基本信息








韩华，研究员、博导、中国科学院大学岗位教授。1996年西安交通大学自动化专业学士，1999年中国舰船研究院系统工程专业硕士，2004年中国科学院大学模式识别与智能系统专业博士。
现工作于中国科学院自动化所模式识别国家重点实验室/类脑智能研究中心，任微观重建与智能分析团队负责人、怀柔综合性国家科学中心脑智交叉平台总工程师，入选中国科学院关键技术人才、脑科学与智能技术卓越中心骨干人才。
已发表学术论文40余篇，授权发明专利9项，在申发明专利10项，软件著作权登记12项。


实验室主页：mira.ia.ac.cn

电子邮件： hua.han@ia.ac.cn
通信地址： 北京市海淀区中关村东路95号自动化大厦205房间

邮政编码： 100190








部门/实验室：类脑智能研究中心
研究领域













随着显微成像技术向更高分辨率和更大尺度的推进，所产生的海量显微数据对图像三维配准、精细结构识别和网络模型分析等提出了全新的挑战。
课题组致力于将人工智能方法应用于大规模显微成像和数据处理，通过对软硬件的整合，实现生物医学电镜技术从数据采集、存储、处理与分析的一体化、实时化、通量化。

















招生信息










欢迎自动化、计算机、电子、数学、物理、生物等专业优秀学生报考。
招生专业：081104-模式识别与智能系统
招生方向：显微影像智能分析，图像与视频处理
招生部门：中国科学院自动化所模式识别国重/类脑智能研究中心（直博/普博/学硕/非全）、中国科学院大学未来技术学院（直博）












教育背景2001-09--2004-08中国科学院研究生院博士
1996-09--1999-04中国舰船研究院硕士
1992-09--1996-07西安交通大学学士

学历1992～1996年，西安交通大学电气工程学院自动化系，学士学位。
1996～1997年，中国科学技术大学自动化系，学习硕士学位课程。
1997～1999年，中国舰船研究院系统工程专业，硕士学位。
2001～2004年，中国科学院自动化所模式识别与智能系统专业，博士学位。

学位 -- 博士


工作经历



2008.6~2015.8，国家专用集成电路设计工程技术中心研发部总工程师。
2015.1~ ，微观重建与智能分析团队负责人、显微分析技术平台负责人。
2018.1~ ，北京怀柔综合性国家科学中心脑认知功能图谱与类脑智能交叉研究平台总工程师。










工作简历2016-09~现在,中国科学院大学,岗位教授
2015-07~现在,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心,年轻骨干
2014-10~现在,中国科学院自动化所,研究员
2007-06~2014-10,中国科学院自动化所,高级工程师
2004-08~2007-06,中国科学院自动化所,助理研究员
1999-04~2001-08,江苏自动化研究所,工程师


