基本信息






杨晟男博导中国科学院分子植物科学卓越创新中心（中国科学院合成生物学重点实验室）
本科毕业于浙江大学化工系（1995）
博士毕业于中国科学院上海生物化学研究所（2000）
中国科学院上海生命科学研究院工作至今
联系方式：syang@sibs.ac.cn
微信公众号：合成生物催化剂工程
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部门/实验室：植生生态所
课题组简况















??????新一代DNA测序与低成本DNA合成技术提供了海量基因资源与快速廉价的基因获取手段，为设计和创制理想的工程细胞提供了近乎无限的可能性。我们实验室的研究方向是开发微生物基因组编辑工具，用于更快地构建或重构细胞以理解其高效功能背后的遗传与生化机制，进而设计新一代的工程细胞，助力绿色化学与生物医药应用。
实验室??累计发表文章过百篇，近5年被他引超千次，2篇进入ESI高被引，基因组编辑工具质粒分发近2000次。与国药集团、浙江医药、Novozymes及课题组毕业生初创公司等国内外上百家企业合作，纤维素乙醇酵母在巴西和美国投入商业应用，在燃料乙醇与氨基酸等领域取得显著经济效益。酶工程成果获上海市科技进步一等奖，孵化公司5家。课题组长杨晟研究员获国务院政府特殊津贴、DuPont Young Professor Award、Novozymes Innovation Award及国家科学基金。
实验室现有研究、工程与支撑系列各1人；博士后1人；博士生3人；硕士生1人及10余位来自合作实验室或企业的客座研发人员。拥有从微孔板到2吨罐的完备实验设施，人均面积高于同类实验室平均水平。??????

















招新启事















??????1. 研究助理：副研究员、特别研究助理或实验师1名。硕士及以上。基本职责为维护实验室技术平台，指导研究生掌握分子生物学技术。高级职责为协助研究组长指导研究生、博士后和研究助理课题；协助撰写相关文章、项目申请书与结题报告的初稿。工资根据上海市同类职位从优执行，住房补贴工作满3年由研究所统一一次性发放??
??2. 博士后：职责为完成高水平论文和/或开展企业合作项目。享受上海市落户绿色通道政策，年薪面议。
??3. 博士生（2020级可竞争与华东理工大学联培名额，2021级的中科院名额请尽早联系）??
??4. 硕博连读生（每两年3名含博士生）??
??欢迎重点高校学业成绩排名前5%的本科生在大三下学期中提交简历，参加夏令营和暑期实验室实习，课题组每年从通过推免生面试的优秀学生中遴选。??????????










