樱桃种质SCoT分子标记与叶片表型性状关联分析

彭芳芳¹, 龙治坚², 魏召新¹, 李勋兰¹, 罗友进¹, 韩国辉^1,*()

¹重庆市农业科学院果树研究所,重庆 401329
²西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010

收稿日期:2020-10-15修回日期:2020-12-17出版日期:2021-02-25发布日期:2021-03-09
通讯作者:韩国辉E-mail:hghui2007@126.com

基金资助:重庆市基础与前沿创新专项(cstc2016jcyjA0046);重庆市科研机构绩效激励引导专项(cstc2018jxjl0118);重庆市技术创新与应用发展专项(cstc2019jscx-msxmX0371);重庆市农发资金-良种创新重大项目(NKY-2016AA002)

Association Analysis of SCoT Markers and Leaf Phenotypic Traits in Cherry Germplasm

PENG Fangfang¹, LONG Zhijian², WEI Zhaoxin¹, LI Xunlan¹, LUO Youjin¹, HAN Guohui^1,*()

¹Fruit Research Institute,Chongqing Agriculture Science Academys,Chongqing 401329,China
²College of Life Science and Engineering,Southwest University of Science and Technology,Mianyang,Sichuan 621010,China

Received:2020-10-15Revised:2020-12-17Online:2021-02-25Published:2021-03-09
Contact:HAN Guohui E-mail:hghui2007@126.com

摘要/Abstract

摘要： 利用本研究中建立的樱桃SCoT标记分析体系,进行适宜引物筛选,进而对12个樱桃品种进行SCoT分子标记、叶片表型性状遗传多样性及两者关联分析。结果显示：从102条SCoT标记引物中筛选出46条适宜樱桃遗传分析的标记引物,筛选率达45.1%;参试的18条SCoT引物共获得等位位点数77个,其中多态性位点65个,多态性比率84.4%;12个樱桃品种的表型叶片性状变异系数为11.49% ~ 36.93%,叶片性状与SCoT标记聚类分析结果基本一致;Pearson’s 相关分析表明,共有54个标记位点与12个性状呈显著或极显著相关;多元线性逐步回归分析获得了8个与叶片性状极显著相关的特异标记位点,解释了叶片性状47.8% ~ 100.0%的变化;对8个关联标记进行序列比对分析,有5个标记能在樱桃基因组中找到同源序列,相似性均达75%以上,并能明确其染色体位置,其中4个标记能够在NCBI中比对到具有功能注释的同源序列,另3个标记未比对到同源序列。
中图分类号:
S662.5

引用本文

彭芳芳, 龙治坚, 魏召新, 李勋兰, 罗友进, 韩国辉. 樱桃种质SCoT分子标记与叶片表型性状关联分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(2): 325-335.
PENG Fangfang, LONG Zhijian, WEI Zhaoxin, LI Xunlan, LUO Youjin, HAN Guohui. Association Analysis of SCoT Markers and Leaf Phenotypic Traits in Cherry Germplasm[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(2): 325-335.





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