药学院创办于1984年，现有中药学、药学、药物制剂、制药工程、市场营销（药品营销方向）、食品科学与工程6个本科专业；中药学、药学2个一级学科硕士点，方剂学二级学科硕士点，中药学专业学位硕士点。中药化学、方剂学两个国家中医药管理局重点学科，中药学、方剂学两个省级重点学科。《中药化学》、《中药学》、《分析化学》、《方剂学》、《中药药理学》、《中药制剂分析》六门省级精品课程。中药学为福建省研究生教育创新基地、福建省特色专业、福建省级人才培养创新实验区；方剂学教学团队为福建省优秀创新人才团队。

　　学院拥有一座总面积11000平方米的实验楼，一个1500多种中药、800多种方剂的中药标本室，一个100亩的药用植物园――时珍园；拥有3个国家中医药管理局二级实验室、1个福建省高等学校重点实验室、1个福建省高等学校实验教学示范中心、1个福建省中药研究开发工程实验室、1个福建省中药产业技术开发基地、1个福建省中药临床前研究与质量控制工程技术研究中心、1个福建省中药制剂与质量控制工程技术研究中心、3个福建省卫生厅重点研究室等科研平台、1个闽产中药研发科技平台。

　　学院现有教职工109人，其中高级职称44人；美国哈佛大学访问学者2人，美国北卡罗来纳大学访问学者1人，有研究生200多名，本科学生1600多名。

　　为了培养高质量全方位人才，我院与福建师范大学生命科学学院联合创办制药工程专业；与台湾嘉南药理科技大学联合培养食品科学与工程专业学生。

　　药学院人，秉承厚德、博学、继承、创新的精神，解放思想，开拓进取，坚持以中医药为主，多学科协调发展，各专业建设突显特色，集医学、理学、工学和管理学为一体并相互交叉、相互渗透，培养了一批批中药研究开发与应用的高级人才，为服务海峡西岸经济区建设做出贡献。