主要从事海洋生态与渔业环境保护研究，重点研究领域有水生生物污染效应、养殖环境容量与调控修复技术、渔业生境与生物多样性保护、渔业生态环境监测与水产品质量检测。
　　1）水生生物污染效应：研究外源性环境污染物中有毒有害物质（人工合成化学物质和渔用药物）对渔业生物的毒理学和毒性效应；探索研究有效的毒性诊断、安全风险评估与水产品质量安全保障技术。
　　2）养殖环境容量与调控修复技术：研究典型浅海养殖与养殖池塘环境污染机制，建立养殖生态环境安全评价与预警系统；研究增养殖水域环境容量、养殖容量及其优化技术；研究和开发养殖环境污染综合调控及修复技术。
　　3）渔业生境与生物多样性保护：研究气候和人类活动影响下的渔业生物多样性长期变动过程和机制研究，建立典型渔业生态系统健康评价指标体系；研究人工鱼礁生态系统对渔业生物和生物资源的养护效果及评价技术；开展海洋保护区与珍稀水生野生动物调查，建立相应的保护与绩效评估技术研究。
　　4）渔业生态环境监测与水产品质量检测：研究建立渔业生态环境与水产品质量安全风险预警指标体系和综合评价方法；研究无公害水产品产地环境、质量划区和管理技术；研究水产品中药残检测技术和质量标准；研究建立渔业生态环境和水产品质量管理地理信息系统。
　　
　　
　　
　　　　　　　
　　　　　　 　　　　　　　　海湾养殖生态环境监测　　　　　　　　外海渔场生态环境调查
　　

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　保护区水产资源与生态环境综合调查

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　海湾养殖生态环境调控与修复实验

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　农业部牛盾副部长等领导视察渔业环境研究室

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　先进的仪器设备
　　
　　
　　主要成员：
　　贾晓平　研究员　Jxp60@tom.com
　　林  钦　 研究员　linqinscs@21cn.com
　　李纯厚　研究员　scslch@163.com
　　黄洪辉　研究员/博士　huanghh@scsfri.ac.cn
　　李刘冬　研究员　168LLd@163.com
　　甘居利　研究员　ganguli@163.com
　　蔡文贵　研究员　cai-wengui@163.com
　　陈培基　研究员　cpjcx@126.com
　　杜飞雁　副研究员/博士　feiyanegg@163.com
　　王增焕　副研究员　zh-wang1211@163.com
　　齐占会　副研究员/博士　qizhanhui@scsfri.ac.cn
　　徐姗楠　副研究员/博士　xushannan@scsfri.ac.cn
　　戴  明　 助理研究员　daimmy@163.com
　　廖秀丽　助理研究员　xiuliliao@163.com
　　陈海刚　助理研究员　hgchenes@scsfri.ac.cn
　　马胜伟　助理研究员　mashengwei@scsfri.ac.cn
　　张  喆　 助理研究员/博士　zhangzhe@scsfri.ac.cn
　　刘  永　 助理研究员/博士　liuyong@scsfri.ac.cn
　　刘华雪　助理研究员/博士　liuhuaxue@scsfri.ac.cn
　　张林宝　助理研究员/博士　zhanglinbao1984@163.com
　　谷阳光　助理研究员/博士　sunshinegu@scsfri.ac.cn
　　林  琳　 博士后　linlinbio@163.com
　　黄  珂　 助理研究员　xiamike@163.com
　　柯常亮　助理研究员　kechangliang@scsfri.ac.cn
　　古小莉　助理研究员　lilet_ku@163.com
　　肖雅元　研究实习员　xiaoyayuan@scsfri.ac.cn