中国农科院作物科学研究所是按照国家科技体制改革的要求，于2003年将作物育种栽培研究所、作物品种资源研究所和原子能利用研究所的育种研究部分进行战略性重组而成立的国家非营利性研究机构，隶属于中国农科院。是以作物品种资源、遗传育种、分子生物学和栽培生理为主要研究领域的国家级作物科学创新中心、国际合作中心和高级科技人才培养基地。其方向任务是以作物种质资源为基础，以品种选育为核心，通过分子育种与常规育种的结合，培育作物优良品种，发展优质、高产、高效栽培技术，促进农民增收和农业可持续发展。现任所长是长江计划特聘教授万建民博士。

　　作物科学研究所机构设置为：管理机构有综合办公室、科研处和人事处（党办），服务机构有科技服务中心和试验农场，研究机构有作物种质资源保护与研究中心、作物遗传育种系、作物分子生物学系、作物栽培生理系和学报编辑部。是国家小麦改良中心、国家农作物种质资源保存中心、国家大豆改良分中心（北京）、农业部作物遗传育种重点开放实验室、农业部作物种质资源与生物技术重点实验室、农业部农业核技术与航天育种重点开放实验室、农业部谷物品质监督检验测试中心、农业部作物种质资源监督检验测试中心的依托单位，农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程是其主要的科技创新平台。

　　现有在职职工314人，离退休职工313人。在职职工中，有科技创新人员179人，其中中国科学院院士和中国工程院院士各1人，长江计划特聘教授1人，国家级有突出贡献中青年专家2人，省、部级有突出贡献中青年专家10人，博士生导师34人，农科院杰出人才一级岗位8人，二级岗位19人，三级岗位9人，有研究员57人，副研究员84人，获得博士学位人员有62人。拥有作物种质资源学、作物遗传育种学、生物化学与分子生物学、作物栽培与耕作学、作物信息学、植物病理学博士学位授予点 , 设有作物种质资源学、作物遗传育种学、生物化学与分子生物学、作物栽培与耕作学博士后流动站。

　　全所现有10万元以上大型仪器设备100多台件，房屋建筑面积6万多平方米，试验地60多公顷，科研试验设施近万平方米。

　　作物科学研究所是中国作物学会、中国农学会遗传资源分会和中国农业生物技术学会作物生物技术分会的挂靠单位。编辑出版的期刊有：《作物学报》《植物遗传资源学报》《作物杂志》和《中国种业》。

　　作物科学研究所长期主持和承担国家重点基础研究发展计划 “973” 项目 、国家高技术研究发展计划 “863” 项目 、国家重点科技攻关项目 、国家自然科学基金项目 、国家转基因植物专项、农业部种质资源保护专项、科技部自然资源科技平台项目以及国际合作项目等。编写出版了《中国小麦品种改良及系谱分析》等科学专著和科普书刊逾百部。获得科研成果奖146项，其中包括自然科学奖1项、国家发明奖5项、国家科技进步奖16项、全国科学大会奖8项和省部级奖116项，育成通过国家和省级审定品种150个。部分成果达到国际先进水平。

　　随着人才队伍的不断壮大，科研条件的不断改善，国际交往的不断发展，科研工作的不断深入，作物科学研究所必将为中国农业生产的发展做出新的更大的贡献。