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毕业去向
姓名
毕业时间
工作单位
职务

王晶茹
2004硕
基石药业
资深临床科学家

陈茂林
2004硕
青岛汉河动植物药业有限公司
总经理

张燕
2004硕
青岛市食品药品检验研究院
科研中心主任

苏流利
2005硕
Eppendorf公司
产品技术支持经理

范文超
2005硕
浙江华睿生物技术有限公司
洛阳华荣生物技术有限公司
总经理

林欣
2005硕
药明生物抗体开发
助理主任

夏雨
2007博
江南大学食品学院
副教授

郑华宝
2007博
浙江农林大学
教授

王金刚
2008博
浙江华睿生物技术有限公司
副总经理

杨俊杰
2010博
留所工作
副研究员

胡世元
（与姜卫红研究员共同培养）
2010博
赢创德固赛
研发项目经理

刘旭东
2011博后
上海莱士
资深专家

张仙
2011博后
上海合全药物研发有限公司
副主任高级研究员

朱丽
2011博
上海来益生物药物研究开发中心
研发研究员

张大龙
2011博
杭州贝颐药业有限公司
研发研究员

王帅
2011博后
中科院上海应用物理研究所
副研究员

吴辉
2011博后
华东理工大学
教授

柳鹏福
2011博后
浙江工业大学
助理研究员

孙周通
2012博
中科院天津工业生物技术研究所
研究员

刁刘洋
2012博
缮思药业（苏州）有限公司
生物实验室负责人

李键
2012博
安进研发中心
研发研究员

肖晗
2012博
上海交通大学
副研究员

任聪
（与姜卫红研究员共同培养）
2012博
江南大学
副教授

唐玮
2012硕
雅诗兰黛全球总部（纽约）
消费者互动经理

赵蒙
2012硕
美国
求职中

徐舒
2013硕
复朴投资
投资经理

张凝
2015博
安进研发中心
副研究员

闻志强
2016博后
南京理工大学
讲师

段春兰
2016硕
Selleck中国
客户经理

徐晓庶
2017博
斯坦福大学
博后

高书良
（华理陈代杰教授联合培养）
2017博
浙江华睿生物技术有限公司
研发总监

童阳阳
（上师大肖明教授联合培养）
2017硕
枫杨生物研发公司
研发员

陈晓雪
（沈药张怡轩教授联合培养）
2017硕
上海罗氏制药有限公司
高级医药信息顾问

曾哲
2017硕
荷兰瓦赫宁根大学食品微生物
博士在读

章美琴
（上师大肖明教授联合培养）
2017硕
复旦大学上海医学院
博士在读

刘琦
（复旦陈代杰教授联合培养）
2017硕
上海交通大学生命科学学院
博士在读

任晓丹
2018硕
河南平顶山市高中
教学工作

王心
2018博
河南工业大学
讲师

杨海锋
2018硕
浙江华睿生物技术有限公司
研发研究员

江源
2018博
德国
求职中

李琦
2019博
四川师范大学
讲师

刘金乐
2019博
郑州大学
师资博士后

武美贤
2019硕
淮阴师范学院
辅导员





发表论文





https://www.researchgate.net/profile/Sheng_Yang10
1、Zhiqiang Wen, Qi Li, Jinle Liu, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Consolidated bioprocessing for butanol production of cellulolytic Clostridia: development and optimization. Microb Biotechnol. 13(2):410-422
2、Zhiqiang Wen, Minrui Lu, Rodrigo Ledesma-Amaro, Qi Li, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) TargeTron Technology Applicable in Solventogenic Clostridia: Revisiting 12 Years' Advances. Biotechnology journal. 15(1):e**
3、Zhiqiang Wen, Rodrigo Ledesma-Amaro, Minrui Lu, Yu Jiang, Shuliang Gao, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Combined evolutionary engineering and genetic manipulation improve low pH tolerance and butanol production in a synthetic microbial Clostridium community. Biotechnology and Bioengineering. Doi: 10.1002/bit.27333
4、Zhiqiang Wen, Rodrigo Ledesma-Amaro, Minrui Lu, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Metabolic Engineering of Clostridium cellulovorans to Improve Butanol Production by Consolidated Bioprocessing. ACS synthetic biology.Doi: 10.1021/acssynbio.9b00331
5、Qi Li, Francois M. Seys, Nigel P. Minton, Junjie Yang, Yu Jiang, Weihong Jiang, Sheng Yang*（2019）CRISPR-Cas9(D10A) nickase-assisted base editing in solvent producer Clostridium beijerinckii. Biotechnol Bioeng. Doi: 10.1002/bit.26949
6、He Huang, Xin Song, Sheng Yang*（2019） Development of a RecE/T-Assisted CRISPR-Cas9 Toolbox for Lactobacillus. Biotechnology journal. doi: 10.1002/biot..
7、Zhiqiang Wen, Ledesma-Amaro, Rodrigo; Jianping Lin*, Yu Jiang, Sheng Yang*（2019）Improved n-butanol production from Clostridium cellulovorans by integrated metabolic and evolutionary engineering. Appl Environ Microbiol. Doi: 10.1128/AEM.02560-18
8、Xinyun Jing, Bingran Xie, Longxian Chen, Niubing Zhang, Yiyi Jiang, Hang Qin, Hongbing Wang, Pei Hao*, Sheng Yang* , Xuan Li*（2018）Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its repurposing for precise RNA editing. Nucleic Acids Res. Doi :10.1093/nar/gky433
9、Bingbing Sun, Junjie Yang, Sheng Yang*, Richard D. Ye*, Daijie Chen,*; Yu Jiang*（2018）A CRISPR-Cpf1-Assisted Non-Homologous End Joining Genome Editing System of Mycobacterium smegmatis. Biotechnology journal . 13 (9)：**
10、Xin Wang, Junjie Yang, Sheng Yang*, Yu Jiang*（2018）Unraveling the genetic basis of fast L-arabinose consumption on top of recombinant xylose-fermenting Saccharomyces cerevisiae. Biotechnol Bioeng. Doi:10.1002/bit.26827
