摘要： 【目的】测定绿眼赛茧蜂Zele chlorophthalmus线粒体基因组全序列，分析其基因组结构及茧蜂科(Braconidae)部分类群的系统发育关系。【方法】利用Illumina MiSeq二代测序技术对绿眼赛茧蜂的线粒体基因组进行测序，对基因组序列进行拼装、注释，分析其结构特点和碱基组成；基于22种茧蜂科昆虫的COX1蛋白编码基因序列，应用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统发育树，分析绿眼赛茧蜂与茧蜂科其他昆虫的系统发育关系。【结果】绿眼赛茧蜂线粒体基因组全长16 661 bp(GenBank登录号: MG822749)，包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因，共37个基因，以及1个控制区。线粒体基因组有明显的核苷酸组成的偏倚，AT偏正，GC偏负，其A+T含量为82.83%。基因排列顺序与推测的昆虫祖先的序列不完全一致，tRNA基因7处发生重排。13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子，以TAA为终止密码子。在22个tRNA基因二级结构中，除tRNAHis(H)缺失TΨC环和tRNACys(C)仅剩二氢尿嘧啶(DHU)臂和反密码子臂外，其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。基于COX1蛋白编码序列的系统发育分析结果显示，与绿眼赛茧蜂亲缘关系最近的是同属于赛茧蜂属的雪跗赛茧蜂Z. niveitarsis。【结论】本研究首次获得绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列。结果表明绿眼赛茧蜂隶属于优茧蜂亚科(Euphorinae)赛茧蜂属，并支持赛茧蜂属的单系性。
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绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
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