纪运恒男硕导中国科学院昆明植物研究所
电子邮件： jiyh@mail.kib.ac.cn
通信地址： 昆明市蓝黑路132号
邮政编码： 650201

研究领域



（1）重要药用类群——重楼属的专著性研究
重楼属是一个具重要药用价值的植物类群，在我国有着悠久的药用历史，也是是 “云南白药”、“宫血宁”和“季德胜蛇药片”等著名商品药的主要原料。长期以来，重楼属的分类及系统发育一直存在诸多的问题和争论。针对这些问题和争论，采用分子系统学和系统发育基因组学等方面手段，对重楼属展开了全面的专著性研究。将重楼属划分为5个组，描述并发表了多个新分类群；发现种间杂交可能在重楼属的物种形成中发挥重要作用；提出了重楼属植物应在渐新世早期起源于东亚北纬35度附近地区，随着东亚季风气候的形成，逐步向南扩散并进入到中国的亚热带地区的假说。在此基础上综合形态学与分子证据，对重楼属植物进行了全面的分类修订。相关研究成果发表在Annals of Botany, BMC Plant Biology, Frontiers in Plant Science、Fitoterapia、Phytotaxa等期刊上。重楼属世界性专著“A Monograph of Paris (Melanthiaceae)”于2020年由国际知名学术出版机构Springer出版。


（2）"3E"植物类群的进化与保育
除了重楼属外，还对人参属Panax、三尖杉属Cephalotaxus、延龄草属Trillium、天门冬科Asparagaceae、水生被子植物等“3E”（economically important, endangered, endemic）植物类群开展了系统发育基因组学和比较基因组学研究，旨在对物种保护、资源开发、可持续利用提供理论依据。研究成果在Molecular Ecology Resources, Conservation Genetics Resources, Frontiers in Plant Science、BMC Plant Biology、Annals of Botany等期刊。
（3）植物分类学
专长于黑药花科、天门冬科、人参属等类群及水生被子植物分类、鉴定，熟悉植物学拉丁文和国际植物命名法规。对云南高原湖泊及湿地水生植物进行过系统的调查与采集，参与了《云南湿地》专著中水生植物部分的编写。多次参加高黎贡山、横断山等地区及苍山、大山包等国家级自然保护区生物多样性调查工作，采集并鉴定了大量的植物标本，有丰富的野外工作和组织大规模植物资源考察的经验。
（4）生物地理学
中国亚热带地区因保存了诸多的北极-第三纪孑遗成分（Arcto-Tertiary relicts，如珙桐、银杏、银杉等）而在植物区系特征上表现出显著的古特有性，这种古特有性何时开始形成？其发展与演化与东亚晚第三纪以来的气候变化（如晚第三纪全球变冷、东亚季风气候的形成、第四纪冰期）有何联系？这些问题迄今尚未得到圆满的解决。我们结合化石和分子证据，对水青树、珙桐等北极-第三纪孑遗植物的演化历史进行了分析，初步发现这些孑遗植物在第四纪冰期来临之前即已迁移到中国亚热带地区，表明该地区植物区系早在晚第三纪就形成了古特有性的雏形。阶段性成果发表在Journal of Biogeography、American Journal of Botany、Frontiers in Plant Science等期刊上。







招生信息
招生专业 071001-植物学

招生方向 植物系统学，植物分类学，进化生态学，保护遗传学，植物资源学


工作经历


1995年7月—1997年9月：四川省会理县民族中学，中学二级教师
2000年8月—今：中国科学院昆明植物研究所，历任研究实习员、助理研究员、副研究员、研究员（2011年1月任研究组长）







社会兼职 2020-11-30-今,国际植物学期刊BMC Plant Biology编委, Associate Editor
2018-12-31-2022-12-31,九三学社中央委员会科普工作委员会, 委员


