摘要： 【目的】测定和分析甜果螨Carpoglyphus lactis线粒体基因组全序列，并在线粒体基因组水平探讨其在真螨总目(Acariformes)中的系统发育地位，为真螨总目分类及果螨科线粒体基因组研究提供科学依据。【方法】挑取实验室饲养的甜果螨成螨，用传统的酚氯仿抽提法和试剂盒提取法提取甜果螨基因组DNA。然后采用节肢动物或螨类线粒体基因的通用引物PCR扩增出甜果螨线粒体基因cox1, cob, rrnS和nad4-nad5的部分序列；再设计种特异性引物进行Long-PCR扩增和步移法测序，测出甜果螨线粒体基因组全序列。应用SeqMan, SEQUIN 9.0和tRNAscan等生物信息学软件，对甜果螨线粒体基因组的基因结构等进行生物信息学分析。最后基于17种真螨总目螨类的蛋白质编码基因，采用最大似然法构建系统发育树。【结果】甜果螨线粒体全基因组总长为14 060 bp(GenBank登录号: MN073839)，为典型的闭合双链DNA分子，共由37个基因组成，包括13个蛋白质编码基因(PCGs)、22个tRNA基因和2个rRNA基因；甜果螨线粒体基因组还包括1个大的非编码区(large non-coding region, LNR)。系统发育分析结果显示，甜果螨Carpoglyphus lactis属于无气门亚目粉螨总科(Acaroidae)，与椭圆食粉螨Aleuroglyphus ovatus构成一支。粉螨总科(Acaroidae)和薄口螨总科(Histiostomatoidae)聚成一簇，与痒螨股(Psoroptidia)构成姐妹群。【结论】本研究首次获得并分析了甜果螨线粒体基因组全序列。甜果螨与椭圆食粉螨的亲缘关系较近。
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甜果螨全线粒体基因组测序与分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
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