基本信息
李寅 男 博导 微生物研究所
中科院****
电子邮件： yli@im.ac.cn
通信地址： 北京市朝阳区北辰西路1号院3号
邮政编码： 100101

研究领域研究方向为工业微生物分子生理学和系统生物技术，主要研究内容包括：
1、分子生理学和代谢工程。以乳酸菌及嗜酸、嗜碱、耐溶剂微生物为模型，利用基因组学和功能基因组学技术进行分子生理学研究，理解这些微生物过量合成大宗化学品的分子基础和调控机制，并在此基础上设计新的代谢工程策略，对微生物进行系统生物技术改造，实现大宗化学品的经济、绿色生产。
2、支撑系统生物技术的方法学。发展重要生物基化学品产生菌的高通量筛选方法，新型原核微生物遗传操作系统和基因组规模突变技术，不同水平(DNA、RNA、蛋白质、代谢物、代谢通量)组学数据的整合方法学，以及基因组规模代谢模型的构建及生物学功能预测方法。


招生信息
招生专业071005-微生物学

招生方向 工业微生物分子生理学与系统生物技术



教育背景 1995-09--2000-06 无锡轻工大学（现江南大学） 博士
1991-09--1995-06 无锡轻工大学（现江南大学） 学士

学历研究生

学位博士

工作经历
工作简历 2010-01--今 中科院应用微生物网络研究食品微生物网络实验室 负责人
2008-07--2009-06 中国科学院天津工业生物技术研究所 副所长
2007-06--2008-06 中国科学院微生物研究所 能源与工业生物技术中心主任
2006-03--今 中国科学院微生物研究所 研究员，博导
2004-07--2006-03 爱尔兰University College Cork Research Officer
2003-01--2004-06 江南大学生物工程学院 副教授
2001-07--2002-12 荷兰Wageningen Centre for Food Sciences，NIZO Food Re 博士后
2000-07--2001-06 江南大学生物工程学院 讲师

社会兼职

教授课程

专利与奖励
奖励信息 （1） SCOPUS青年奖，其他级，2010
（2） 第三世界科学院Young Affiliate Fellow，其他级，2010
（3） 国家科技进步奖，二等奖，国家级，2006
（4） 中国科学院“****”，院级级，2006
（5） 教育部科技进步奖，二等奖，部委级，2004
（6） 江苏省科技进步奖，二等奖，省级，2003
（7） 中国石油与化学工业技术发明奖，一等奖，其他级，2003
（8） 无锡市十大，市地级，2000

成果信息 （1） 自动调控氧化还原电位的装置，实用新型，2010，第4作者，专利号：5.0
（2） 表达谷氨酰胺转氨酶的重组菌及其应用，发明，2009，第1作者，专利号：3
（3） 一种制备L-乳酸的方法及其专用菌株，发明，2009，第4作者，专利号：4.1
（4） 一种高通量检测溶剂产生菌溶剂产量的方法，发明，2008，第3作者，专利号：9.4
（5） 生产丁醇的菌剂及其应用，发明，2008，第4作者，专利号：1.3
（6） 合成谷胱甘肽的梭菌及其构建方法与应用，发明，2008，第3作者，专利号：9.4
（7） 一种重组蓝藻产丁醇的方法，发明，2008，第5作者，专利号：8.X
（8） 重组梭菌及其构建方法与应用，发明，2008，第3作者，专利号：0.7
（9） 一种获得丁醇产生菌突变株的方法，发明，2008，第3作者，专利号：6.0
（10） 一种生物传感器及其应用，发明，2008，第2作者，专利号：6.5
（11） 一种生产丁醇的方法，发明，2008，第3作者，专利号：9.4
（12） 一种发酵生产丁醇和丁二酸的方法，发明，2008，第4作者，专利号：3.3
（13） 一种联产丁醇、异丙醇及乙醇的重组菌及其应用，发明，2011，第4作者，专利号：4.7
（14） 自动调控氧化还原电位的装置及其应用，发明，2010，第4作者，专利号：4.3
（15） 一种使产丁醇梭菌易于遗传操作的方法及其易于遗传操作的突变体，发明，2009，第3作者，专利号：2.3
（16） 一种筛选解除葡萄糖代谢阻遏的丁醇产生菌突变株的方法，发明，2008，第3作者，专利号：8.x
（17） 重组丙酮丁醇梭菌及其构建方法与应用，发明，2008，第4作者，专利号：7.5
（18） 一株丙酮丁醇梭菌及其应用，发明，2008，第3作者，专利号：3.2
（19） 一种稳定联产异丙醇和丁醇的工程菌及其构建方法与应用，发明，2011，第4作者，专利号：3.1
（20） 一种筛选乳酸生产率高的菌株的方法，发明，2008，第3作者，专利号：8.8
（21） 一种生产乳酸的方法及其专用植物乳杆菌，发明，2008，第3作者，专利号：4.6
（22） 一种培育抗盐胁迫乳酸乳球菌的方法及其专用培养基，发明，2008，第3作者，专利号：3.1