专利与奖励

出版信息

论文
[1] Ji YH*, Yang LF, Chase MW, Liu CK, Yang ZY, Yang J, Yang JB, Yi TS. 2019. Plastome phylogenomics, biogeography, and clade diversification of Paris (Melanthiaceae). BMC Plant Biology, 19: 543.
[2] Ji YH*, Liu CK, Yang ZY, Yang LF, He ZS, Wang HC, Yang JB, Yi TS. 2019. Testing and using complete plastomes and ribosomal DNA sequences as the next generation DNA barcodes in Panax (Araliaceae). Molecular Ecology Resources 19: 1333~1345.
[3] Yang LF, Yang ZY, Liu CK, He ZS, Zhang ZR, Yang J, Liu HY, Yang JB, Ji YH*. 2019. Chloroplast phylogenomic analysis provides insights into the evolution of the largest eukaryotic genome holder, Paris japonica (Melanthiaceae). BMC Plant Biology 19: 293.
[4] Zhang X, Deng T, Moore MJ, Ji YH, Li N, Zhang HJ, Meng AP, Wang HC, Sun YX, Sun H. 2019. Plastome phylogenomics of Saussurea (Asteraceae: Cardueae). BMC Plant Biology 19: 230.
[5] Yang ZY, Yang LF, Liu CK, Qin XJ, Liu HY, Chen JH, Ji YH*. 2019. Transcriptome analyses of Paris polyphylla var. chinensis, Ypsilandra thibetica, and Polygonatum kingianum characterize their steroidal saponin biosynthesis pathway. Fitoterapia 135: 52~63.
[6] Yang ZY, Yang CJ, Ji YH*. 2019. Paris variabilis (Melanthiaceae), a new species from southwestern China. Phytotaxa 401: 190~198.
[7] Jiu CK, Liu LL, Jin Lei, Yang ZY, Ji YH*. 2019. Characterization of the whole plastome of Dipentodon Sinicus (Dipentodontaceae). Motochondrial DNA Part B 4: 3149~3150.
[8] Liu CK, Yang LF, Yang ZY, Ji YH*. 2019. Complete plastome of Toricellia tilifolia (Toricelliaceae), a relict plant. Motochondrial DNA Part B 4: 1535~1536.
[9] Liu CK, Yang LF, Yang ZY, Ji YH*. 2019. Complete chloroplast genome of the economically important crop, Amorphophallus konjac (Araceae). Motochondrial DNA Part B 4: 1097~1098.
[10] Liu CK, Yang ZY, Yang LF, Yang JB, Ji YH*. 2018. The Complete Plastome of Panax stipuleanatus: Comparative and Phylogenetic Analyses of the Genus Panax (Araliaceae). Plant Diversity 40: 265~276.
[11] Shi YC, Yang LF, Yang ZY, Ji YH^*. 2018. The complete chloroplast genome of Pleione bulbocodioides (Orchidaceae). Conservation Genetics Resources 10: 21~25. (SCI)
[12] Lu TX, Shu T, Qin XJ, Ni W, Ji YH, Chen QR, Zhao Q, Liu HY. 2017. Spirostanol saponins from Ypsilandra parviflora induce platelet aggregation. Steroids 123: 55~60
[13] Yang ZY, Ji YH^*. 2017. Comparative and phylogenetic analyses of the complete chloroplast genomes of three Arcto-Tertiary relicts: Camptotheca acuminata, Davidia involucrata, and Nyssa sinensis. Frontier in Plant Science 8: 1536. doi.org/10.3389/fpls.2017.01536
[14] Qin XJ, Si YA, Chen Y, Liu H, Ni W, Yan H, Shu T, Ji YH, Liu HY. 2017. Cytotoxic steroidal saponins from Trillium kamtschaticum. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 67: 2267~2273.
[15] Ji YH^*, Yang CJ, Huang YL. 2017. A new species of Paris sect. Axiparis (Melanthiaceae) from Yunnan, China. Phytotaxa 306: 234~236.
[16] Huang YL, Li XJ, Yang ZY, Yang CJ, Yang JB, Ji YH*. 2016. Analysis of complete chloroplast genome sequences improves phylogenetic resolution of Paris (Melanthiaceae). Frontier in Plant Science 7: 1797. doi: 10.3389/fpls.2016.01797
[17] Li XJ, Huang YL, Yang ZY, and Ji YH*. 2015. Complete chloroplast genome of the medicinal plant Paris polyphylla var. chinensis (Melanthiaceae). Journal of Tropical and Subtropical Botany 23: 601~613.
