园艺系是北京农学院建校以来最早创建的传统系之一，是我校的优势院系。目前有园艺专业1个本科专业，2008年被批准为北京市级特色专业和国家级特色专业建设点，2014年园艺专业开始一本招生。2017年入选北京市首批一流专业，2018年入选北京市高精尖共建学科。现设有园艺学一级学科，覆盖“果树学”和“蔬菜学”2个二级学科，其中果树学科为北京市重点建设学科，蔬菜学科为校级重点建设学科。2005年开始招收研究生，也是我校最早的园艺学、果树学、蔬菜学硕士学位授予点。
园艺系拥有雄厚的师资力量，目前共有教职工26人，其中教授11（博士生导师7人），副教授9人，讲师4名，高级实验师1名，实验师1名。其中享受政府特贴专家2名；北京市教学名师2名；行业体系岗位专家4名；入选北京市科技新星6人。近五年承担国家“973”项目1项、“863”项目1项、国家科技支撑计划项目4项，国家自然科学基金项目22项、省部级课题60余项，年均实到科研经费达800余万元，发表有影响力的SCI论文近60篇，先后获得国家科技进步奖二等奖1项，省部级以上科技成果奖17项，获得授权专利33项。
目前，园艺专业在校本科生达220名左右，硕士研究生约80名。近年来毕业生就业形势好，园艺专业连续多年一次就业率达97%以上。在本科教学上我们一直致力于培养具有国际视野的高素质现代都市园艺创新人才，本科毕业生1/3左右赴国内外名校和科研单位攻读硕士，出国留学的比例逐年增加，另外1/3左右本科毕业生在政府、教学和科研单位、企事业单位中就职。同时园艺系拥有优秀的校友，历届毕业生中有教授、研究员和企业家，也有省级和地市级领导，还有一批活跃在国际学术和国际贸易舞台上的毕业生，在不同岗位为国家现代化建设发挥着积极和重要的作用。