辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

张焕欣，董春娟，尚庆茂*

（中国农业科学院蔬菜花卉研究所，农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100081）

出版日期:2017-12-25发布日期:2017-12-25

Genome-wide Identification and Expression Analysis of GRAS Gene Family in Pepper

ZHANG Huanxin，DONG Chunjuan，and SHANG Qingmao*

（Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops，Ministry of Agriculture，Beijing 100081，China）

Online:2017-12-25Published:2017-12-25

摘要/Abstract

摘要： 基于辣椒全基因组数据信息，利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析，并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答。结果表明：在辣椒中存在54个CaGRAS基因，除11号染色体外其余染色体均有分布，外显子数1 ~ 3，等电点4.97 ~ 9.13；系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群；CaGRAS基因具有不同的表达模式，在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个；多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫，其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导。本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础。
中图分类号:
S 641.3

引用本文

张焕欣，董春娟，尚庆茂*. 辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(12): 2305-2317.
ZHANG Huanxin，DONG Chunjuan，and SHANG Qingmao*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of GRAS Gene Family in Pepper[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(12): 2305-2317.





PDF全文下载地址:

http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6167