1、养殖领域（095105）
养殖领域是有关该领域应用技术开发与推广的专业学位，侧重于水产养殖种质种苗、安全养殖工艺与技术、养殖水域环境管理与评估方面新技术开发与应用，为水产养殖有关教育、科学研究、开发、以及技术推广与管理部门培养应用型、复合型高层次技术和管理人才。
我校养殖领域农业推广硕士专业学位主要面向种质与种苗工程、安全养殖技术、现代养殖设施工程技术、水域环境管理与评估等方向开展人才培养。依托浙江海洋学院水产学院、海科学院和海洋与渔业研究所的水产学（省重点一级学科、硕士学位点），及海洋生物学学科（省重点学科、硕士学位点）和以学科成员为主体的“海洋渔业科学与技术”学科（浙江省重中之重学科）。
我校养殖领域设有国家海洋设施养殖工程技术研究中心、浙江省海水增养殖重点实验室、浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江省海洋增养殖工程技术研究中心、深水网箱省级高新技术研究开发中心、中俄浙江东海海洋养殖工程技术研究中心、中挪海水鱼类营养与饲料联合实验室、农业部渔业环境及水产品质量检验监督测试中心（舟山）、浙江省海水养殖病害防治中心、渔业科学研究所、海洋科学研究所等科研机构，设有博士后科研工作站，配有海水养殖装备与工程技术重点实验室、生物化学与分子生物学重点实验室、海水养殖生物遗传与发育实验室、海洋生物资源和分子工程实验室、水产养殖、海洋生物等水产养殖相关实验室，并与国内外相关科研院校、渔业主管部门和渔业生产企业建立了良好的合作关系。现有专业教师及科研人员40余人，其中具有正高职称的14人，副高职称的16人，博士学位12人，其中国家有突出贡献中青年专家、全国劳动模范、全国优秀农业科技工作者、省农业科技突出贡献者入选浙江省“151人才工程”第一层次各1人、省农业科技先进工作者和省中青年学科带头人各2人。现有高级职称成员中，绝大多数具有较为丰富的养殖生产一线经验，部分还具有指导硕士、博士研究生的经历。
历年来，养殖领域在学科在对虾工厂化全人工育苗、海带南移养殖、紫菜养殖、深水网箱养殖技术、水生生物高产安全精养模式、滩涂敌害防控等方面取得了一批在国内有较大影响力的科研成果，曾获国家科技进步一、二、三等奖各1项、全国科学大会奖3项、省部级科技奖励20多项，为我省乃至我国的水产养殖事业的发展做出了积极的贡献，赢得了良好的社会声誉。
近年来养殖领域先后承担了国家“863”、国家科技支撑计划和农业部、教育部、海洋局及浙江省科技厅等省部级以上项目60余项，出版《深水网箱养殖技术》等著作和教材10余部，发表论文300余篇。
2、渔业领域（095108）
渔业领域农业推广硕士专业学位是有关该领域应用技术开发与推广的专业学位，侧重于渔业新技术开发与应用，为渔业有关教育、科学研究、开发、以及技术推广与管理部门培养应用型、复合型高层次技术和管理人才。
我校渔业领域农业推广硕士专业学位主要面向现代渔业工程、海洋生物资源与环境、渔业管理等方向开展人才培养。依托浙江海洋学院水产学院、海科学院和海洋与渔业研究所的水产学（省重点一级学科）、海洋科学学科（省重点学科）。其中水产学科下辖的二级学科捕捞学始建于1958年的舟山水产学院，是省内唯一设置的学科，1997年起捕捞学学科被浙江省教委批准为省重点学科，2004年海洋生物学学科被省教育厅批准为省重点学科，2008年，海洋渔业科学与技术专业被列为省重中之重学科。渔业资源学、水产养殖学均为校级重点学科。2006年捕捞学和海洋生物学学科获硕士学位授予权，2011年水产一级学科获得得硕士学位授予权。本领域目前已招收四届硕士研究生（26人），三届已经毕业生获得学位（16人）。
我校渔业领域设有农业部渔业环境及水产品质量检验测试中心、东海区渔业资源动态监测网浙江省监测站、浙江省海水增养殖重点中试基地、浙江省渔业环境监测站、浙江省远洋渔业培训中心、深水网箱省级高新技术研究开发中心、浙江海洋学院渔业科学研究所、海洋资源与环境科学研究所等多个科研机构。建有海洋渔业、资源与环境、海洋生物等一批水产类实验室。并与国内外相关科研院校、渔业主管部门和渔业生产企业建立了良好的合作关系。
渔业领域现有专业教师及科研人员60余人，其中具有正高职称的14人，副高职称的30余人，博士学位10余人，享受国务院特殊津贴5人，入选浙江省“151人才工程”第一、二层次5人，省中青年学科带头人4人，全国劳动模范1人，省农业科技突出贡献奖1名，省农业科技先进工作者2人。
