焦雨铃男博导中国科学院遗传与发育生物学研究所
电子邮件： yljiao@genetics.ac.cn
通信地址： 北京市朝阳区北辰西路1号院2号
邮政编码： 100101

研究领域本实验室综合转录组分析、活体成像、分子遗传学、数学建模等方法，研究植物器官发生，并应用于小麦穗型的分子设计。

研究领域
1. 叶片扁平化的建立机制：叶片是最基本的植物器官，通常是主要的光合作用场所。扁平宽大的形态有利于增大光合作用的面积，是常见的叶片特征。叶片的扁平化生长是伴随叶片发育过程逐渐形成的。本实验室的研究关注扁平化建立的调控机制，特别是植物激素生长素与生物力学在扁平化建立过程的作用。
2. 干细胞团的重建：叶片的基部（叶腋处）能够形成新的干细胞团和分生组织，称为侧生分生组织。侧生分生组织产生侧芽，使植物能够产生分枝。开花后侧生分生组织形成花序分枝。因此，侧生干细胞的活性是决定小麦等作物关键农艺性状穗数、穗粒数的重要因素。本实验室通过活体成像、转录谱分析、以及遗传分析研究侧生干细胞团重建的转录调控网络。




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招生专业071008-发育生物学
071007-遗传学
071021-生物信息学

招生方向植物发育生物学
植物基因组学
植物分子遗传学


教育背景2003-09--2006-10耶鲁大学哲学博士
2001-09--2003-08耶鲁大学理学硕士
1997-09--2001-07北京大学理学学士


工作经历
2010-11~今 中国科学院遗传与发育生物学研究所, 研究员
2006-11~2010-10 加州理工学院,博士后



社会兼职2016-07-01-今,Multinational Arabidopsis Steering Committee, 中国代表
2016-01-01-今,中国细胞学会植物器官发生分会, 副会长
2013-09-01-今,中国遗传学会发育遗传专业委员会, 委员
2013-09-01-今,中国遗传学会发育遗传专业委员会, 委员
2013-09-01-今,中国植物生理与植物分子生物学学会青年工作委员会, 委员
2013-01-01-今,国家植物基因研究中心（北京）, 项目科学家


教授课程遗传学实验
发育生物学
分子遗传学
遗传发育学系列讲座


专利与奖励
奖励信息（1） 中国科学院“****”终期评估优秀, 院级, 2015
（2） 益海嘉里优秀导师奖, 研究所（学校）, 2014
（3） SCOPE青年科学之星，生命科学组, 三等奖, 其他, 2013
（4） Nicholas Prize, , 研究所（学校）, 2006
（5） 国家优秀自费留学生奖, , 国家级, 2005


