所系名称
中国科学院南海海洋研究所，中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室
性别
男
专业名称
海洋生物学
技术职务
研究员
行政职务

Mail地址
ygzhu@scsio.ac.cn
指导博士生总数
0
指导硕士生总数
2
通讯地址
广州市新港西路164号标本楼401
目前博士生数
0
目前硕士生数
2
邮政编码
510301
研究方向
海洋微生物次级代谢产物生物合成机制研究和因组信息指导的海洋微生物隐性次级代谢产物挖掘。

研究工作
鉴定cyanogramide、浅蓝霉素A、piericidin A1、heronamides和trichostatin等多个活性次级代谢产物生物基因簇。阐明P450氧化酶、黄素氧化酶、氨基转移酶、氨基水解酶和甲基转移酶等10余个生物合成酶功能，包括在cyanogramide合成途径中阐明p450氧化酶通过碳正离子介导的半频哪醇重排生成氧化吲哚螺环（Angew Chem Int Edit，2020）；在浅蓝霉素A的合成途径中发现氧化酶CrmK介导的底物补偿机制（Chem Sci，2016）和阐明二元组分单加氧酶催化肟基形成机制（J Am Chem Soc，2013）。通过组合生物合成获得80多个新结构天然产物。
获奖情况
（1）广东省特支计划“科技创新青年拔尖人才”（2019）
（2）中科院南海海洋研究所“南海新星”（2017）
（3）农业微生物学国家重点实验室优秀毕业生（2011）
指导研究生情况
硕士研究生：彭璟（2018），龙婷（2019）
个人简介
学习经历
2006.09-2011.06 华中农业大学 微生物学 博士
2003.09-2006.07 河北大学 微生物学 硕士
2000.09-2003.07 山东大学 生物科学 学士
1997.09-1999.07 济宁学院 生物教育
工作经历
2020.01-至今 中国科学院南海海洋研究所 项目研究员
2019.03-2019.09 加州大学洛杉矶分校 访问学者
2013.13-2019.12 中国科学院南海海洋研究所 副研究员
2011.07-2013.12 中国科学院南海海洋研究所 助理研究员