教授课程脑科学与新技术-神经网络结构追踪和重构技术


专利与奖励


奖励信息（1） 中国科学院关键技术人才, 院级, 2015

专利成果（ 1 ） 一种基于MCA的图像超分辨率重建方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL 7.1
（ 2 ） 一种基于图像边缘保持自适应分解的超分辨率重建方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 4.1
（ 3 ） 基于带限二维EVD与Gabor自适应滤波的图像时频分析法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 9.0
（ 4 ） 利用自适应多尺度基本形式实现图像融合的方法, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: ZL 4.2
（ 5 ） 一种基于多尺度基本形式的相似尺度图像融合方法, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: ZL 6.7
（ 6 ） 小波邻域高斯模型图像复原方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 3.7
（ 7 ） 一种对扫描电子显微镜畸变进行校正的方法, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 5.6
（ 8 ） 显著化生物组织切片膜结构的刻蚀工艺及图像合成方法, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: ZL 6.8
（ 9 ） 基于双光子图像的突触检测方法, 发明, 2019, 第 2 作者, 专利号: 9.3
（ 10 ） 基于电镜序列切片图像的突触检测方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 2.1
（ 11 ） 基于序列切片的显微镜图像采集方法, 发明, 2019, 第 3 作者, 专利号: 5.4
（ 12 ） 基于线粒体结构的图像配准方法及装置、存储介质及设备, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 8.5
（ 13 ） 生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 6.3
（ 14 ） 低能量背散射电子探测器, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 6.5
（ 15 ） 低能量背散射电子探测器, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 8.4
（ 16 ） 面向序列切片的扫描电镜图像实时配准装置及方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 8.4
（ 17 ） 多幅显微图像拼接中的灰度矫正方法及装置, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: ZL 2.5
（ 18 ） 超薄切片机及其刀台, 发明, 2018, 第 4 作者, 专利号: ZL 4.1
（ 19 ） 大视场光学显微图像成像装置及方法, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL 4.3
（ 20 ） 显微序列图像拼接方法及装置, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: ZL 3.6
（ 21 ） 生物样品三维结构的构建方法及装置, 发明, 2018, 第 3 作者, 专利号: ZL 5.5


