个人简介：? ? ? ? 王金凯是中山大学通过“****”引进的教授，博士生导师。2005年毕业于武汉大学生命科学学院获得理学学士学位。2010年毕业于中国科学院昆明动物研究所获得遗传学博士学位（师从宿兵研究员）。2010年至2016年分别在美国爱荷华大学（2010~2012）和加州大学洛杉矶分校（2013~2016）邢毅教授实验室从事生物信息学方向博士后研究。2016年获聘中山大学“****”引进人才。2018年入选广东省珠江人才计划“青年拔尖人才”。? ? ? ?
? ? ? ? 目前已经以通讯作者或者（共同）第一作者身份在Nucleic Acids Research（IF=11.1， 两篇）、Nature Methods?(IF: 25.3)、Cell Stem Cell?(IF: 22.4)、Molecular Biology and Evolution?(IF: 13.6)、Genome Biology?(IF: 11.3)、Human Molecular Genetics?(IF: 6.0)等杂志发表论文10篇。
? ? ? ? 主要研究兴趣是利用高通量测序技术结合生物信息学、基因组学和分子生物学的方法研究m6A RNA修饰的调控模式和机理，及其在干细胞、肿瘤等重大生理病理过程中的作用。
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导????师：博士导师,硕士导师
学科专业：生物信息学与分子生物学
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重要学术研究成果与贡献：? ? ? ? m6A RNA甲基化是在mRNA和lincRNA中广泛存在并且可以被去甲基化酶清除的RNA修饰，在哺乳动物中，超过7000个蛋白质编码基因所转录的mRNA含有m6A甲基化修饰，然而这些m6A修饰的功能并不十分清楚。本人与合作者通过对哺乳动物胚胎干细胞的m6A组学以及功能研究发现m6A在胚胎干细胞中动态变化并且在干细胞分化中发挥了关键作用 （Cell Stem Cell, 2014）。
? ? ? ? 由于m6A的动态变化主要表现为甲基化程度的变化，而现有的技术都不能在基因组水平对m6A进行精确和绝对定量，也没有技术能够区分m6A发生在哪些特定的转录本异构体（isoform）上，技术上的欠缺严重阻碍了该领域的继续发展。本人与合作者通过对已有的m6A-seq技术的改进发明了第一种能够对m6A进行全基因组精确和绝对定量的方法（m6A-LAIC-seq）。我们通过新技术首次发现m6A广泛发生于使用近端Poly(A)加尾信号的mRNA上，m6A的这种全新的模式使得它能够与miRNA和RNA结合蛋白协同作用从而更加精细地对RNA进行转录后调控（Nature Methods, 2016）。
? ? ? ? 建立了一套基于m6A共甲基化网络的计算框架来系统地鉴定细胞特异的m6A反式调控因子（论文第一作者为本课题组的安三奇、黄万旭和黄翔）。通过对目前公开的25个不同的细胞系的104个m6A-seq、上百个RNA结合蛋白的CLIP-seq数据和识别序列的系统性整合最终鉴定出32个特异性调控m6A的RNA结合蛋白。并对3个HepG2细胞系特异的m6A的调控因子中的两个成功进行了实验验证。揭示了大量RNA结合蛋白很可能通过特异性调控m6A参与建立细胞特异的m6A甲基化模式 (Nucleic Acids Research, 2020)。
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学术论著与教材：? ? *?并列第一作者；?#?通讯作者 ?本课题组成员加粗显示
Wang J?(2021). Integrative analyses of transcriptome data reveal the mechanisms of post-transcriptional regulation.?Briefings in Functional Genomics.?elab004?(Invited review)
Xia TL, Li X, Wang X, Zhu YJ, Zhang H,?Cheng W, Chen ML, Ye Y, Li Y, Zhang A, Dai DL, Zhu QY, Yuan L, Zheng J, Huang H, Chen SQ, Xiao ZW, Wang HB, Roy G, Zhong Q, Lin D, Zeng YX,?Wang J, Zhao B, Gewurz BE, Chen J, Zuo Z, and Zeng MS (2021). N(6)-methyladenosine-binding protein YTHDF1 suppresses EBV replication and promotes EBV RNA decay.?EMBO Reports?e50128.
