2003年7月，学校开始筹建人文社科学院，由原社会科学部和外语教研室组建而成。经过一年的建设，2004年8月，人文社科学院正式挂牌，同年9月开始招收首届英语专业（医药方向）本科生。2005年11月学校撤消社会科学部，成立思想政治理论课教学部，与人文社科学院合署，实行两块牌子一套班子的管理体制。

　　学院设有科学技术哲学和思想政治教育硕士点2个，英语（医药方向）本科专业1个，有硕士研究生11人，本科生230人。学院下设马克思主义基本原理教研室、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想概论教研室、中国近现代史教研室、思想道德修养与法律基础教研室、自然辩证法教研室、形势与政策教研室、大学英语教研室、英语专业教研室、研究生英语教研室、日语教研室共10个教研室和1个语言实验室。目前，全院承担的课程主要包括全校大学生思想政治理论课程、公共外语课程和本院硕士点专业课、英语专业课等共计约76门课程。学院拥有多功能语音实验室12间，实验室面积共计 1800平方米 ，设备价值约700万元。设有中英文图书资料室各一间，有图书、期刊约1.3万册，每年订期刊120多种。

　　学院现有教职工80人，另有外籍教师5人,专任教师中有教授、研究员5人（外聘3人）、副教授20人、讲师34人、助教6人；教师中有博士学位6人、硕士学位46人、硕士研究生导师10人，已初步形成了一支年龄结构、学缘结构合理，学历层次较高，业务能力较强的高素质师资队伍。近年来，共有3人次被评为广东省“南粤教坛新秀”，1人被评为广东省马列主义理论课和思想品德课优秀教师。

　　科学技术哲学硕士点是全国医学院校最早的科学技术哲学硕士点，设有“医学与哲学”、“科技哲学与科技管理”两个研究方向，现有硕士生导师4人。截至2008年9月，已招收 16届共56名硕士研究生，毕业生分布于教育、党政机关、科研机构、企事业管理等部门。“自然辩证法”课程曾被列入广东省首批重点课程，“科学技术哲学”是校级重点学科，《自然辩证法教学成果及其应用》曾获广东省优秀教学成果二等奖。

　　思想政治教育硕士点于2005年批准设立，2007年正式招生，现有硕士研究生11人。设有“思想政治教育理论与实践”、“学校德育与比较思想教育”、“马克思主义与社会思潮”、“马克思主义与当代社会发展问题”、“邓小平理论与社会主义经济建设”等五个研究方向。