含有D型氨基酸的新型毒肽--芋螺马芬在pH 5的溶液结构
外文标题:Solution Structure of Conomarphin, a Novel Conopeptide Containing D-Amino Acid at pH 5
文献类型:期刊
作者:黄飞娟[1]
机构:中国人民大学化学系,北京,100872;北京大学物理化学研究所,北京,100871
通讯作者:Du, WH (reprint author), Renmin Univ China, Dept Chem, Beijing 100872, Peoples R China.
年:2008
期刊名称:物理化学学报影响因子和分区
卷:24
期:9
页码范围:1558-1562
增刊:增刊
学科:物理化学
收录情况:SCI(E)(WOS:000259521300005)
所属部门:化学系
语言:中文
ISSN:1000-6818
链接地址:http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_wlhxxb200809005.aspx
DOI:10.1016/S1872-1508(08)60064-9
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基金:国家自然科学基金; 教育部科学技术研究重点项目; 国家重点基础研究发展计划(973计划)
关键词:芋螺马芬;芋螺肽;D-苯丙氨酸;NMR溶液结构;pH敏感
摘要:从大理石芋螺毒液中分离得到一种新型的含有D型氨基酸,并属于M超家族的芋螺毒素--芋螺马芬.应用2D NMR方法测定了芋螺马芬在pH 5条件下的三维结构,由205个距离约束,8个二面角约束以及两个氢键约束得到了20个最优结构.它们骨架原子的均方根偏差为(0.074±0.029)nm.芋螺马芬在pH 5条件下的二级结构是位于C端的一个短的310螺旋,同时在Ala6附近呈一个较为松散的环状区域.将芋螺马芬在pH 5以及pH 3条件下的溶液结构以及表面电荷进行了比较.尽管芋螺马芬在pH 5条件下的溶液结构与在pH 3条件下的相比,在C端有一个相似的二级结构单元,但是整体的骨架结构截然不同,在pH 5条件下,芋螺马芬的表面结构从正面看起来像一个"曲臂".结构的差异揭示了芋螺马芬对pH相当敏感,预示着它在体内的活性可能与酸度密切相关.
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