历年来，渔业领域曾获国家科技进步一、二、三等奖各1项、全国科学大会奖6项、省部级奖50多项，为我省乃至我国渔业的发展做出了积极的贡献，赢得了良好的社会信誉。近5年来，渔业领域承担了国家科技支撑计划项目、国家自然科学基金、国家“863”计划项目、国家星火计划项目、浙江省科技厅重大攻关项目、省自然科学基金等科研项目80余项，研究经费5500多万元，获国家和省部级科研成果奖近20项，出版著作/教材20余部，发表学术论文300多篇，若干领域研究水平和众多研究项目居国内先进、省内领先水平。
3、农业机械化领域（095109）
农业机械化领域主要研究方向有：渔船与捕捞装备、水产机械化工程和渔业机械现代化。渔船与捕捞装备方向主要研究现代渔船设计建造方法、渔船轮机工程与管理、新船型开发与节能、捕捞装备等；水产机械化工程方向主要研究海洋牧场工程装备、设施渔业工程装备、高密度、集约化、机械化、工厂化水产养殖装备，水产品活体运输设施以及水产品精深加工装备等；水渔业机械现代化方向主要研究以“绿色、安全、高效、节能”为目标，研究和推广渔船、渔机、渔仪、渔具的标准化、自动化和信息化。
农业机械化领域以农业机械化尤其是渔业机械化为宗旨，主要为渔政管理、渔船检验、渔船设计制造管理维护、水产养殖、水产品加工等企事业单位和管理部门培养与该领域相关的应用型、复合型高层次人才。
本领域依托船舶与海洋工程学院，开设有机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、机械电子工程、船舶与海洋工程、海洋工程与技术、船舶电子电器、电子信息工程等7个全日制本科专业。其中，船舶与海洋工程专业为国家级第一类特色专业建设点、浙江省普通高校重点专业，机械设计制造及其自动化专业为浙江省普通高校重点专业。“船舶与海洋工程”为一级学科，“船舶与海洋结构物设计制造”为省级重点学科。
本领域现有专业师资70余人，其中教授12人，副教授（含副研究员、高级工程师、高级实验师）21人，博士学位24人，省高等学校教学团队1支，省级高校教学名师2人，省高校中青年学科带头人3人，省“151”工程人选6人，省高校优秀青年教师6人。
本领域拥有浙江省重点学科“船舶与海洋结构物设计制造”，建有“浙江省船舶先进制造技术研发中心”、“浙江省挤出机工程技术研究中心”、“舟山造船技术区域科技创新服务中心”、“舟山海洋腐蚀与防护研究发展中心”、“先进制造技术研究所”、“船舶机电研究所”等多个省市校级研究机构。建有机械基础实验室、先进制造技术实验室、自动化中心、船舶工程技术实训中心、船舶与渔具水动力实验室、船舶设计与建造实验室、船舶操纵性实验室、船舶CAE实验室、新船型开发实验室、渔船建造仿真实验室、流体力学实验室等。实验室面积9000多平方米，拥有10万元以上仪器设备140多台，仪器设备值1739.5万元。
近五年来，该领域承担各级各类科研项目140余项，其中国家自然科学基金6项，国家星火计划5项，省部级项目40项，厅局级项目40项，到位科研经费1200余万元，其中横向课题经费300余万元。获得省级科技进步三等奖一项，舟山市科技进步三等奖一项，浙江省教育厅科技成果三等奖一项，局级成果奖10项，省级优秀论文奖15项。
4、农村与区域发展领域（095110）
农村与区域发展领域的主要研究方向有区域经济与管理、新农村政治与社会发展、农村文化建设与区域发展。区域经济与管理方向主要研究海洋产业政策与发展、港口物流与海洋货运、滨海旅游、农（渔）业技术推广项目设计与规划、农（渔）产品贸易与营销、农（渔）业新技术试验示范与新产品开发管理等。新农村政治与社会发展方向主要研究农（渔）村民主体制建设与改革、农（渔）村组织建设与管理、农（渔）村生态环境建设与管理、农（渔）村教育发展与管理、农（渔）村基层管理信息化等。农村文化建设与区域发展方向主要为农村的基层单位和管理部门培养与文化建设工作有关的复合型高层次人才。通过学习和培养，除了掌握农村与区域发展的系统基本理论、专业知识及管理能力外，尤其在农村文化建设和管理方面具有宽阔的视野、创新的意识和独立从事农村文化管理、开发和研究等工作的能力。