11、Jun Sun, Qingzhuo Wang, Yu Jiang, Zhiqiang Wen, Lirong Yang, Jianping Wu* and Sheng Yang*（2018）Genome editing and transcriptional repression in Pseudomonas putida KT2440 via the type II CRISPR system. Microb Cell Fact. 17:41
12、Xin Song, He Huang, Zhi-Qiang Xiong, Lianzhong Ai*, Sheng Yang* (2017) CRISPR-Cas9D10A Nickase-Assisted Genome Editing in Lactobacillus casei. Appl. Environ. Microbiol. doi: 10.1128/AEM.01259-17
13、Qi Liu, Yu Jiang, Lei Shao, Ping Yang, Bingbing Sun,Sheng Yang*, and Daijie Chen* (2017) CRISPR/Cas9-based efficient genome editing in Staphylococcus aureus. Acta Biochim Biophys Sin. doi: 10.1093/abbs/gmx074
14、Xiaoshu Xu, Chao Wang, Jun Chen, and Sheng Yang* （2017）Streptomyces virginiae PPDC is a new type of phenylpyruvate decarboxylase composed of two subunits. ACS Chemical Biology 2017; doi:10.1021/acschembio.7b00307
15、Yu Jiang, Fenghui Qian, Junjie Yang, Yingmiao Liu, Feng Dong, Chongmao Xu, Bingbing Sun, Biao Chen, Xiaoshu Xu, Yan Li, Renxiao Wang, Sheng Yang* (2017) CRISPR-Cpf1 -assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum Nature Communications.doi:10.1038/ncomms15179 ESI高被引
16、Shuliang Gao, Yangyang Tong, Li Zhu, Ge Mei, Zhang Yian, Daijie Chen, Yu Jiang, Sheng Yang* (2017) Iterative integration of multiple-copy pathway genes in Yarrowia lipolytica for heterologous β-carotene production. Metabolic Engineering. 41:192-201
17、Zhiqiang Wen, Nigel P. Minton, Ying Zhang, Qi Li, Jinle Liu, c, Yu Jiang, Sheng Yang*（2017）Enhanced solvent production by metabolic engineering of a twin-clostridial consortium. Metabolic Engineering.39：38-48
18、Junjie Yang and Sheng Yang* (2016)Comparative analysis of Corynebacterium glutamicum genomes: a new perspective for the industrial production of amino acids. BMC Genomics . 18(1):940
19、Yu Jiang, Rongsheng Tao, Zhengquan Shen, Liangdong Sun, Fuyun Zhu, Sheng Yang*(2016)Enzymatic Production of Glutathione by Bifunctional γ-Glutamylcysteine Synthetase/Glutathione Synthetase Coupled with In Vitro Acetate Kinase-Based ATP Generation. Appl Biochem Biotechnol.180（7） 1446-1455
20、Shuliang Gao, Yangyang Tong, Zhiqiang Wen, Li Zhu, Mei Ge, Daijie Chen*, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2016) Multiplex gene editing of the Yarrowia lipolytica genome using the CRISPR-Cas9 system. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology . 43（8）1085–1093
21、Yu Jiang Rongsheng Tao , Sheng Yang* (2016) Tailor-made biocatalysts enzymes for the fine chemical industry in China. Biotechnol Journal. 11,1121–1123
22、Qi Li, Jun Chen, Nigel P. Minton, Ying Zhang, Zhiqiang Wen, Jinle Liu, Haifeng Yang, Zhe Zeng, Xiaodan Ren, Junjie Yang, Yang Gu, Weihong Jiang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2016) CRISPR-based genome editing and expression control systems in Clostridium acetobutylicum and Clostridium beijerinckii. Biotechnology Journal. 11(7):961-72
23、Chen Yang, Xiang Gao, Yu Jiang, Bingbing Sun, Fang Gao, Sheng Yang*（2016）Synergy between methylerythritol phosphate pathway and mevalonate pathway for isoprene production in Escherichia coli, Metabolic Engineering, 2016, 37:79–91
24、Xiaoshu Xu, Jun Chen, Qingzhuo Wang, Chunlan Duan, Yan Li, Renxiao Wang,Sheng Yang*(2016) Mutagenesis of Key Residues in the Binding Center of l-Aspartate-b-Semialdehyde Dehydrogenase from Escherichia coli Enhances Utilization of the Cofactor NAD(H), ChemBioChem.17:56-64
25、Yu Jiang, Biao Chen, Chunlan Duan, Bingbing Sun, Junjie Yang, and Sheng Yang* (2015)Multigene Editing in the Escherichia coli Genome via the CRISPR-Cas9 System. Appl. Environ. Microbiol. 81:2506-14 ESI高被引
26、Ning Zhang, Lijun Shao, Yu Jiang, Yang Gu, Qi Li, Jinle Liu, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2015) I-SceI-mediated scarless gene modification via allelic exchange in Clostridium. Journal Microbial Methods. 108:49-60