出版信息
发表论文 （1） Formic acid triggers the “acid crash” of acetone-butanol-ethanol fermentation of Clostridium acetobutylicum，Appl. Environ. Microbiol.，2011，通讯作者
（2） Engineering the robustness of Clostridium acetobutylicum by introducing glutathione biosynthetic capability，Metab. Eng.，2011，通讯作者
（3） Group II intron-anchored gene deletion in Clostridium，PLoS ONE，2011，通讯作者
（4） Complete genome sequence of Clostridium acetobutylicum DSM 1731, a solvent producing strain with multi-replicon genome architecture，J. Bacteriol.，2011，通讯作者
（5） Comparative analysis on the membrane proteome of Clostridium acetobutylicum wild type strain and its butanol-tolerant mutant，Mol. Biosys.，2011，通讯作者
（6） Glutathione protects Lactobacillus sanfranciscensis against freeze-thawing, freeze-drying, and cold treatment，Appl. Environ. Microbiol.，2010，通讯作者
（7） Engineering cyanobacteria for fuels and chemicals production，Protein Cell，2010，通讯作者
（8） Systematic engineering of microorganisms to improve alcohol tolerance，Eng. Life Sciences，2010，通讯作者
（9） Proteome reference map and comparative proteomic analysis between a wild type Clostridium acetobutylicum DSM 1731 and its mutant with enhanced butanol tolerance and butanol yield，J. Proteome Res.，2010，通讯作者
（10） Engineering Clostridium strain to accept unmethylated DNA，PLoS ONE，2010，通讯作者
（11） Proteomic analyses to reveal the protective role of glutathione in stress resistance of Lactococcus lactis，Appl. Environ. Microbiol.，2010，通讯作者
（12） Allelic variation of bile salt hydrolase genes contributes to, but is not the sole determinant of, bile resistance levels in Lactobacillus salivarius，J. Bacteriol.，2009，第2作者
（13） Understanding the industrial application potential of lactic acid bacteria through genomics ，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2009，通讯作者
（14） Introduction of an NADH regeneration system into Klebsiella oxytoca leads to an enhanced oxidative and reductive metabolism of glycerol，Metab. Eng.，2009，通讯作者
（15） The importance of engineering physiological functionality into microbes，Trends Biotechnol.，2009，通讯作者
（16） Solution behavior and activity of a halophilic esterase under high salt concentration，PLoS ONE，2009，第4作者
（17） Strain-specific inhibition of Helicobacter pylori by Lactobacillus salivarius and other lactobacilli，J. Antimicrobial. Chemotherapy，2008，第3作者
（18） Characterization of endogenous plasmids from Lactobacillus salivarius UCC118，Appl. Environ. Microbiol.，2008，第3作者
（19） Distribution of megaplasmids in Lactobacillus salivarius and other lactobacilli，J. Bacteriol.，2007，第1作者
（20） Glutathione protects Lactococcus lactis against acid stress，Appl. Environ. Microbiol.，2007，通讯作者
（21） Redistribution of carbon flux in Torulopsis glabrata by altering vitamin and calcium level，Metab. Eng.，2007，第2作者
（22） A novel redox-potential-based screening strategy for rapid isolation of Klebsiella pneumoniae mutants with enhanced 1,3-propanediol producing capability，Appl. Environ. Microbiol.，2007，第3作者
（23） Bacteriocin production as a mechanism for the anti-infective activity of Lactobacillus salivarius UCC118，Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.，2007，第2作者
（24） Multi-replicon genome architecture of Lactobacillus salivarius，Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.，2006，第1作者
（25） Comparative and functional analysis of sortase-dependent proteins in the predicted secretome of Lactobacillus salivarius，Appl. Environ. Microbiol.，2006，第4作者
（26） Use oxidoreduction potential as an indicator to regulate 1,3- propanediol fermentation by Klebsiella pneumoniae，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2006，第4作者
（27） Introducing glutathione biosynthetic capability into Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 improves the oxidative-stress resistance of the host，Metab. Eng.，2006，通讯作者
（28） Redirection of the NADH oxidation pathway in Torulopsis glabrata leads to an enhanced pyruvate production，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2006，第2作者
（29） Inactivation of aldehyde dehydrogenase: a key factor for engineering 1,3-propanediol production by Klebsiella pneumoniae，Metab. Eng.，2006，第2作者
（30） Heterologous production of transglutaminase in Lactococcus lactis significantly enhances the growth performance of the host，Appl. Environ. Microbiol.，2005，通讯作者
（31） Using Lactococcus lactis for glutathione overproduction，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2005，第1作者
（32） Polyphasic analysis indicates that Lactobacillus salivarius subsp. salivarius and Lactobacillus salivarius subsp. salicinius do not merit separate subspecies status，Int. J. Syst. Evol. Microbiol.，2005，第1作者
（33） Glutathione: a review on biotechnological production，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2004，第1作者
（34） Glutathione protects Lactococcus lactis against oxidative stress，Appl. Environ. Microbiol.，2003，第1作者
（35） A novel poly-galacturonic acid bioflocculant REA-11 produced by Corynebacterium glutamicum: A proposed biosynthetic pathway and experimental confirmation，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2003，第1作者
（36） Enhancement of pyruvate production by Torulopsis glabrata using a two-stage oxygen supply control strategy，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2002，第1作者
（37） Biotechnological production of pyruvic acid，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2001，第1作者
（38） Efficient production of pyruvic acid by Torulopsis glabrata: the key role of vitamins and its optimization，Appl. Microbiol. Biotechnol.，2001，第1作者