本领域分别依托我校教学科研实力雄厚的管理学院、人文学院、思政部，师资力量雄厚，现有专业师资100余人，其中教授（含研究员）27人，副教授（含副研究员、高级工程师）38人，获博士学位22人，硕士学位40余人，享受国务院特殊津贴1人，入选浙江省“151人才工程”1人，省高校中青年学科带头人3人，舟山市科学技术拔尖人才3人。建有港口物流实验实训中心、企业信息管理实验室、商务实验室、海洋旅游实验室一批社会经济管理类实验室，面积近1500 m2。实验室仪器设备价值800多万元。培养农村区域发展领域农业推广硕士的主要仪器设备基本齐全。拥有农村与区域发展领域中外文藏书10余万册，拥有中外文期刊150余种。开通了“超星电子图书”、“中国期刊全文数据库”、“中国优秀博硕士学位论文全文数据库”、“万方数据库”、“EBSCOhost”、“SpringerLink”等中外文图书、期刊网站。
近年来，本领域教师承担了国家级课题1项，省部级重大项目2项、省社科基金项目14项、省部级一般科研项目35项和一大批厅局级重点项目，年科研经费在600万元以上，科研成果丰硕。行政管理、海洋产业经济、港口物流、行政管理、海洋文化等若干研究领域水平和部分研究项目居国内先进、省内领先水平。其中中国古代文学学科组承担的黄式三、黄以周著作整理项目被列为国家清史工程、省文化研究工程和舟山市重大文化工程，在东海区域文化研究及文化建设方面取得了丰硕成果。
5、农业信息化（095112）
农业信息化领域的主要研究方向有农业信息化与信息管理、农业信息网络技术、模式识别与智能信息处理、农业信息检测与灾害预防以及电子商务与物流管理。农业信息化与信息管理主要研究农业信息系统的分析与实现，农业信息决策管理及应用等；农业信息网络技术方向主要研究农业信息资源采集与网络优化、网络安全技术；模式识别与智能信息处理主要研究农业信息的智能采集、农业数据仓库技术、图形图像处理，模式识别、智能决策等；农业信息监测技术的主要研究开发星、机、地所构成系统的技术，灾害预防方面主要研究将3S技术应用于灾害研究和预防，提出预防灾害的技术对策；电子商务与物流管理主要研究电子商务网站的建设与运作，农产品物流系统设计，解决新农村建设中的农业电子商务网络建设，农村专业协助组织电子商务应用，农产品物流运作中的构建与管理等问题。
农业信息化领域发展方向主要为农村的基层单位、管理部门以及涉农企业等培养农业信息化建设有关的复合型高层次人才。通过学习和培养，除了掌握农业信息化的系统理论、专业知识和基本技能外，尤其在农业信息的获取、智能处理、决策支持等方面具有开阔的视野、创新的意识和独立从事农业信息系统的开发和研究等工作的能力。
本领域依托我校教学科研实力雄厚的数理与信息学院，现有专业师资70余人，其中教授（含研究员）10人，副教授（含副研究员、高级工程师）16人，获博士学位20人，博士后2人，在读博士2人；具有硕士及以上学位者占83.43%，40岁以下的中青年教师全部具有硕士及以上学位(在读博士2人)；学缘结构上，非本校毕业的教师达到91.43%。入选浙江省“151人才工程”4人，省高校中青年学科带头人1人，舟山市科学技术拔尖人才1人，浙江省教坛新秀1人。
建有计算机网络实验室、计算机组装与维护实验室、计算机组成原理实验室、软件实验室、计算机接口实验室、嵌入式系统实验室、计算机中心、网络中心等一批校内实验室，校内实验室面积达1500m2。实验室仪器设备价值1000多万元。另外我校已向浙江省财政厅申请计算机应用技术实验室建设的专项资金项目，如获批准将建成包含机器视觉、RFID(无线射频识别技术)和信息安全三个教学实验中心在内的大型综合计算机应用技术实验室，实验条件和能力将有质的提升。培养农业信息化领域农业推广硕士的主要仪器设备基本齐全。拥有农业信息化领域中外文藏书10余万册，拥有中外文期刊150余种。
近年来，本领域教师承担了国家级课题4项，省部级重大项目2项、省自然科学基金项目2项、省部级一般科研项目4项和一大批厅局级项目，科研成果丰硕，特别是粗糙集的研究在全球有较高的知名度，在智能信息处理、模糊集、数据挖掘等若干研究领域水平和部分研究项目居国内先进、省内领先水平。
6、食品加工与安全领域（095113）
食品加工与安全领域设置有食品加工与贮藏工程、食品安全与卫生管理和天然产物的提取与应用三个方向。食品加工与贮藏工程方向主要研究食品加工新技术、新设备、新产品以及食品工业企业可行性论证和食品产业规划等；食品安全与卫生管理重点研究食品质量安全控制理论与技术、食品卫生监督高效运行新机制、城镇和乡村食品卫生监督与管理措施、食物中毒与食品污染应急处理技术等；天然产物的提取与应用主要研究海洋生物资源活性物质、天然产物分离提取技术和功能评价，以及在食品工业、化妆品行业、种养殖业、医药产业和其他领域的应用。本专业学位招收具有化学、生物学、工程学、医学、药学、卫生学等学科基础的本科毕业生。
