基本信息


姓名
彭玮

系、部门
计算机系

职称/职务
教授

导师类别
硕士生导师

学位
博士

电话
**

电子邮箱
weipeng1980@126.com；

办公地点
云南省计算机技术应用重点实验202室

研究方向
生物信息学、数据挖掘、机器学习、大数据等

个人情况简介

彭玮,教授，博士，硕士生导师，云南省****青年拔尖人才。从事的研究方向主要是生物信息学、机器学习与数据挖掘。针对海量、多维的生物医学大数据，利用网络来描述这些数据及之间关系。研究的重点集中在设计图论与组合优化算法、数据挖掘与机器学习算法等对高通量多组学数据进行挖掘，提出一系列算法来解决与复杂疾病相关的基因功能预测、非编码RNA识别、药物靶标识别以及微生物的识别，开发相关工具软件供生物医学人员使用。在IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB)、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics(JBHI)、BMC Systems Biology、BMCGenomics、Methods等国际知名的SCI期刊或国际高水平EI会议上发表学术论文40余篇。主持国家自然科学基金3项，云南省应用基础研究重点项目及面上项目各1项、云南省****青年拔尖人才项目1项、云南省级人才培养项目1项。获得云南省科技进步一等奖1项。出版学术专著1部，授权发明专利1项，获软件著作权2项。参与了云南省政协、社保、大理政协等政府机关和企事业单位的横向合作项目10余项。是昆明理工大学先进计算软件技术与应用云南省级创新团队的主要成员。中国计算机学会生物信息学专业委员会委员，中国自动化学会智能健康生物信息专业委员会委员，ACM SIGBio专业委员会委员。参与组织GIW2019，InCoB 2021，BIBM，ISBRA，CBC等多项国内外会议。

学习工作经历

1998-2002年本科毕业于昆明理工大学信息工程与自动化学院计算机科学与技术专业。
2002-2005年硕士研究生毕业于昆明理工大学信息工程与自动化学院计算机应用技术专业。
2010-2013年博士研究生毕业于中南大学信息科学与工程学院计算机应用专业
2015-2016年在佐治亚州立大学,计算机系做访问****。

代表性成果（每类不超过10个）

（1）获奖情况
1、快速可定制柔性调度生产物流系统，云南省科技进步一等奖，2015-2-15，排名第6
2、论文“Computational approaches for prioritizing candidate disease genes based on PPI networks”(Tsinghua Science and Technology, 2015, 20(5):500-512)获得了Tsinghua Science and Technology 2016年最佳论文奖。
3. 2017年获昆明理工大学“红云园丁奖”
（2）教学/科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目，基于异质属性网络表征学习的识别癌症驱动基因算法研究(No. **)，2020.1-2023.12，课题负责人
2. 国家自然科学基金地区科学基金项目，融合功能元素网络的肿瘤异质性推断算法研究 (No. **)，2016.1-2019.12，课题负责人
3. 国家自然科学基金青年科学基金项目，基于多生物网络的蛋白质功能预测算法研究 (No. **)，2016.1-2018.12，课题负责人
4. 云南省应用基础研究重点项目，融合多生物网络的疾病相关miRNA识别算法研究 ，2019.10- 2022.10，课题负责人
5. 云南省****青年拔尖人才项目，集成多元生物信息的癌症驱动基因识别算法研究，2019.01-2023.12，课题负责人
6. 云南省应用基础研究面上项目，基于动态蛋白质相互作用网络的关键蛋白质识别方法及应用研究(No. 2016FB107)，2016.10- 2019.09，课题负责人
7. 昆明理工大学省级人才培养项目，基于随机游走模型的蛋白质网络分析及应用研究（KKSY ），2014.06-2017.05，课题负责人
（3）论文
1．Wei Peng(*通讯), TielinChen and Wei Dai, "Predicting Drug Response Based on Multi-omics Fusion and Graph Convolution," in IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, doi: 10.1109/JBHI.2021.**.
2．Wei Peng(*通讯), Sichen Yi, Wei Dai, and Jianxin Wang. "Identifying and ranking potential cancer drivers using representation learning on attributed network." Methods 192 (2021): 13-24.
3．Wei Peng(*通讯), Jielin Du, Wei Dai, and Wei Lan. "Predicting miRNA-disease association based on modularity preserving heterogeneous network embedding." Frontiers in Cell and Developmental Biology (2021):9.
4．Junrong Song, Wei Peng (*通讯)，Feng Wang,An Entropy-based method for identifying mutual exclusive driver genes in cancer. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB),2019,17(3): 758-768.;
5．Junrong Song, Wei Peng(*通讯), Feng Wang, "A random walk-based method to identify driver genes by integrating the subcellular localization and variation frequency into bipartite graph", BMC Bioinformatics, 2019, May, 14, 20, 1, 238
6．Wei Peng(*通讯), Wei Lan, Jiancheng Zhong, Jianxin Wang, Yi Pan, A novel method of predicting microRNA-disease associations based on microRNA, disease, gene and environment factor networks.[J]. Methods, 2017, 124:69.
7．Wei Peng, Min Li, Lu Chen and Lusheng Wang,Predicting protein functions by using unbalanced random walk algorithm on three biological networks, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB), 2017, 14(2): 360-369.
8．Wei Peng, Jianxin Wang, Bihai Zhao and Lusheng Wang,Identification of protein complexes using weighted PageRank-Nibble algorithm and core-attachment structure, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), 2015, 12(1): 179-192.
9．Wei Peng, Jianxin Wang, Yingjiao Chen, Yu Lu, and Yi Pan,UDoNC:a method for identifying essential proteins based on protein domains in protein-protein interaction networks, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB), 2015, 12(2): 276-288.
10．Wei Peng, Jianxin Wang, Weiping Wang, Qin Liu, Fang-xiang Wu, Yi Pan,Iteration method for predicting essential proteins based on orthology and protein-protein interaction networks. BMC Systems Biology,vol 6(1),pp.87, 2012
（4）知识产权
1、专利：王建新, 成颖佼, 彭玮, 李敏. 一种基于结构域特征的关键蛋白质识别方法. CN3.7
2、软件著作权：彭玮，李论，张晓丽，赵一，多生物数据分析平台V1.0，2018SR179492
3、软件著作权：张丰羽，彭玮，张晓丽，彭建军，生物信息学学术论文爬虫系统V1.0， 2018SR595031
（5）专著、教材
彭玮 ，基于随机游走模型的蛋白质网络研究，云南大学出版社，2017.8.1

主讲课程

《数据可视化技术》、《C程序设计语言》、《Java程序设计语言》

指导学生竞赛

2020年、2021年指导本科生参加大学生计算机设计大赛，获得省二等奖1项，省三等奖1项。
2017级硕士研究生张丰羽获国家奖学金
2018级硕士研究生杜杰霖、易思陈获国家奖学金