出版信息


发表论文（1）Dual Networks for High-Precision and High-Speed Registration of Brain Electron Microscopy Images,Brain Sciences,2020-02,通讯作者
（2）A common hub for sleep and motor control in the substantia nigra,Science,2020-01,其他（合作组作者）
（3）Brain Activity Regulates Loose Coupling between Mitochondrial and Cytosolic Ca Transients,Nature Communications,2019-11,其他（合作组作者）
（4）Electron Microscopic Sequential Images Stitching Based on Belief Propagation,International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP),2019-10,通讯作者
（5）Using Scale Information to Improve SIFT-Based Electron Microscope Image Registration Method,International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP),2019-10,通讯作者
（6）An Effective Encoder-Decoder Network for Neural Cell Bodies and Cell Nucleus Segmentation of EM Images,IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC),2019,通讯作者
（7）Automatic Classification for the Type of Multiple Synapse Based on Deep Learning,IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC),2019,通讯作者
（8）Scalable volumetric imaging for ultrahigh-speed brain mapping at synaptic resolution,National Science Review,2019,其他（合作组作者）
（9）Skeleton-based Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections,SPIE Medical Imaging. International Society for Optics and Photonics,2019,通讯作者
（10）Correlative light and electron microscopy for complex cellular structures on PDMS substrates with coded micro-patterns,Lab on a Chip,2018-11,其他（合作组作者）
（11）Deep Contextual Residual Network for Electron Microscopy Image Segmentation in Connectomics,2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging（ISBI）,2018,通讯作者
（12）A Novel 3D Connection Algorithm of Mitochondria from ATUM-SEM Stacks Based on Segmentation Information in Context,IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC),2018,通讯作者
（13）Automatic Detection and Segmentation of Mitochondria from SEM Images using Deep Neural Network,IEEE Engineering in Medicine and Biology Society(EMBC),2018,通讯作者
（14）Large-area and highly uniform carbon nanotube film forhigh-performance thin film transistors,Nano Research,2018,其他（合作组作者）
（15）Non-iterative simultaneous rigid registration method for serial sections of biological tissue,2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging（ISBI）,2018,第5作者
（16）基于深度学习的脑微观结构重建,Brain Microstructure Reconstruction Based on Deep Learning,系统工程理论与实践,2018,通讯作者
（17）Real-time Image Deformation Using Locally-weighted Moving Least Squares,International Conference on Brain-Inspired Cognitive System?(BICS),2018,第5作者
（18）Fully Automatic Synaptic Cleft Detection and Segmentation From EM Images based on Deep Learning,International Conference on Brain-Inspired Cognitive System?(BICS),2018,通讯作者
（19）A Fast Forward 3D Connection Algorithm for Mitochondria and Synapse Segmentations from Serial EM Images,BioData Mining,2018,通讯作者
（20）A Refined Spatial Transformer Network,International Conference on Neural Information Processing,2018,通讯作者
（21）Automatic mitochondria segmentation for EM data using a 3D supervised convolutional network,Frontiers in Neuroanatomy,2018,通讯作者
（22）Morphology-Retained Non-Linear Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections,IEEE International Conference on Image Processing (ICIP),2018,通讯作者
（23）Image deformation based on contour using moving integral least squares,IET Image Processing,2018,第6作者
（24）An Unsupervised Network for Fast Microscopic Image Registration,SPIE Medical Imaging,2018,第4作者
（25）A Effective Fully Deep Convolutional Neural Networks for Mitochondria Segmentation Based on ATUM-SEM,SPIE Medical Imaging,2018,通讯作者
（26）Effective Automated Pipeline for 3D Reconstruction of Synapses Based on Deep Learning,BMC Bioinformatics,2018,通讯作者
（27）Formation mechanism of anodic titanium oxide in mixed electrolytes,Materials Research Bulletin,2017,通讯作者
（28）An efficient method for neuronal tracking in electron microscopy images,The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA),2017,第6作者
（29）Large scale three-dimensional reconstruction of an entire Caenorhabditis elegans larva using AutoCUTS-SEM,Journal of Structural Biology,2017,其他（合作组作者）
（30）3D reconstruction of synapses with deep learning based on EM Images,SPIE Medical Imaging,2017,通讯作者
（31）An automated detection for axonal boutons in vivo two-photon imaging of mouse,Eighth International Conference on Graphic and Image Processing.,2017,第5作者
（32）Learning with Coefficient-based Regularized Regression on Markov Resampling,IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems,2017,其他（合作组作者）
（33）An Automated Pipeline for Bouton, Spine, and Synapse Detection of In vivo Two-photon Images of Mouse,Biodata Mining,2017,通讯作者
（34）脑微观重建系统研究,Micro reconstruction system for brain,系统工程理论与实践,2017,通讯作者
（35）GAN based Sample Simulation for SEM-Image Super Resolution,CCF Chinese Conference on Computer Vision,2017,第5作者
（36）Image Deformation Using modified Moving Least Squares with outlines,The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA),2017,第6作者
（37）Grayscale Inhomogeneity Correction Method for Multiple Mosaicked Electron Microscope Images,International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP),2017,第4作者
（38）Automatical Detecting and Connecting the Mitochondria From the Serial EM Images,The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA),2017,第6作者
（39）Microscopic Neural Image Registration based on the Structure of Mitochondria,SPIE Medical Imaging,2017,第2作者
（40）Deep Learning and Shapes Similarity for Joint Segmentation and Tracing single Neurons in SEM images,SPIE Medical Imaging,2017,通讯作者
（41）An Automated Pipeline for Mitochondrial Segmentation on ATUM-SEM Stacks,Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2017,通讯作者
（42）Neurons secrete miR-132-containing exosomes to regulate brain vascular integrity,Cell Research,2017,其他（合作组作者）
（43）Watershed learning merge tree used for segmenting neurons in SEM images,The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA),2017,通讯作者
（44）Automatically Segmenting and Reconstructing?Neurons in SEM images,The 2016 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA),2016,通讯作者
（45）Sequentially Supervised Long Short-Term Memory for Gesture Recognition,Journal Cognitive Computation,2016,其他（合作组作者）
（46）Wrinkle Image Registration for Serial Microscopy Sections,International Conference on Signal-Image Technology & Internet-Based Systems,2015,通讯作者
（47）Simulation of anodizing current-time curves and morphology evolution of TiO 2 nanotube arrays,J Solid State Electrochem,2014,通讯作者
（48）还原剂对多孔阳极氧化铝纳米孔道结构的影响,Influence of Reducer on the Nanopore Structure of Porous Anodic Alumina,物理化学学报,2012,通讯作者
（49）Correction of SEM Image Distortion based on Non-equidistant GM(1,1) Model,Proceedings of the 2012 International Conference on Wavelet Analysis and Pattern Recognition, Xian, China,2012,第2作者
（50）A Fast Acquisition System for Large-scale Optical Microscopic Integrated Circuit Chip Images Based on Thin Plate Spline,Proceedings of the 2012 International Conference on Sensors, Measurement and Intelligent Materials, Guilin, China,2012,通讯作者
（51）多孔阳极氧化物的形成效率与纳米孔道的形成机理,Forming efficiency of porous anodic oxide and formation mechanism of nanopores,物理学报,2012,通讯作者
（52）β展式的误差和函数,The Error-Sum Function of Beta Expansion ,数学的实践与认识,2011,通讯作者
（53）Image super-resolution based on image adaptive decomposition,Proc. of SPIE MIPPR 2011: Parallel Processing of Images and Optimization and Medical Imaging Processing,2011,通讯作者
（54） An efficient algorithm and FPGA implementation of video luminance transient improvement,High Technology Letters,2010,第3作者
（55）Video Luminance Transient Improvement Using Difference-of-Gaussian,Proceedings of the 15th Asia-Pacific Conference on Communications,2009,第3作者
（56）经验模式分解算法的分析及其应用,系统工程理论与实践,2009,通讯作者
（57） A spatial deinterlacing algorithm based on edge orientation optimized in local area,CISP 08 Proceedings of the 2008 Congress on Image and Signal Processing,2008,第2作者

