核糖体生物合成是细胞中最复杂和最耗能的基本生命过程之一，在几乎所有的细胞学和生物学过程中均发挥着至关重要的作用。核糖体RNA（rRNA）的转录和转录后加工是核糖体生物合成的重要组成部分，它起始于rDNA的转录，产生的rRNA前体随后经历一系列转录后加工过程，最终产生成熟的rRNA分子。rRNA前体的加工成熟过程已经在芽殖酵母中得到了系统的阐述，此外在爪蟾卵细胞、哺乳动物细胞和拟南芥中也有不同程度的研究。但是对于作物，尤其是单子叶模式植物水稻中rRNA前体加工过程的认知仍然十分有限。
　　中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组系统鉴定了水稻rRNA前体加工成熟过程中的关键剪切位点。发现了水稻中存在两条可变的rRNA前体加工通路：以P-A3前体为代表的“5′ ETS-first”通路和以32S和27S-A2前体为代表的“ITS1-first”通路。详细绘制了首张水稻rRNA前体加工图谱，为后续水稻核糖体生物合成相关研究提供了详实的资料性储备。
　　水稻起源于热带和亚热带地区，对低温异常敏感。我国多数稻作区均有低温冷害发生，严重影响水稻的产量。该课题组深入研究发现低温胁迫会快速抑制水稻rRNA前体的转录后加工过程，表现为P-A3和27S-A2前体丰度的下调和初级转录本45S rRNA的积累。表明水稻在面临短时间低温胁迫时通过在转录后加工水平快速下调核糖体生物合成这一高耗能过程，从而帮助水稻更好地适应低温胁迫。但是长时间低温胁迫带来的翻译系统的下调，会抑制细胞的整体代谢能力，这可能是水稻苗期冷害致死的原因之一。
　　该项研究首次阐述了水稻rRNA前体的可变加工通路，发现水稻核糖体生物合成能够在rRNA的转录后加工层面迅速响应低温胁迫，为作物核糖体生物合成在环境适应中的作用提供了新的线索和调控机制，也为分子模块设计培育水稻耐低温新品种奠定了基础。
　　该研究成果于2018年3月19日在线发表于Plant Physiology（DOI: 10.1104/pp.17.01714）。曹晓风研究组杭润来博士（深圳大学和中科院遗传发育所联合博士后）为该论文第一作者，曹晓风研究员为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、国家重点研发计划和中国博士后基金的资助。