Sun X*, Ren Z*, Cun Y, Zhao C, Huang X, Zhou J, Hu R, Su X, Ji L, Li P, Mak KLK, Gao F, Yang Y, Xu H, Ding J, Cao N, Li S, Zhang W, Lan P, Sun H, Wang J # and Yuan P # (2020). Hippo-YAP signaling controls lineage differentiation of mouse embryonic stem cells through modulating the formation of super-enhancers.?Nucleic Acids Res.?https://doi.org/10.1093/nar/gkaa482
An S*, Huang W*, Huang X*, Cun Y, Cheng W, Sun X, Ren Z, Chen Y, Chen W,?Wang J#.?(2020).?Integrative network analysis identifies cell-specific trans regulators of m6A.?Nucleic Acids Research??48(4):1715-1729.
Shi J, Deng Y, Huang S, Huang C,?Wang J, Xiang AP, and Yao C (2019). Suboptimal RNA-RNA interaction limits U1 snRNP inhibition of canonical mRNA 3' processing.?RNA Biology?16(10): 1448-1460.
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Li F, Yi Y, Miao Y, Long W, Long T, Chen S,?Cheng W, Zou C, Zheng Y, Wu X, Ding J, Zhu K, Chen D, Xu Q,?Wang J, Liu Q, Zhi F, Ren J, Cao Q, and Zhao W (2019). N(6)-Methyladenosine Modulates Nonsense-Mediated mRNA Decay in Human Glioblastoma.?Cancer Research?79(22): 5785-5798.
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Zhou C*, Molinie B*, Daneshvar K, Pondick JV,?Wang J, Wittenberghe NV, Xing Y, Giallourakis CC#, Mullen AC#. (2017). Genome-Wide Maps of m6A circRNAs Identify Widespread and Cell-Type-Specific Methylation Patterns that Are Distinct from mRNAs.?Cell Reports, 20(9), 2262–2276.? (IF=8.3)
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Wang J, Pan Y, Shen S, Lin L, Xing Y#. (2017). rMATS-DVR: rMATS discovery of Differential Variants in RNA.?Bioinformatics?33(14), 2216-2217.??(IF=5.8)
Molinie B*,?Wang J*, Lim KS,?Hillebrand R,?Lu ZX,?Wittenberghe?NV, Howard BD,?Daneshvar K,?Mullen AC,?Dedon P,?Xing Y#, Giallourakis CC#. (2016)?m6A-LAIC-seq reveals the census and complexity of the m6A epitranscriptome.?Nature?Methods, 13(8):692-698. (IF=25.3) ?
Batista PJ*, Molinie B*,?Wang J*, Qu K, Zhang J, Li L, Bouley DM, Lujan E, Haddad B, Daneshvar K, Carter AC, Flynn RA, Zhou C, Lim KS, Dedon P, Wernig M, Mullen AC, Xing Y#, Giallourakis CC#, Chang HY#?(2014) m6A RNA modification controls cell fate transition in mammalian embryonic stem cells.?Cell Stem Cell?15(6): 707–719. (IF=22.4)
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Wang J*, Lu ZX*, Tokheim C, Miller SE, Xing Y#. (2015) Species-specific exon loss in human transcriptomes.?Molecular Biology and Evolution?32(2): 481-94. (IF=13.6)
Lin L*#, Jiang P*, Park JW*,?Wang J*, Lu ZX, Lam MPY, Ping P, Xing Y#. (2016) The contribution of Alu exons to the human proteome.Genome Biology?28;17(1):15??(IF=11.3)?
