1996年毕业于浙江大学化工系生物化工专业，获工学博士学位。1996年4月至2005年5月在厦门大学化工与生物工程系任教，任讲师、副教授、教授。1999年7月至2000年8月在美国Cornell大学分子生物与遗传系进修学习。2005年6月调至深圳大学生命科学学院任教至今。
主要研究方向为环境生物技术与生物化工。主持及参加过多项国家自然科学基金、863项目、教育部留学回国人员科研启动基金、省自然科学基金及与企业合作科研课题的研究。目前的研究内容主要包括3个方面：1）利用分子生物学技术构建高性能微生物富集水体中的重金属离子。目前已成功构建出对汞、镍、镉三种重金属离子具有高选择性高富集容量的基因工程菌，研究结果表明所构建的工程菌与野生宿主菌相比，无论在对目标重金属离子的选择性还是对环境因素的适应能力上都有较大提高。2）受污染水体的生物脱氮除磷技术研究。针对活性污泥法同步脱氮除磷效率不高的问题，本课题组综合活性污泥和藻细胞分别在去除COD和氮磷方面各自的优势，研究开发一套固定化藻菌耦合处理系统以实现对受污染水体中COD和氮磷的同步高效去除。3）市政剩余污泥的资源化和减量化技术研究。市政剩余污泥的处理处置已成为亟待解决的问题，目前广泛采用的填埋法已不能满足要求。剩余污泥含有丰富的有机物质和微生物，通过污泥中的微生物把有机物质转化成高附加值产品，就可同时实现对剩余污泥的资源化和减量化。课题组在这方面已开展了一些探索性研究，并将在今后的工作中进一步深入考察污泥资源化和减量化的过程机理和调控措施。目前已在国内外学术刊物上共发表论文60余篇（其中SCI收录18篇，EI收录17篇），申请专利2项。合计指导硕士研究生8名，其中5名已毕业并获得硕士学位。
近年来主要研究论文
1）DENGX,HuZL,YiXE.continuoustreatmentprocessofmercuryremovalfromaqueoussolutionbygrowingrecombinantE.colicellsandmodelingstudy.JournalofHazardousMaterials.2008,153(1-2):487-492.
2）DENGX,YiXE,LiuG,Cadmiumremovalfromaqueoussolutionbygene-modifiedEscherichiacoliJM109,JournalofHazardousMaterials,2007,139(2):340-344.
3）LuYH,DENGX,ChengZJ,LiQB,LiuG,Enhancedproductionofhybridextracellularbeta-glucanasebyrecombinantE.coliUsingexperimentaldesignmethod.ChineseJournalofChemicalEngineering.2007,15(2):172-177.
4）ZhengSZ,HeN,DENGX,LiQB,HeZ,LuYH,OptimizationofmediumcomponentsforplasmidproductionbyrecombinantE.coliDH5αpUK21CMVβ1.2.BiotechnologyandBioprocessEngineering,2007,12:213-221.
5）DENGX,ZhengYC,LiQB,EffectofAmbientConditionsonSimultaneousGrowthandBioaccumulationofMercuricIonbyGeneticallyEngineeredE.coliJM109,JournalofHazardousMaterials,2006,136(2):233-238.
6）DENGX,LiQB,LuYH,HeN,GeneticEngineeringofE.coliSE5000andItsPotentialforNickelBioremediation.ProcessBiochemistry,2005,40:425-430
7）ZhaoXW,ZhouMH,LiQB,DENGX(Correspondingauthor),SimultaneousmercurybioaccumulationandcellpropagationbygeneticallyengineeredE.coli,ProcessBiochemistry,2005,40:1611-1616.
8）DENGX,LiQB,LuYH,SunDH,HuangYL,BioaccumulationofNickelfromAqueousSolutionsbyGeneticallyEngineeredEscherichiacoli.WaterResearch,2003,37:2505-2511.
9）AndreG,KanchanawongP,PalmaR,ChoH,DENGX,ComputationalandExperimentalStudiesoftheCatalyticMechanismofThermobifidafuscacellulaseCel6A(E2).ProteinEngineering,2003,16(2):125-134.
10）DENGX,WilsonDB,SeparationofMercuryfromElectrolyticWastewaterbyGeneticallyEngineeredE.coli.AppliedMicrobiologyandBiotechnology,2001,56:276-279.
11）邓旭，魏斌，胡章立.利用莱茵衣藻去除污水中氮磷的研究，环境科学,2010,31(6):81-85.
12）邓旭，魏斌，胡章立，转基因衣藻对重金属的抗性及对镉离子的富集，生物技术，2007,17(6):66-68.
13）程志敬，邓旭（通讯作者），卢英华，何宁.重组大肠杆菌生产β－1,3-1,4－葡聚糖酶培养基优化研究，工业微生物，2006,36(2):26-30.
14）邓旭，郑杨春，李清彪，卢英华.基因工程技术在重金属废水处理中的应用，水处理技术，2005,31(5):62-65。
15）赵肖为，周茂洪，卢英华，邓旭（通讯作者）.镉离子的生物富集，离子交换与吸附，2005,21(4):311-316.
16）赵肖为，李清彪，卢英华，邓旭（通讯作者）.高选择性基因工程菌E.coliSE5000生物富集水体中的镍离子，环境科学学报，2004,24(2):11-16.
17）郑阳春，邓旭（通讯作者），氨氮废水生物脱氮研究进展，化工环保，2004,24:141-144.
18）邓旭，李清彪，孙道华，黄益丽，王琳.具超强汞富集能力基因工程菌生长情况的研究，工业微生物，2003,33(3):11-15。
19）邓旭，李清彪，卢英华，孙道华，黄益丽.基因工程菌E.coliJM109富集废水中镍离子的研究。生物工程学报，2003,19(3):343-348。