广东医学院药学院位于广东医学院东莞校区，筹建于2003年，2004年学校成立药学院筹建小组。2004年9月首次招生，共招收药学专业普通本科生203名，2005年5月，学校对筹建组进行调整。2006年3月28日，广东医学院药学院正式成立，2006年7月4日，正式揭牌。毕业生可面向医院，药品生产、检验、流通、使用等领域岗位择业，从事药物分析、药物设计、药物合成，药物制剂制备，临床合理用药，医院药房管理和药品监督等方面工作。

　　师资队伍
　　
　　2005年5月，为了完善学校新办药学的教学机构，确保新办专业的办学质量，学校成立药物分析与药物化学、药剂学、临床药理学、药用植物与生药学等4个教研室，承担了广东医学院药学院早期的专业教学工作。2006年12月，经资源进一步整合重组，成立了药学教研室，药物分析与药物合成教研室，药剂学教研室，并把药理学教研室、化学教研室纳入药学院管理，承担起硕士研究生、本科生、专科生等多层次近20门课程 　　的教学任务，拥有一支结构合理、梯队整齐、专业素质较高、发展趋势良好的师资队伍。现有教职工63人，其中教授4人、副教授18人，具有博士学位者12人，35岁以下青年教师具有硕士以上学位者已达100%，是一个集教学、科研与开发、社会服务为一体的教育机构职工63人，其中教授4人、副教授18人，具有博士学位者12人，35岁以下青年教师具有硕士以上学位者已达100%，是一个集教学、科研与开发、社会服务为一体的教育机构。
　
　　专业设置
　　
　　广东医学院药学院以本科教育为主，有药学专业和药物分析、临床药学、医药贸易三个专业方向，学制四年。培养适应我国社会主义现代化建设及医药卫生事业发展需要，具有职业道德、创新精神和实践能力，具有较高素质和能力，具备药学学科基本理论、基本知识和实验技能，能在医疗卫生部门、药品监督与管理部门、医药院校、医药科研机构、医药企业等单位从事药物分析、药物设计、药物合成，药物制剂制备，临床合理用药，医院药房管理和药品监督等方面工作的专门人才。 　　广东医学院药理学科1996年以来一直是学校的重点学科，2003年被确定为广东省高等院校重点学科的扶持学科，药理学科1997年开始招收首届硕士研究生，至今已有10届。现有硕士研究生导师26名（包括本院及院外兼职导师），2003年以来，共招收硕士研究生59人，已授予硕士学位共48人。近三年共有6位硕士研究生获得广东省“南粤优秀研究生”的光荣称号。

　　科研工作
　　
　　广东医学院药学院在研的省级科研项目11项，市级、校级科研项目共65项，2003年以来，在国内外学术刊物上发表论文295篇，参编教材5部，申请国家发明专利33项，已获授权专利4项。 　　抗骨质疏松药理学研究与世界同步，具国内先进水平，已建立起抗骨质疏松药效学评价的科研平台，承接国内外骨药理评价项目。拥有红外光谱仪、气相色谱仪、电化学分析系统、高效液相色谱仪等先进科学仪器和中药与新药开发等多个科研平台，为药学院的发展奠定了良好的基础。药学院所属人员近五年来主持或参与的科研课题达56项，在国内外专业期刊发表研究论文 293篇，其中SCI、EI、ISTP收录21篇。出版学术专著 4 部，获省部级、厅市级各类科技奖10项，申请国家发明专利30多项，获授权专利13项，研究与正在开发的创新药物10多项。 　　广东医学院药学院负责的中药与新药研究所是为全校师生提供药物研究的科研平台，也接受校外的科研课题，主要研究抗骨质疏松新药，皮肤外用药，抗肿瘤药，抗动脉硬化药，抗糖尿病药，抗肝硬化药，平喘药及减肥药，还研究多种保健食品。