出版信息
发表论文（1）Feedback from lateral organs controls shoot apical meristem growth by modulating auxin transport,Developmental Cell,2018,通讯作者
（2）AUXIN RESPONSE FACTOR3 regulates floral meristem determinacy by repressing cytokinin biosynthesis and signaling,Plant Cell,2018,第9作者
（3）Auxin and DORNR?SCHEN joint force in the shoot apex.,Science China Life sciences,2018,通讯作者
（4）Molecular mechanisms of leaf morphogenesis,Molecular Plant,2018,通讯作者
（5）Auxin and above-ground meristems.,Journal of Experimental Botany,2018,通讯作者
（6）Axillary meristem initiation — a way to branch out.,Current Opinion in Plant Biology,2018,通讯作者
（7）Mechanical regulation of organ asymmetry in leaves,Nature Plants,2017,通讯作者
（8）Transcriptome association identifies regulators of wheat spike architecture.,Plant Physiology,2017,通讯作者
（9）Spatial auxin signaling controls leaf flattening in Arabidopsis.,Current Biology,2017,通讯作者
（10）Single-cell transcriptome analysis reveals widespread monoallelic gene expression in individual rice mesophyll cells.,Science Bulletin,2017,通讯作者
（11）Model for the role of auxin polar transport in patterning of the leaf adaxial-abaxial axis.,Plant Journal,2017,第6作者
（12）Dynamic patterns of gene expression during leaf initiation.,Journal of Genetics and Genomics,2017,通讯作者
（13）Cytokinin signaling activates WUSCHEL expression during axillary meristem initiation,Plant Cell,2017,通讯作者
（14）A two-step model for de novo activation of WUSCHEL during plant shoot regeneration,Plant Cell,2017,第5作者
（15）Transcriptome survey of the contribution of alternative splicing to proteome diversity in Arabidopsis thaliana.,Molecular Plant,2016,通讯作者
（16）Two-step regulation of a meristematic cell population acting in shoot branching in Arabidopsis.,PLoS Genetics,2016,通讯作者
（17）Meristem biology flourishes under Mt. Tai,Molecular Plant,2016,第1作者
（18）The molecular mechanism of ethylene-mediated root hair development induced by phosphate starvation,PLoS Genetics,2016,第5作者
（19）Trichome formation: Gibberellins on the move.,Plant Physiology,2016,通讯作者
（20）Regulation of axillary meristem initiation by transcription factors and plant hormones.,Frontiers in Plant Science,2016,通讯作者
（21）APETALA1 establishes determinate floral meristem through regulating cytokinins homeostasis in Arabidopsis.,Plant Signaling and Behavior,2015,通讯作者
（22）A systems approach to understand shoot branching.,Current Plant Biology,2015,通讯作者
（23）Cytokinin pathway mediates APETALA1 function in the establishment of determinate floral meristem in Arabidopsis.,Proc. Natl Acad. Sci. USA,2014,通讯作者
（24）The stem cell niche in leaf axils is established by auxin and cytokinin in Arabidopsis.,Plant Cell,2014,通讯作者
（25）An organ boundary-enriched gene regulatory network uncovers regulatory hierarchies underlying axillary meristem initiation.,Molecular Systems Biology,2014,通讯作者
（26）Auxin depletion from leaf primordia contributes to organ patterning.,Proc. Natl Acad. Sci. USA,2014,通讯作者
（27）Regulation of inflorescence architecture by cytokinins.,Frontiers in Plant Science,2014,通讯作者
（28）AUXIN RESPONSE FACTOR 3 integrates the functions of AGAMOUS and APETALA2 in floral meristem determinacy.,Plant Journal,2014,第9作者
（29）Suppression of photosynthetic gene expression in roots is required for sustained root growth under phosphate deficiency.,Plant Physiology,2014,第6作者
（30）SKIP is a component of the spliceosome linking alternative splicing and the circadian clock in Arabidopsis.,Plant Cell,2012,第10作者
（31）An AT-hook gene is required for palea formation and floral organ number control in rice.,Developmental Biology,2011,第10作者
（32）Advances in plant cell type-specific genome-wide studies of gene expression.,Frontiers in Biology,2011,通讯作者
（33）Cell-type specific analysis of translating RNAs in developing flowers reveals new levels of control.,Molecular Systems Biology,2010,第1作者
（34）Arabidopsis regeneration from multiple tissues occurs via a root development pathway. ,Developmental Cell,2010,第2作者
（35）A transcriptome atlas of rice cell types uncovers cellular, functional and developmental hierarchies. ,Nature Genetics,2009,第1作者
（36）Transcriptome-wide analysis of uncapped mRNAs in Arabidopsis reveals regulation of mRNA degradation,Plant Cell,2008,通讯作者
（37）Light-regulated transcriptional networks in higher plants.,Nature Reviews Genetics,2007,第1作者
（38）Global genome expression analysis of rice in response to drought and high-salinity stresses in shoot, flag leaf, and panicle.,Plant Molecular Biology,2007,第3作者
（39）A genome-wide transcriptional activity survey of rice transposable element-related genes.,Genome Biology,2007,第1作者
（40）Distinct reorganization of the genome transcription associates with organogenesis of somatic embryo, shoots, and roots in rice. ,Plant Molecular Biology ,2007,第3作者
（41）Conservation and divergence of light-regulated genome expression patterns during seedling development in rice and Arabidopsis. ,Plant Cell,2005,第1作者
（42）A tiling microarray expression analysis of rice chromosome 4 suggests a chromosome-level regulation of transcription.,Plant Cell,2005,第1作者
（43）A microarray analysis of the rice transcriptome and its comparison to Arabidopsis.,Genome Research,2005,第4作者
（44）Organ-specific expression of Arabidopsis genome during development.,Plant Physiology,2005,第4作者
（45）A genome-wide analysis of blue-light regulation of Arabidopsis transcription factor gene expression during seedling development.,Plant Physiology,2003,第1作者

发表著作（1）Insights on plant development using NGS technologies.,Caister Academic,2014-01,第2作者
（2）聚焦基因,人民教育出版社,2018-01,第2作者


科研活动
科研项目（ 1 ） ****, 主持,部委级,2011-01--2013-12
（ 2 ） 拟南芥花发育早期细胞水平转录谱的研究, 主持,国家级,2012-01--2015-12
（ 3 ） 植物表观遗传调控及其在重要发育过程中的作用机制及结构基础研究, 主持,国家级,2012-01--2016-08
（ 4 ） 小麦高效性状分子模块系统解析, 主持,部委级,2013-08--2017-12
（ 5 ） 系统解析侧生分生组织形成的调控网络, 主持,国家级,2015-01--2019-12
（ 6 ） 叶片发育极性建成的调控网络研究, 主持,国家级,2014-01--2018-08
（ 7 ） 遗传学与生物信息学, 主持,国家级,2013-01--2015-12
（ 8 ） 青年拔尖人才, 主持,国家级,2015-01--2017-12


指导学生已指导学生
韩莹莹博士研究生071008-发育生物学
王瑨博士研究生071008-发育生物学
齐继艳博士研究生071008-发育生物学
吴彬彬博士研究生071007-遗传学
石碧海博士研究生071008-发育生物学
于浩澎博士研究生99J3-生物信息学
叶佩仪硕士研究生071008-发育生物学
现指导学生
王清清博士研究生071008-发育生物学
徐梦雪博士研究生071008-发育生物学
曹秀卫博士研究生071008-发育生物学
杜青伟博士研究生071008-发育生物学
熊圆圆博士研究生071008-发育生物学
刘中帅博士研究生071008-发育生物学
刘子轩硕士研究生071007-遗传学
王泓力博士研究生071008-发育生物学