1998年我院经国务院学位办批准获得硕士学位授予权，面向全国招收硕士研究生。现有金融学（含：保险）、会计学、区域经济学、财政学、统计学等7个专业点，27个不同的研究方向，其中金融专业5个（货币理论与实践、金融业务与管理、国际金融、保险学、证券市场与投资银行）、会计专业3个（财务会计、会计理论、成本管理会计）、区域经济学专业5个（区域经济理论与政策、区域资源开发与综合利用、新疆经济问题研究、区域可持续发展研究、西部开发研究）、政治经济学专业4个（微观经济行为研究、宏观经济理论与政策、社会主义市场经济理论与实践、现代经济发展研究）、企业管理专业4个（企业战略管理、企业财务管理、市场营销、人力资源开发与管理）、财政学专业3个（财政政策与经济发展、财政投融资理论、税制改革与税制完善）、统计学专业3个（经济管理统计、证券投资统计分析、国民经济核算）。

　　学院遴选了54名有造诣、科研强、教学效果好的老、中、青学术带头人为硕士研究生导师。他们充分发挥自己的学术专长，紧跟时代，吸纳新知，指导学生进行科学钻研，效果显著。目前我院在校研究生141余名，他们学习刻苦、努力，在导师的指导下专业知识不断扩充、研究能力不断增强。今年第二批研究生将走向社会。