- 张子丁导师简介 -
基本信息
姓名*张子丁
姓名拼音ZHANG Ziding
教师号不公开
出生日期不公开
性别男
所属院系生物学院
国籍中国
民族汉族籍贯不公开参加何党派不公开加入党派时间不公开最高学历博士研究生最高学位博士毕业学校天津大学毕业时间2000-02-29最高学位授予国别中国最高学位授予单位天津大学最高学位授予专业最高学位授予时间2000-03-01外语语种英语外语熟练程度熟练来校时间不公开参加工作时间不公开在职状态不公开教师来源不公开职称教授职称评聘时间不公开职务无任职时间不公开证件类型不公开证件号码不公开办公电话**家庭电话不公开手机不公开传 真不公开通信地址生物学院邮政编码100193电子邮箱zidingzhang@cau.edu.cn教师主页http://protein.cau.edu.cn导师类型博导兼硕导是否外聘否兼职聘期起始日期兼职聘期终止日期兼职所在原单位是否在外单位担任兼职导师不公开主要兼职单位名称不公开专家类别新世纪及跨世纪优秀人才从事学科专业1生物学0710Z1-生物信息学从事学科专业2首任导师时间2006-03研究方向1蛋白质生物信息学研究方向2计算系统生物学研究方向3研究方向4备注

目前指导研究生
在籍

博士研究生3人 （其中 2012级:1 2013级:1 2015级:1） 硕士研究生5人 （其中 2014级:2 2015级:3）
不在籍
博士研究生11人 （其中 2005级:1 2007级:2 2008级:4 2009级:1 2010级:2 2011级:1） 硕士研究生9人 （其中 2008级:2 2009级:1 2012级:2 2013级:4）
个人简历
张子丁，男，1973年出生，博士、教授、博士生导师。1994、1997和2000年在天津大学获学士、硕士和博士学位。受瑞典SWEGENE博士后基金资助，2000年7月到2002年4月在瑞典隆德（Lund）大学分子生物物理系从事结构生物信息学的研究工作。2002年5月到2005年10月在瑞士雀巢研究中心从事生物信息学在食品和营养工业中的应用研究。2005年11月至今，作为引进优秀学术人才，在中国农业大学生物学院植物系全职工作, 任农业生物技术国家重点实验室课题组长，学院生物信息教学团队负责人。2006年入选“教育部新世纪优秀人才支持计划”。在国家自然科学基金和科技部863计划的支持下，近年来的主要研究方向为蛋白质生物信息学和计算系统生物学及其在农业相关的功能基因组研究中的应用。迄今为止，已在包括Briefings in Bioinformatics, BMC Genomics, PLoS ONE, Plant Cell 和Plant Physiology在内的国际同行评议的核心期刊上，发表论文70余篇，被引总数达1000余次；长期担任Bioinformatics, BMC Bioinformatics, 以及Briefings in Bioinformatics等多种国际期刊的论文审稿人。

遴选学科专业
不公开
论文与专著
近五年代表性论文如下：

Zhou Y, Liu S, Song J & Zhang Z (2013) Structural propensities of human ubiquitination sites:accessibility, centrality and local conformation. PLoS ONE, 8: e83167.
Chen Z, Wang Y, Zhai Y-F, Song J & Zhang Z (2013) ZincExplorer: an accurate hybrid method to improve the prediction of zinc-binding sites from protein sequences. Mol BioSyst, 9: 2213-2222. Chen Z, Zhou Y, Song J & Zhang Z (2013) hCKSAAP_UbSite: Improved prediction of human ubiquitination sites by exploiting amino acid pattern and properties. BBA - Proteins and Proteomics, 1834: 1461-1467. Dong X, Zhang Y-J & Zhang Z (2013) Using weakly conserved motifs hidden in secretion signals to identify type-III effectors from bacterial pathogen genomes. PLoS ONE, 8: e56632.Han L, Zhang Y-J, Song J, Liu MS & Zhang Z (2012) Identification of catalytic residues using a novel feature that Integrates the microenvironment and geometrical location properties of residues. PLoS ONE, 7: e41370.Li Z-G, He F, Zhang Z & Peng Y-L (2012) Prediction of protein-protein interactions between Ralstonia solanacearum and Arabidopsis thaliana. Amino Acids, 42: 2363-2371.Zhou Y, Zhou Y-S, He F, Song J & Zhang Z (2012) Can simple codon pair usage predict protein-protein interaction? Mol BioSyst, 8: 1396-1404.Zhou Y, Liu J, Han L, Li Z-G & Zhang Z (2011) Comprehensive analysis of tandem amino acid repeats from ten angiosperm genomes. BMC Genomics, 12: 632.Wang X-F, Chen Z, Wang C, Yan R-X, Zhang Z & Song J (2011) Predicting residue-residue contacts and helix-helix interactions in transmembrane proteins using an integrative feature-based random forest approach. PLoS ONE, 6: e26767.Chen Z, Chen Y-Z, Wang X-F, Wang C, Yan R-X & Zhang Z (2011) Prediction of ubiquitination sites by using the composition of k-spaced amino acid pairs. PLoS ONE, 6: e22930.Wang T-Y, He F, Hu Q-W & Zhang Z (2011) A predicted protein–protein interaction network of the filamentous fungus Neurospora crassa. Mol BioSyst,7: 2278-2285.Yan R-X, Chen Z & Zhang Z (2011) Outer membrane proteins can be simply identified using secondary structure element alignment. BMC Bioinformatics, 12: 76.He F, Zhou Y & Zhang Z (2010) Deciphering the Arabidopsis floral transition process by integrating a protein-protein interaction network and gene expression data. Plant Physiol, 153: 1492-1505.Yan R-X, Si J-N, Wang C & Zhang Z (2009) DescFold: A web server for protein fold recognition. BMC Bioinformatics, 10: 416.
近五年承担的主要项目
课题组已完成国家自然科学基金青年基金1项，面上项目1项，国家“十一五”863计划生物信息与生物计算技术专题1项和教育部新世纪优秀人才资助计划1项。课题组正承担国家自然科学基金面上项目2项，教育部博士点基金1项。




承担的教学工作
蛋白质生物信息学（研究生）

生物信息学（参讲、本科生）

结构生物学（参讲、本科生）