中文关键词硫酸盐还原菌硫氧化菌高通量测序克隆文库沉积物 英文关键词sulfate-reducing prokaryotes (SRP)sulfur-oxidizing prokaryotes (SOP)high-throughput sequencingclone librarysediments

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张玉	中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100 海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071	zhangyu201413@163.com
米铁柱	中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100 海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071
甄毓	中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100 海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071	zhenyu@ouc.edu.cn
陈烨	海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071 中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003
付璐璐	海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071 中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003
王勋功	中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100 海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071

中文摘要 硫酸盐还原菌（sulfate-reducing prokaryotes，SRP）和硫氧化菌（sulfur-oxidizing prokaryotes，SOP）在硫的生物地球化学循环中发挥着极为重要的作用.本文以SRP作为高丰富度高多样性菌群代表，针对于SRP所共有的异化型亚硫酸盐还原酶（dissimilatory sulphite reductase，DSR）中的β亚基基因（dsrB），通过克隆文库技术、454高通量测序技术和Illumina高通量测序技术对其群落特征进行比较分析.结果表明，Illumina高通量测序技术优于454高通量测序技术和克隆文库技术，特别在低丰度物种的检测方面，Illumina高通量测序技术具有明显优势.以SOP soxB基因（~750 bp）作为较长基因片段的代表，分别采用454高通量测序技术和Illumina单端高通量测序技术对SOP群落组成和多样性信息进行比较分析，结果表明，454高通量测序技术在读长上的优势并未体现出来，而Illumina单端高通量测序技术优于454高通量测序技术. 英文摘要 Sulfate-reducing prokaryotes (SRP) and sulfur-oxidizing prokaryotes (SOP) play vital roles in the sulfur cycle. The SRP community was used to represent a microbial community with high richness and diversity. The 454 pyrosequencing, Illumina high-throughput sequencing, and traditional clone library methods that target the dissimilatory sulfite reductase β subunit gene (dsrB), which encodes a key enzyme in the sulfate reduction pathway, were used to compare the differences in SRP community characteristics. Comparative analyses suggested that Illumina high-throughput sequencing was a more appropriate method for SRP (high richness and diversity) community studies. The SOP soxB gene (~750 bp) was used as a representative of the long-sequence segment. The 454 pyrosequencing and Illumina high-throughput sequencing methods were used to compare the differences in SOP community characteristics. The results revealed that 454 pyrosequencing did not reflect its advantage of a longer read length; whereas, the Illumina high-throughput sequencing with more numerous and shorter sequence reads was more suitable when the soxB gene was used to investigate the community composition and diversity of SOP.

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