科研成果
论文发表（第一或通讯作者）
(13) Zhu, Y^#., Zhang, Q^#., Fang, C., Zhang, Y., Ma, L., Liu, Z., Zhai, S., Peng, J., Zhang, L., Zhu, W*, Zhang, C*. Refactoring the concise biosynthetic pathway of cyanogramide unveils a P450 enzyme-catalyzed spirooxindole formation. Angewandte Chemie International Edition, 2020, DOI: 10.1002/anie.. (IF=12.257)
(12) Liu, W^#., Nannu, V. G^#., Liu, Z., Zhang, Q., Jiang, X., Ma, L., Zhang, W., Zhang, C*., Zhu, Y*. Heterologous expression of the trichostatin gene cluster and functional characterization of the N-methyltransferase TsnB8. Organic & Biomolecular Chemistry, 2020, DOI: 10.1039/d0ob00617c. (IF=3.490)
(11) Huang, C., Yang, C., Zhu, Y*., Zhang, W., Yuan, C., Zhang, C*. Marine Bacterial Aromatic Polyketides From Host-Dependent Heterologous Expression and Fungal Mode of Cyclization. Frontiers in chemistry, 2018, 6, 528. (IF=3.782)
(10) Zhu, Y^#., Picard, M^#., Zhang, Q., Barma, J., Després, XM., Mei, X., Zhang, L., Duvignaud, JB., Couture, M., Zhu, W., Shi, R*., Zhang C*. Flavoenzyme CrmK Mediated Substrate Recycling in Caerulomycin Biosynthesis. Chemical Science, 2016, 7(8): 4867-4874. (IF=9.556)
(9) Zhu Y^#., Xu J^#., Mei X^#., Peng Z., Zhang, L., Zhang, Q., Zhang, G., Zhu, W*., Liu, J*., Zhang, C*. Biochemical and Structural Insights into the Aminotransferase CrmG in Caerulomycin Biosynthesis. ACS Chemical Biology, 2016, 11(4): 943-952. (IF=4.374)
(8) Wang, P^#., Zhu, Y^#., Zhang, Y., Zhang, C., Xu, J., Deng, Y., Peng, D., Ruan, L., Sun, M*. Mob/oriT, a mobilizable site-specific recombination system for unmarked genetic manipulation in Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus. Microbial Cell Factories, 2016, 15(1): 108. (IF=4.402)
(7) Zhu, Y^#., Zhang, W^#., Chen, Y., Yuan, C., Zhang, H., Zhang, G., Ma, L., Zhang, Q., Tian, X., Zhang, S., Zhang, C*. Characterization of Heronamide Biosynthesis Reveals a Tailoring Hydroxylase and Indic ates Migrated Double Bonds. ChemBioChem. 2015. 16(14): 2086-2093. (IF=2.593)
(6) Fu, P^#., Zhu, Y^#., Mei, X., Wang, Y., Jia, H., Zhang, C*., Zhu, W*. Acyclic Congeners from Actinoalloteichus cyanogriseus Provide Insights into Cyclic Bipyridine Glycoside Formation. 2014. Organic Letters, 16(16): 4264-4267. (IF=6.555)
(5) Chen, Y., Zhang, W., Zhu, Y*., Zhang, Q., Tian, X., Zhang, S., Zhang, C*. Elucidating hydroxylation and methylation steps tailoring piericidin A1 biosynthesis. 2014. Organic Letters, 16(3): 736-739. (IF=6.555)
(4) Zhu, Y., Zhang, Q., Li, S., Lin, Q., Fu, P., Zhang, G., Zhang, H., Shi, R., Zhu, W*., Zhang, C*. Insights into Caerulomycin A Biosynthesis: a Two-Component Monooxygenase CrmH-Catalyzed Oxime Formation. Journal of the American Chemical Society. 2013. 135(50): 18750-18753. (IF=14.695)
(3) Zhu, Y.,Fu, P., Lin, Q., Zhang, G., Zhang, H., Li, S., Ju, J., Zhu, W*., Zhang, C*. Identification of caerulomycin a gene cluster implicates a tailoring amidohydrolase. Organic Letters. 2012, 14(11): 2666-2669. (IF=6.555)
(2) Zhu, Y., Shang, H., Zhu, Q.,Ji, F., Wang, P., Fu, J., Deng, Y., Xu, C., Zheng, J., Zhu, L., Ruan, L., Peng, D., Sun, M*. Complete Genome Sequence of Bacillus thuringiensis Serovar finitimus Strain YBT-020. Journal of Bacteriology. 2011, 193(9): 2379-2380. (IF=3.234)
(1) Zhu, Y., Ji, F., Shang, H., Zhu, Q., Wang, P., Xu, C., Deng, Y., Sun, M*. Gene Clusters Located on Two Large Plasmids Determine Spore Crystal Association (SCA) in Bacillus thuringiensis Subsp. finitimus Strain YBT-020. PLoS One. 2011, 6(11): e27164. (IF=2.776)
授权专利
(1) 张长生，朱义广，张文军，陈耀龙，袁呈山，张海波，张光涛，张庆波。一种大环内酰胺类化合物heronamides的生物合成基因簇及应用，授权号：ZL9.0
(2) 张长生，张光涛，张文军，朱义广，袁呈山，张庆波，张海波，张丽萍。一种帕克特酰胺生物合成基因簇及其应用，授权号：ZL4.X
(3) 张长生，杨春芳，黄春帅，张文军，朱义广，一种芳香聚酮类非典型角环素fluostatins 的生物合成基因簇及其应用，授权号：ZL4.7
(4) 张长生，李慧贤，张庆波，李苏梅，朱义广，张光涛，张海波，田新朋，张偲，鞠建华，厦霉素A和氧厦霉素的生物合成基因簇及其应用，授权号：ZL4.X