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基于统计差表与加权投票的高精度剪接位点预测

本站小编 Free考研考试/2022-01-02

基于机器学习的高精度剪接位点识别是真核生物基因组注释的关键. 本文采用卡方测验确定序列窗口长度,构建卡方统计差表提取位置特征,并结合碱基二联体频次表征序列;针对剪接位点正负样本高度不均衡这一情形,构建10个正负样本均衡的支持向量机分类器,进行加权投票决策,有效解决了不平衡模式分类问题. HS3D数据集上的独立测试结果显示,供体、受体位点预测准确率分别达到93.39%、90.46%,明显高于参比方法. 基于卡方统计差表的位置特征能有效表征DNA序列,在分子序列信号位点识别中具有应用前景.

PDF全文下载地址:

http://www.pibb.ac.cn/pibbcn/ch/reader/create_pdf.aspx?file_no=20180267&flag=1&journal_id=pibbcn
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