam H, Goujon M, Cowley A, Lopez R, Pearson WR.?PSI-Search: iterative HOE-reduced profile SSEARCH searching.?Bioinformatics. 2012 Jun;28(12) 1650-1651. PMID: **
Sievers F, Wilm A, Dineen D, Gibson TJ, Karplus K, Li W, Lopez R, McWilliam H, Remmert M,??S?ding J, Thompson JD, Higgins DG.?Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega.?Mol Syst Biol. 2011;7 539. PMID: **
Li W*, McWilliam H, de la Torre AR, Grodowski A, Benediktovich I, Goujon M, Nauche S, Lopez R.?Non-redundant patent sequence databases with value-added annotations at two levels.?Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue) D52-6. PMID: **
McWilliam H, Li W, Uludag M, Squizzato S, Park YM, Buso N, Cowley AP, Lopez R. Analysis Tool Web Services from the EMBL-EBI.?Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue) W597-600. PMID: **
Jones P, Binns D, Chang HY, Fraser M, Li W, McAnulla C, McWilliam H, Maslen J, Mitchell A, Nuka G, Pesseat S, Quinn AF, Sangrador-Vegas A, Scheremetjew M, Yong SY, Lopez R, Hunter S.?InterProScan 5: genome-scale protein function classification.?Bioinformatics. 2014 May;30(9) 1236-1240. PMID: **
?Li W*, Gracey AY, Mello LV, Brass A, Cossins AR.?ExprAlign--the identification of ESTs in non-model species by alignment of cDNA microarray expression profiles.?BMC Genomics. 2009;10 560. PMID: **
McWilliam H, Valentin F, Goujon M, Li W, Narayanasamy M, Martin J, Miyar T, Lopez R.?Web services at the European Bioinformatics Institute-2009.?Nucleic Acids Res. 2009 Jul;37(Web Server issue) W6-10. PMID: **
Gracey AY, Fraser EJ, Li W, Fang Y, Taylor RR, Rogers J, Brass A, Cossins AR. Coping with cold: An integrative, multitissue analysis of the transcriptome of a poikilothermic vertebrate. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Nov;101(48) 16970-16975. PMID: **
?
Book Chapters:
Lopez R, Cowley A, Li W, McWilliam H.?Using EMBL-EBI Services via Web Interface and Programmatically via Web Services. Curr Protoc Bioinformatics. 2014;48 3.12.1-50. PMID: **
Li W*, Olohan L, Williams D, Hughes M, Gracey A, Cossins A.?Application of ESTs in microarray analysis.?Methods Mol Biol. 2009;533 289-309. PMID: **.?
获奖及荣誉：广州市创新领军人才（2019年）、广东省珠江人才计划（2017年）；中山大学****（2016年）
项目课题：（1）科技部国家重点研发项目课题《精准医学大数据的整合与注释》，500万，主持；
（2）国自然基金委面上项目《基于“无拼接组装、无参考基因组”的PB量级组学大数据高速“反向检索”新方法及其高移植性、高可视化平台在基因型分型的应用》，主持；
（3）科技部国家重点研发项目子课题《精准医学大数据分析应用方法体系》 120万，参与。
学术兼职：广东省生物信息学会副会长
Precision Clinical Medicine 期刊编委
Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、GPB、Bioinformatics、Database(Oxford ) 期刊评审?
欧洲计算生物学大会（ECCB）成果展示评审
国际分子生物智能系统大会 (ISMB) 会员?
中国人工智能学会生物信息与人工生命专委会委员
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学学会员
曾任
- 国际蛋白联盟 UniProt Consortium 成员
- 国际核酸联合会（ INSDC ）欧洲分部成员
- 协和医科大学医学院客座教授 （2015年）