合肥工业大学电气与自动化工程学院的历史可追溯到50年代前后淮南工专的矿山机电专业，解放后得到新生，历经淮南煤专、淮南矿院等阶段。随1958年合肥工业大学的成立更是不断发展。文革后面貌日新月异，专业教学内容紧随现代科技发展不断更新，教学水平和教学手段不断提高，具备了成批培养博士、硕士研究生的能力，科研力量由薄弱到雄厚，承担相当数量的科研项目并取得一批高水平的科研成果。
　　
　　全院现有在册职工152人，拥有教学科研人员110人（兼职2人），实验室人员28人和行政人员14人。教学科研人员中有正高18人，副高42人，其中博士生导师7人，硕士生导师36人。除了一些在省内外有一定影响的专家，还涌现了一批中青年高层次人才，现有进入百千万工程者2人、省部级学科带头人培养对象5人、中青年学术骨干培养对象7人。
　　
　　学院下设电气工程、自动化、电工理论与新技术和生物医学工程等4个系；电工电子实验中心、电气与自动化专业中心实验室等两个实验基地；能源和微电子设计等2个研究所和合肥工业大学电气能源公司。现拥有工业自动化、电气工程及其自动化、生物医学工程等3个本科专业；控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、电力电子与电力传动、电力系统及其自动化、电机与电器、电工理论与新技术等6个硕士专业和电力电子与电力传动1个博士专业。此外还有电气工程和控制工程2个工程硕士专业。在上述各学科点中，电力电子与电力传动为国家和省重点学科，控制理论与控制工程为省重点学科。