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Wang J*, Ma MCJ*, Mennie AK*, Pettus JM, Xu Y, Lin L, Traxler MG, Jakoubek J, Atanur SS, Aitman TJ, Xing Y#, Kwitek AE#. (2015) Systems biology with high-throughput sequencing reveals genetic mechanisms underlying the metabolic?syndrome in the Lyon hypertensive rat.?Circulation: Cardiovascular Genetics?8(2):316-326. (IF=3.7)
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Zhao Y*, Ji S*,?Wang J*, Huang J#, Zheng P#?(2014)?mRNA-Seq and microRNA-Seq whole-transcriptome analyses of rhesus monkey embryonic stem cell neural differentiation revealed the potential regulators of rosette neural stem cells.?DNA Research?21(5): 541–554. (IF=5.3)
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Li M*, Huang L*,?Wang J*, Su B#, Luo X-J#?(2016) No association between schizophrenia susceptibility variants and macroscopic structural brain volume variation in healthy subjects.?Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. ?171B(2):160-8.?(IF=3.4)
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Wang J*, Cao X*, Zhang Y, Su B#. (2012) Genome-wide DNA methylation analyses in the brain reveal four differentially methylated regions between humans and non-human primates.?BMC evolutionary biology?12(1): 144. (IF=3.4)
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Wang J, Li Y, Su B#. (2008) A common SNP of MCPH1 is associated with cranial volume variation in Chinese population.?Human Molecular Genetics?17(9):?1329-1335. (IF=6.0)
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Li M, Huang L, Li K, Huo Y, Chen C,?Wang J, Liu J, Luo Z, Chen C, Dong Q, Yao YG, Su B, Luo XJ#.?(2016) Adaptive evolution of interleukin-3 (IL3), a gene associated with brain volume variation in general human populations.??Human Genetics.?135(4):377-92.??(IF=5.1)
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Luo X-J, Li M, Huang L, Nho K, Deng M, ...?Wang J, … Su B#. (2012) The Interleukin 3 Gene (IL3) Contributes to Human Brain Volume Variation by Regulating Proliferation and Survival of Neural Progenitors.?PLoS ONE?7: e50375. (IF=3.1)
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Niu AL, Wang YQ, Zhang H, Liao CH,?Wang J, Zhang R, Che J, Su B#. (2011) Rapid evolution and copy number variation of primate RHOXF2, an X-linked homeobox gene involved in male reproduction and possibly brain function.?BMC evolutionary biology?11: 298. (IF=3.4)
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Luo XJ, Diao HB,?Wang J, Zhang H, Zhao ZM and Su B#. (2008) Association of haplotypes spanning PDZ-GEF2, LOC728637 and ACSL6 with schizophrenia in Han Chinese.?J Med Genet, 45(12), 818-826. (IF=5.7)
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Zhou L,?Wang J, Yi Q, Wang YZ, Zhu YG and Zhang ZH#. (2007) Quantitative trait loci for seedling vigor in rice under field conditions.?Field Crop Res?100: 294-301. (IF=2.9)
?招生信息：????????欢迎具有生物信息学、生物化学和分子生物学、基础医学、计算机科学、生物统计学等相关背景且热爱科学研究的同学报考硕士和博士研究生。（报考前请通过电子邮箱与本人联系）
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招聘信息：
? ? ?本实验室常年招聘博士后和专职科研人员，年薪26~36万。欢迎有上述研究背景且有兴趣的博士与本人联系。
? ? （1）要求（符合任何一项者均可申请）：
? ? ? ? ? ?1.??有生物信息学、基因组学相关背景并掌握熟练编程技能。
? ? ? ? ? ?2.??有分子生物学，遗传学、细胞生物学、生物化学或基础医学背景者。
? ? ? ? ? ?3.??有计算机或者生物统计相关背景。
? ? （2）岗位及相关待遇：
? ? ? ? ? ?1，工资和福利待遇按照国家博士后相关规定和中山大学有关规定执行，特聘研究员待遇32万起，特聘副研究员26万起，博士后待遇26万起，上述待遇含五险一金。另课题组根据应聘者的实际能力和工作业绩发放额外奖金。
? ? ? ? ? ?2，子女可入读中山大学附属学校；博士后在站期间，提供博士后公寓；
? ? ? ? ? ?3，成绩优异者在聘期结束后可以通过中山大学“****”转聘为事业单位编制教授/副教授岗位（有安家补贴、启动经费和招生资格）。
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