生物化工学科是浙江省重点学科，2003年批准为博士学位授权点，1998年批准为硕士学位授权点，该学科设有生物工程研究所、制药工程研究开发中心制药生物技术实验室、浙江省制药工程重点实验室制药生物技术方向、绿色化学国家重点实验室培育基地生物合成技术研究方向等教学科研机构。拥有一支有较高学术水平的学科队伍，其中有中国工程院院士1人，教授11人，副教授16人，浙江省“151人才工程”人员1人，浙江省高校中青年学科带头人3人，浙江省特聘教授“钱江学者”1人。

　　近年来，学科承担了国家973计划项目、国家自然科学基金、国家“九五”“十五”科技攻关重点项目、浙江省科技攻关重大项目、浙江省自然科学基金重大项目、杭州市科技攻关重大项目及重大科技开发校企合作项目等60多项，获得过国家科技进步二等奖、国家科技攻关优秀奖、省部级科技进步一等奖和二等奖等高级别奖项多项，发表学术论文200多篇，其中多篇发表在《Chemical Reviews》、《Biotechnology Progress》、《Biochemical Engineering Journal》等国际著名高级刊物上，并被SCI、EI收录。