果子狸多态性微卫星位点的筛选及特性分析

王迪*, 张丹*, 熊梦吟, 卜红亮, 王大军, 姚蒙, 李晟, 王戎疆?

北京大学生命科学学院, 北京 100871

收稿日期:2020-03-25修回日期:2020-10-19出版日期:2021-05-20

基金资助:四川西部自然基金会(SNCF/PS/PU103112)资助

Development and Characterization of Polymorphic MicrosatelliteMarkers in the Masked Palm Civet (Paguma Larvata)

WANG Di^*, ZHANG Dan^*, XIONG Mengyin, BU Hongliang, WANG Dajun,YAO Meng, LI Sheng, WANG Rongjiang^?#br#

School of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871

Received:2020-03-25Revised:2020-10-19Published:2021-05-20

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摘要/Abstract

摘要： 以采自四川平武县老河沟自然保护区的一份果子狸(Paguma larvata)组织样品为实验材料, 通过FIASCO法构建微卫星文库, 对250个单克隆进行测序分析, 获得147条含微卫星序列的片段, 微卫星单元重复次数大于10的序列共有42条。据此设计引物 42对, 进一步使用21份果子狸样品检测这些引物的扩增能力和扩增序列多态性, 最终得到5个多态性微卫星位点。同时, 对已发表的13个果子狸微卫星位点进行检测, 发现其中5个位点具有多态性。对这10个位点的特性进行分析, 结果显示它们具有较高的多态性(等位基因数为2~11, 观测杂合度为0.286~0.737, 期望杂合度为0.358~0.906); PID和PID-sib值表明, 在约10⁹个没有亲缘关系的个体或10⁴个有亲缘关系的个体中, 可能发现一对基因型相同的个体, 由于果子狸野外局域种群规模远低于这个量级, 这10个微卫星位点可用于果子狸的个体识别。

引用本文

王迪, 张丹, 熊梦吟, 卜红亮, 王大军, 姚蒙, 李晟, 王戎疆. 果子狸多态性微卫星位点的筛选及特性分析[J]. 北京大学学报自然科学版, 2021, 57(3): 395-400.
WANG Di, ZHANG Dan, XIONG Mengyin, BU Hongliang, WANG Dajun, YAO Meng, LI Sheng, WANG Rongjiang. Development and Characterization of Polymorphic MicrosatelliteMarkers in the Masked Palm Civet (Paguma Larvata)[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Pekinensis, 2021, 57(3): 395-400.





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