本领域依托食品与医药学院和浙江省海洋水产研究所。食品与医药学院建有国家水产品头足类加工技术研发专业中心、浙江省海洋生物医用制品重点工程技术研究中心、浙江省水产品加工技术研究联合重点实验室、浙江海洋药物研究所等省部级科研平台，有水产品加工及贮藏工程和海洋生物医药省级重点学科、食品科学与工程和药学校级重点学科；开设有食品科学与工程、食品质量与安全、药学和生物制药工程4个本科专业，其中，食品科学与工程专业是十一五省重点专业和十二五省优势专业，水产食品课程群是省级教学团队，水产食品学是省级精品课程。学院除招收食品加工与安全领域在职和全日制硕士生、海洋资源利用与生物医药学术学位全日制硕士生外，还与西南大学、江南大学、福建农林大学、佳木斯大学等联合培养博士、硕士研究生。
学院现有全日制学生700余人，教职工49人，专任教师40人，其中教授9人，副高职称17人，博士生导师1人，硕士生导师25人，博士16人（其中博士后3人）；浙江省教学名师1人、浙江省农业科技先进工作者1人、浙江省151人才工程第二、三层次人才9名、浙江省中青年学科带头人3人、舟山市专业技术拔尖人才2名。有省级精品课程2门，校级精品课程1门，已完成或在建的校级重点建设课程11门，校级以上教改课题19项；获省级教学成果奖2项，校级教学成果奖5项；在全省建有50多家教学实习基地。有实验室面积12000平方米，内设食品科学与安全、药学、化学3个实验教学中心和海洋食品开发研究所、分子生物学研究室等3个科研平台，有电子鼻、食品物性仪、超滤系统、自动浓缩系统、蛋白纯化系统、原子吸收光谱、红外光谱仪、752PC紫外可见分光光度计、数码凝胶图像处理系统、CO2培养箱、高效液相色谱仪、日立大容量冷冻离心机、RM-624013多道生理记录分析处理系统、BX41-32H02奥林巴斯显微镜、酶标仪等大型设备，总价值超过3000万元。近5年来主持和承担各级各类科研课题70余项，其中国家支撑计划2项、国家自然科学基金7项、国家国际科技合作专项2项、国家星火计划10项，省部级科研项目50余项，获得以国家海洋创新成果一等奖为代表的各类科研奖励30余项次。
7、设施农业领域（095114）
设施农业领域主要研究方向有：农业建筑工程、渔业装备与技术、渔农业环境工程。农业建筑工程方向主要研究内容包括农业设施建筑设计、农业建筑新材料开发、农业建筑工程施工与管理等；渔业装备与技术主要研究内容包括渔业装备设计与开发、渔业节能技术、渔业装备安全保障技术和渔业装备应用与管理等；渔农业设施环境工程方向主要研究内容包括渔农业设施的环境调控与节能技术、渔农业设施环境测试与评估等。
设施农业领域以渔农业设施的设计、建造、经营与管理为主要研究对象，主要为渔农村管理、设施农业生产和制造、现代化养殖和种殖等企事业单位和管理部门培养与该领域相关的应用型、复合型高层次人才，可以从事渔农业设施的产业开发与规划、设施的设计与建造、设施技术的推广与应用、设施的生产、经营与管理等方面工作。
本领域依托海运与港航建筑工程学院，开设有土木工程、建筑环境与设备工程、港口航道与海岸工程、航海技术和轮机工程等5个全日制本科专业。本领域拥有水利工程、交通运输工程两个一级学科和轮机工程二级学科，建有土木工程实验室、港口航道与海岸工程实验室、建筑环境与设备工程实验室、轮机工程实验室和航海技术实验室等5个实验室。实验室面积5000多平方米，仪器设备值2000万元。拥有设施农业领域中外文藏书8万余册，拥有中外文期刊100余种，开通了“超星电子图书”、“中国期刊全文数据库”、“中国优秀博硕士学位论文全文数据库”、“万方数据库”、“Sciencedirect”“EBSCOhost”、“SpringerLink”等中外文图书、期刊网站。
本领域现有专业导师24人，其中教授7人，副教授（含副研究员、高级工程师、高级实验师）17人，其中博士生导师1人，博士16人，省级高校教学名师1人，省高校中青年学科带头人2人，省“151”工程人选6人。近五年来，该领域承担各级各类科研项目120余项，其中国家星火计划5项，省部级项目35项，厅局级项目25项，到位科研经费2500余万元。获得各类科技奖20余项，授权国家专利50余项