发表著作 （1） 高细胞密度发酵技术，High Cell-density Fermentation Technology，化学工业出版社，2006-10，第1作者
（2） 发酵过程优化原理与实践，Principle and Practice of Fermentation Process Optimization，化学工业出版社，2002-04，第2作者


科研活动
国际会议邀请报告：

2010.12.10 The 3rd International Symposium for contribution of lactic acid bacteria to preventive and pre-symptomatic medicine, Hiroshima University, Japan
2010.08.22 International Conference on Biomass Energy Technologies, Beijing, China
2010.04.14 The Second International Congress EurasiaBIO’2008, Moscow, Russia
2010.01.14 OECD workshop “industrial biotechnology“, Vienna, Austria
2009.10.02 Synthetic Biology Ethics Workshop, Delft, The Netherlands
2009.09.26 12th Annual Chinese-American Kavli Frontiers of Science Symposium, Kunming, China
2009.09.25 BBSRC China Partnering Award Workshop on improving biobutanol production by solventogenic Clostridia, Shanghai, China
2009.07.22 World Congress Industrial Biotechnology and Bioprocessing, Montreal, Canada
2008.10.31 Kluyver Centre Expert Workshop on Biofuel Development, Vlaardingen, The Netherlands
2008.10.13 International Biotechnology Symposium, Dalian, China
2008.09.02 9th Symposium on Lactic Acid Bacteria, Egmond aan Zee, The Netherlands
2008.08.30 The first symposium on glutathione and related thiols, Nancy, France
2008.04.24 The First International Congress EurasiaBIO’2008, Moscow, Russia

科研项目 （1） 化工醇的生物制造，主持，院级级，2011-04--2013-12
（2） 生物长链醇的微生物合成及系统集成技术，主持，国家级，2011-01--2015-08
（3） 异丙醇细胞工厂的性能优化，参与，国家级，2011-01--2015-08
（4） 微生物产脂，主持，其他级，2009-07--2011-12
（5） 工业发酵体系氧化还原电势自动控制系统的开发，主持，院级级，2009-07--2011-07
（6） 谷胱甘肽合成能力在微生物适应非适宜生境中的生理作用，主持，国家级，2009-01--2011-12
（7） 高温乙醇菌系统生物技术改造，主持，院级级，2008-01--2011-12
（8） 组合代谢工程改造丁醇生产菌，主持，院级级，2007-09--2011-12


合作情况
项目协作单位Shell Research Limited (UK)
DSM White Biotechnology B.V. (The Netherlands)
Nestec Ltd. (Switzerland)
河南天冠企业集团
洛阳鸿安生化科技有限公司
北京燕京啤酒股份有限公司

指导学生已指导学生
解鹃硕士研究生071005-微生物学
王润江硕士研究生071005-微生物学
毛绍名博士研究生071005-微生物学
董红军博士研究生071005-微生物学
现指导学生
王少华博士研究生071005-微生物学
朱岩博士研究生071005-微生物学
陶文文硕士研究生071005-微生物学
朱林江博士研究生071005-微生物学
巩伏雨硕士研究生071005-微生物学
杨列健硕士研究生430139-生物工程
栾国栋博士研究生071005-微生物学
鲍冠辉博士研究生071005-微生物学
邓思颖硕士研究生071005-微生物学

工作人员及博士后工作人员

张延平 博士 副研究员 zhangyp@im.ac.cn
朱泰承 博士 副研究员 zhutc@im.ac.cn
蔡 真 博士 助理研究员 caiz@im.ac.cn
周 杰 博士 助理研究员 jiezhouw@im.ac.cn
董红军 博士 助理研究员 redarmy305@gmail.com
王瑞妍 博士 助理研究员 rywang07@gmail.com
赵秋伟 硕士 工程师 zhaoqiuwei@im.ac.cn
张天瑞 硕士 技术人员 myparadise365@yahoo.com.cn
孙红兵 硕士 技术人员 bbmm0412@sina.com
张君丽 硕士 技术人员 **@163.com
博士后
张艳禾 （已出站）
贾开志 （已出站）
朱泰承 （已出站）
李兴华 clarke1110@163.com
柳国霞 KLDS.moml@gmail.com