发表著作

学生培养









2010级
张旭硕士研究生430112-计算机技术 华北电力大学 毕业去向：读博
2011级
胡敏硕士研究生085211-计算机技术 华中科技大学 毕业去向：IBM
2014级
曹会文硕士研究生085211-计算机技术 天津大学 毕业去向：中科院
饶强 硕士研究生081104-模式识别与智能系统 西安交通大学 毕业去向：华为
2015级
舒畅 直博研究生 081203-计算机应用技术华中科技大学
杨茂柯硕士研究生085211-计算机技术 中南大学 毕业去向：创业
肖振鹏 硕士联培生 085211-计算机技术 武汉理工大学 毕业去向：比特大陆
2016级
肖驰 博士研究生 081104-模式识别与智能系统 北京理工大学毕业去向：高校
刘静 硕博研究生 081104-模式识别与智能系统 西北工业大学
赵盼 硕士联培生085211-计算机技术 青岛科技大学毕业去向：阿里
2017级
周芳旭直博研究生081104-模式识别与智能系统 北京交通大学
江熠 直博研究生 081104-模式识别与智能系统 安徽大学
常胜 硕博研究生 085211-计算机技术 北京化工大学
袁静斌硕士联培生085211-计算机技术 北京建筑大学
2018级
刘家正 直博研究生081104-模式识别与智能系统 中国地质大学（武汉）
辛桐 直博研究生 081104-模式识别与智能系统 南京邮电大学
王泽锦硕博研究生 081104-模式识别与智能系统 武汉理工大学
2019级
洪贝 博士研究生081104-模式识别与智能系统湖北大学
李贞辰 直博研究生081104-模式识别与智能系统 西安电子科技大学
孙国栋 硕士研究生081104-模式识别与智能系统 华北电力大学
2020级
翟昊 直博研究生081104-模式识别与智能系统 北京科技大学
















项目协作单位中国科学院自动化所
中国科学院上海神经所
中国科学院生物物理所
清华大学生命学院
北京大学医学部
北京大学信息技术学院
北京生命科学研究院
中国科学技术大学生命学院
北京师范大学脑与认知科学研究院
南开大学化学学院
南京理工大学材料学院
哈佛大学分子与细胞生物系



联合培养学生吕亚楠（硕士，中国科学院大学）
陈波昊（硕士，中国科学院大学）
王圣雄（博士，中国科学院大学）
李伟夫（博士，湖北大学）
邓昊（博士，澳门科技大学）
汪璐（博士，北京大学）
赵力（硕士，湖北大学）
罗杰（硕士，湖北大学）
赵兴辉（硕士，湖北大学）