红富士苹果芽变系DNA甲基化研究

杜晓云1，宋来庆1，赵玲玲1,3，刘美英1，唐 岩1，孙燕霞1，姜中武1,3,*，束怀瑞1,2,*

（1烟台市农业科学研究院，山东烟台 265599；2山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室，山东泰安 271018；3烟台大学，山东烟台 264005）

出版日期:2019-01-25发布日期:2019-01-25

DNA Methylation in Red Fuji Apple Bud Sports Lines

DU Xiaoyun1，SONG Laiqing1，ZHAO Lingling1,3，LIU Meiying1，TANG Yan1，SUN Yanxia1，JIANG Zhongwu1,3,*，and SHU Huairui1,2,*

（1Yantai Academy of Agricultural Sciences，Yantai，Shandong 265599，China；2College of Horticulture Science and Engineering，Shandong Agricultural University/State Key Laboratory of Crop Biology，Tai’an，Shandong 271018，China；3Yantai University，Yantai，Shandong 264005，China）

Online:2019-01-25Published:2019-01-25

摘要/Abstract

摘要： 以35份富士苹果（Malus × domestica Borkh.‘Fuji’）芽变材料为试材，利用甲基化敏感扩增多态性（Methylation Sensitive Amplified Polymorphism，MSAP）分析和UPGMA聚类方法，对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明：（1）不同富士系得到不同的MSAP扩增，总DNA甲基化水平27.90% ~ 36.16%，平均32.87%，双链全甲基化为主要甲基化方式；（2）富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式；（3）绝大多数芽变（68.57%）检测到全部的甲基化变异模式（12种），去甲基化频率极显著高于甲基化频率（P < 0.01），且CG去甲基化极显著高于CHG；（4）36份种质遗传相似系数平均值0.89（0.79 ~ 0.92），在聚类图上，富士原种分布在芽变系集中区外，新近发生的芽变系更倾向于聚在一起，着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态。总的来看，富士芽变的甲基化变异模式丰富，超甲基化和去甲基化相伴发生，但以去甲基化为主；‘富士’着色芽变与其最原始品种富士，以及芽变之间发生了较大表观遗传变异；片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性。本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导，可以CG去甲基化为切入点展开深入研究。
中图分类号:
S 661.1

引用本文

杜晓云1，宋来庆1，赵玲玲1,3，刘美英1，唐 岩1，孙燕霞1，姜中武1,3,*，束怀瑞1,2,*. 红富士苹果芽变系DNA甲基化研究[J]. 园艺学报, 2019, 46(1): 107-120.
DU Xiaoyun1，SONG Laiqing1，ZHAO Lingling1,3，LIU Meiying1，TANG Yan1，SUN Yanxia1，JIANG Zhongwu1,3,*，and SHU Huairui1,2,*. DNA Methylation in Red Fuji Apple Bud Sports Lines[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(1): 107-120.





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