为了分析塔里木马鹿（Cervus elaphus yarkandensis）维生素D受体（VDR）基因的结构和相关功能，本研究从前期研究获得的塔里木马鹿和天山马鹿（C. e. songaricus）皮肤组织转录组测序结果中，获得上调表达的塔里木马鹿VDR基因的序列，对塔里木马鹿VDR基因进行实时荧光定量PCR（qPCR）验证，利用相关软件进行同源性比对、系统进化树构建和生物信息学分析。实时荧光定量PCR结果显示，VDR基因在转录组测序的结果与qPCR的结果中表达趋势一致，均为上调。基于VDR基因同源性比对结果显示，塔里木马鹿与白尾鹿（Odocoileus virginianus，GenBank登录号XM_020889235.1）的遗传距离较近，同源性最高；与褐家鼠（Rattus norvegicus，GenBank登录号NM_017058.1）的遗传距离较远，同源性最低。系统进化树也证实了这个结果。生物信息学分析结果表明，塔里木马鹿VDR蛋白由20种氨基酸组成，分子质量为32.92 ku，理论等电点为5.73，不稳定系数为33.56，总平均亲水性为﹣0.298，脂溶系数94.95，无跨膜区，无信号肽，无O-糖基化位点，有1个N-糖基化位点，有15个磷酸化位点，最有可能位于内质网膜中，二级结构和三级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成，有3个低复杂度区域，无保守结构区域。
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塔里木马鹿维生素D受体（VDR）基因结构 和功能的预测与分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
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