性别：男
职称：正高级工程师
学历：博士
电话：
传真：
电子邮件:nie_jinfu@gibh.ac.cn
通讯地址广州市科学城开源大道190号
简历：
· 跨学科的科研，教学及个体化医疗实际工作经验· 跨国公司的产品开发，生产，质量控制，销售和企业管理经验
· 发表24篇高水平科学论文，平均影响因子8.6 , 他引4000余次。
· 16年生物及医疗信息学工作经历，具备丰富的数据分析、数据可视化和生物信息工具的开发及应用经验
· 4年精准医疗科研及临床分析解读经验，领导的生物信息团队帮助梅奥科研人员发表近百篇高水平论文
· 高通量云计算方面有丰富的经验，对多个分布式计算系统有深入的了解（LSF，PBS，SGE，和Condo）
· 熟悉人类基因组和肿瘤临床疾病的共享数据库资源
· 化学和计算机双硕士
中国科学院广州生物医药与健康研究院，广州(2018-至今)
超算中心正高级工程师
生物信息分析团队负责人（2013 - 2016）
梅奥诊所个体化医学中心，美国明尼苏达州 罗切斯特市
· 组建壮大生物信息分析团队由7人发展到30人
· 改写ChIP-Seq自动化分析软件，使分析时间从18小时降到2小时以内
· 开发ChIP-Seq和RNA-Seq的自动化整合软件，该软件被广泛应用于梅奥临床样品的分析
· 第一作者发表RNA-Seq基因表达的完整性评分系统，这一系统可以有效纠正由于RNA样本的降解（如FFPE样品）引起的表达偏差
生物信息客座研究员 (2011 - 2015)
中国科学院广州生物医药与健康研究院，广州
· 策划并实施生物信息学研究团队的建设，包括生物信息计算机资源的配置和软件的应用
· 为多篇高水平科技论文包括Nature method，Nature Genetic 提供了关键性的生物信息支持。
资深计算生物专家（2006 - 2012）
威斯康辛大学，莫格里奇研究院 再生生物学中心。 威斯康辛州，麦迪逊市
· 帮助中心组建生物信息学研究团队
· 为划时代的人类首次诱导干细胞的研究提供关键性的生物信息支持，成果发表在2007 年《科学》杂志
· 与实验室科学家密切合作开发高通量的单细胞基因测序技术
· 优化Illumina的数据处理软件使其能够应用于自制DNA文库的分析
· 设计NimbleGen高分辨率CGH芯片 检测在诱导干细胞编辑过程中的CNV 变化
· 开发TF -Cluster工具，可以通过多个样本的基因表达数据鉴定基因控制的生物组群
高级应用软件开发团队负责人（2000 - 2005）
威斯康星医学院生物信息学研究中心 威斯康星州，密尔沃基市
· 开发VCMAP（比较基因组学工具），广泛应用于工业界和学术界
· 用VCMAP构建大鼠，小鼠和人类基因组的比较基因组学图谱
· 建立大鼠高密度辐射杂交图(RHMAP), 并成功应用于大鼠的基因组的组装
· 建立一个高性能的60节点集群计算系统，用于大鼠基因组的注释和分析
· 开发基因注释工具允许用户从多个数据库中检索信息，包括Swiss-Prot、LocusLink，UCSC，和KEGG
· 与UCSC合作维护安装在威斯康星医学院的UCSC基因组浏览器镜像站点
研发部经理，厂长，副总经理（1993 - 1998）
艺康化工有限公司（ECOLAB, LLC)/来今化工有限公司， 中国，上海
· 在中国市场开发和推出了200多个化工产品
· 组织申报并成为中国首例通过ISO9001资格认证的化工企业
环境管理系讲师，山西经济管理学院 山西 太原 (1985-1987， 1990-1993)
组建环境管理系并教授第一届学生
计算机及数理统计硕士： 1998-2000, Marquette University, Milwaukee, WI. USA
环境化学硕士： 1987-1990， 河北大学， 河北省保定市
化学学士： 1981-1985， 山西大学， 山西省太原市
