福建医科大学医学检验系成立于1984年，其培养目标是：培养具有基础医学、临床医学、医学检验等方面的基本理论知识和基本能力，能在各级医院、血站及防疫等部门从事医学检验及医学类实验室工作的医学高级专门人才。1994年被批准为“临床检验诊断学”硕士学位授权点。
　　
　　医学检验系现有教职员工19人，兼职教师30人，拥有一支优秀的师资队伍，其中教授5人，副教授8人，博士生导师2人，硕士生导师7人，国家级专家2人，10余人在各类学术团体中担任各级职务，省级优秀专家2人，校学科带头人1人。
　　
　　医学检验系设有4个教研室，1个省医学检验中心，1个中心实验室。承担了硕士研究生、本科生、新高职、成人专科等不同层次的教学工作，开设了17门课程，还承担了全省各医疗单位在职检验人员的继续教育工作。
　　
　　1991年以来获国家科技进步二等奖1项，省科技进步奖二等奖1项、三等奖4项，省教学成果奖2项。