27、Yu Jiang, Jinle Liu, Yunliu Yang, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2014) Current status and prospects of industrial bio-production of n-butanol in China, Biotechnology Advances. 33：1493-1501
28、Junjie Yang, Bingbing Sun, He Huang, Yu Jiang, Liuyang Diao, Biao Chen, Chongmao Xua,Xin Wang, Jinle Liu, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2014) High-efficiency Scarless Genetic Modification in Escherichia coli Using lambda-Red Recombination and I-SceI Cleavage. Appl. Environ. Microbiol. 80(13):3826-34
29、Rongsheng Tao, Yu Jiang, Fuyun Zhu, Sheng Yang* (2014) A one-pot system for production ofL-2-aminobutyric acid from L-threonine by L-threonine deaminase and a NADH regeneration system based on L-leucine dehydrogenase and formate dehydrogenase. Biotechnology Letters 36(4):835-41
30、Liuyang Diao, Yingmiao Liu, Fenghui Qian, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2013）Construction of fast xylose-fermenting yeast based on industrial ethanol-producing diploid Saccharomyces cerevisiaeby rational design and adaptive evolution. BMC Biotechnology 13:110
31、Zhilin Li, Han Xiao, Weihong Jiang, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2013) Improvement of butanol production from xylose mother liquor by engineering xylose metabolic pathway in Clostridium acetobutylicum EA 2018. Applied Biochemistry and Biotechnology. 171(3):555-68
32、Han Xiao, Zhilin Li, Yu Jiang, Yunliu Yang, Weihong Jiang, Yang Gu*, Sheng Yang* (2012) Metabolic engineering of D-xylose pathway in Clostridium beijerinckii to optimize solvent production from xylose mother liquid. Metabolic Engineering 14: 565-578
33、Han Xiao, Yang Gu, Yuanyuan Ning, Yunliu Yang, W.J. Mitchell, Weihong Jiang*, Sheng Yang* (2011) Confirmation and elimination of xylose-metabolic bottlenecks in glucose-PTS-deficient Clostridium acetobutylicum to realize simultaneous utilization of glucose, xylose and arabinose. Appl. Environ. Microbiol 77:7886-7895
34、Zhoutong Sun, Yuanyuan Ning, Lixia Liu, Yingmiao Liu, Bingbing Sun, Weihong Jiang, Chen Yang and Sheng Yang* (2011) Metabolic engineering of the L-phenylalanine pathway in Escherichia coli for the production of S- or R-mandelic acid. Microbial Cell Factories. 10:71 Highly Accessed
35、Li Zhu, Rongsheng Tao, Yi Wang, Yu Jiang, Xin Lin, Yunliu Yang, Huabao Zheng, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2011) Removal of L-alanine from the production of L-2-aminobutyric acid by introduction of alanine racemase and D-amino acid oxidase. Appl Microbiol Biotechnol. 90:903-910
36、Jian LI, Jingbo ZHAO, Meng ZHAO, Yunliu YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2010)Screening and Characterization of Butanol Tolerant Microorganisms. Letters in Applied Microbiology 50: 373-9
37、Yu JIANG, Chongmao XU, Feng DONG, Yunliu YANG, Weihong JIANG*, Sheng YANG* (2009) Disruption of the acetoacetate decarboxylase gene in solvent-producing Clostridium acetobutylicum increases the butanol ratio. Metabolic Engineering 11: 284-91
38、Junjie YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2009). mazF as a counter-selectable marker for unmarked genetic modification of Pichia pastoris. FEMS Yeast Research. 9(4): 600-9
39、Hong YU, Jian LI, Dalong ZHANG, Yunliu YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2009). Improving the thermostability of N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase by error-prone PCR. Appl. Microbiol. Biotechnol. 82(2): 279-85
40、Lijun SHAO, Shiyuan HU, Yi YANG, Yang GU, Jun CHEN, Yunliu YANG, Weihong JIANG*, Sheng YANG* (2007) Targeted gene disruption by use of a group II intron (targetron) vector in Clostridium acetobutylicum. Cell Research. 17: 963-5







新闻链接




























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