香椿染色体核型分析及SSR分子标记开发
于鹏飞1,2,孙晓健2,李晨晨2,张 旭2,郑 威2,刘常金1,2,*1天津科技大学新农村发展研究院,天津 300457;2天津科技大学食品工程与生物技术学院,天津 300457
出版日期:
2019-06-25发布日期:
2019-06-25基金资助:
天津科技大学新农村研究发展研究院开放课题(xnc201705)Chromosome Karyotype Analysis and Development of SSR Molecular Markers in Toona sinensis
YU Pengfei1,2,SUN Xiaojian2,LI Chenchen2,ZHANG Xu2,ZHENG Wei2,and LIU Changjin1,2,*1Institute of New Rural Development,Tianjin University of Science & Technology,Tianjin 300457,China;2College of Food Engineering and Biotechnology,Tianjin University of Science & Technology,Tianjin 300457,China
Online:
2019-06-25Published:
2019-06-25摘要/Abstract
摘要: 对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条,为2A型,香椿的染色体较为原始,变异较小。转录组测序结果共获得66 921条Unigene,从中检索得到13 324个SSR位点,分布于11 184条Unigene中,SSR出现频率为19.91%,平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占SSR总数的62.33%、19.66%和15.99%,单核苷酸A/T为优势重复基元,占总SSR的62.23%,二核苷酸以AG/CT为主要重复基元,占总位点的10.31%,三核苷酸以AAG/CTT为主要重复基元,占4.85%。利用Primer 3.0设计了8 218对引物,随机选取了19对引物对17个香椿种质进行PCR扩增,6对引物显示出可重复的多态性。
中图分类号:
S 644.4
引用本文
于鹏飞1,2,孙晓健2,李晨晨2,张 旭2,郑 威2,刘常金1,2,*. 香椿染色体核型分析及SSR分子标记开发[J]. 园艺学报, 2019, 46(6): 1172-1182.
YU Pengfei1,2,SUN Xiaojian2,LI Chenchen2,ZHANG Xu2,ZHENG Wei2,and LIU Changjin1,2,*. Chromosome Karyotype Analysis and Development of SSR Molecular Markers in Toona sinensis[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(6): 1172-1182.
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