[18] Lu RR, Yang ZY, Tao CC, Chen ST, and Ji YH*. 2014. Microsatellite primer development for Ottelia accuminata (Hydrocharitaceae), a submerged macrophyte endemic to southwestern China. Guihaia 34: 34-37.
[19] Sun YX, Moore MJ, Yue LL, Feng T, Chu HJ, Chen ST, Ji YH, Wang HC, Li JQ. 2014. Chloroplast phylogeography of the East Asian Arcto-Tertiarny relic Tetracentron sinensis (Trochodendraceae). Journal of Biogeography 41: 1721~1732.
[20] Yang ZY, Lu RR, Tao CC, Chen ST, and Ji YH*. 2012. Microsatellites for Tetracentron sinense (Trochodendraceae), a tertiary relict endemic to East Asia. American Journal of Botany 99: e230-232.
[21] Tao CC, Yang ZY, Lu RR, Liu T, Ji YH*, and Chen ST. 2012. Microsatellite markers for the relictual dove tree, Davidia involucrata (Cornaceae). American Journal of Botany 99: e108~110. (SCI, IF=2.811)
[22] Liu T, and Ji YH*. 2012. Molecular authentication of the medicinal plant Paris polyphylla Smith var. yunnanensis (Melanthiaceae) and its related species by polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Journal of Medicinal Plants Research. 6: 1181~1186.
[23] Chen ST, Wu XY, Ji YH*, and Yang JB. 2011. Isolation and characterization of microsatellite loci in Pistacia weinmannifolia (Anacardiaceae). International Journal of Molecular Sciences 12: 7818~7823.
[24] Dao ZL, Ji YH, Liu T, Liu KM, and Li H. 2011. Development of ten polymorphic microsatellite loci for Fosbergia shweliensis (Rubiaceae), a crisis endangered tree. American Journal of Botany 98: e161~163
[25] Yang Y, Zhai YH, Liu T, Zhang FM, and Ji YH*. 2011. Detection of Valeriana jatamansi as an adulterant of medicinal Paris by length variation of chloroplast psbA-trnH region. Planta Medica 77: 87~91, 2011.
[26] 翟艳红，杨莹，星耀武，纪运恒，周浙昆, 云贵高原多星韭二倍体—四倍体分布格局研究, 植物科学学报 29: 43～49, 2011
[27] Zhang FM, Su T, Yang Y, Zhai YH, Ji YH*, and Chen ST. 2010., Development of seven novel EST-SSR makers from Cycas panzhihuaensis (Cycadaceae). American Journal of Botany 97: e159~162.
[28] Liu T, and Ji YH. 2009. PsbA-trnH sequence analysis from chloroplast on medicinal plants of Artemisia (Asteraceae). Chinese Agricultural Science Bulletin 25: 46~49.
[29] 李嵘，纪运恒，刀志灵，李恒. 2008. 高黎贡山东西坡种子植物区系的比较研究. 云南植物研究30: 129~138.
[30] 李嵘，刀志灵，纪运恒，李恒. 2007. 高黎贡山北段种子植物区系. 云南植物研究29: 601~615.
[31] 陈文允，纪运恒，邓敏，陈绍田，周浙昆. 2007. 西畴青冈—贵州壳斗科一新记录种. 云南植物研究 29：395~396.
[32] Ji YH, Zhou ZK, and Li H. 2007. Four new synonyms in the genus Paris (Trilliaceae). Acta Phytotaxonomica Sinica 46: 388~390.
[33] Dao ZL, Chen ST, Ji YH, and Li H. 2007. Typhonium baoshanense Z. L. Dao & H. Li, a new species of Araceae from western Yunnan,China. Acta Phytotaxonomica Sinica 45: 234~238.
[34] Ji YH, Li H, and Zhou ZK. 2006. Paris caobangensis (Trilliaceae), a new species from northernVietnam. Acta Phytotaxonomica Sinica 44: 699~702.
[35] Ji YH, Zhou ZK, and Li H. 2006. Paris xichougensis, a new combination of Trilliaceae. Acta Phytotaxonomica Sinica 44: 612~613.
[36] Ji YH, Fritsch PW, Li H, Xiao TJ, and Zhou ZK, 2006. Phylogeny and classification of Paris (Melanthiaceae) inferred from DNA sequence data. Annals of Botany 98: 245~256.
[37] Ji YH, Li H, and Xu ZF. 2004. Arisaema menglaense (Araceae: Arisaemateae), a new species from southern Yunnan,China. Annales Botanici Fennici 41：133~135.
[38] Ji YH, Luo P, Pei SJ, and Xu JC. 2000. Traditional utilization of Chinese chellera (Stellera chamaejasme L.) in northwest Yunnan,China. Ethnobotany 12: 23~26.
专著
Ji YH, 2020. A Monograph of Paris (Melanthiaceae). Singapore, Springer; Beijing, Science Press.