生物芯片作为制约生物育种的关键技术，从源头上决定了种业科技水平和国家粮食安全。长期以来，我国依赖跨国公司进行高密度固相芯片的设计、制作和检测，导致与芯片有关的分子育种成本高昂、种业发展受到极大限制。因此亟待发展能够替代固相生物芯片、更加简单高效的分子检测方法和技术。
该联合研究小组首先从玉米基因组中挑选多态性高、缺失率低、分布均匀的20K SNP标记，结合靶向测序基因型检测技术，对标记探针进行液相捕获，完成了一系列液相芯片标记的开发。随后，经过技术优化和改进，实现单个位点扩增多个SNP（mSNP），并使液相芯片的检测效率增加到40K mSNP、260K SNP、912K 单倍型，通过控制测序深度可以获得1K-40K的任意位点。联合研究小组以玉米为例，采用867份玉米自交系和不同标记类型，通过多样性、群体结构、连锁非平衡衰减和全基因组关联分析，进行了技术验证。
靶向测序-液相芯片技术具有平台广适性、标记灵活性、检测高效性、信息可加性、支撑便捷性和应用广谱性，可取代现有固相芯片，应用于基因组学、遗传学和育种。目前已经在13种农作物、蔬菜以及动物和微生物中开发了液相芯片50余套。（通讯员 卫斐）
